Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00275
• Subject: NM_001204746.2
• Aligned Length: 2487
• Identities: 2196
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCCCTGCCTGGCTGTGGCTGCTTTGTGTCTCCGTCCCCCAGGCTCTCCCCAAGGCCCAGCCTGCAGAGCT  74

Query   75  GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTGTGGAAGTTCCAGAAAACTATGGTGGAAATTTCCCTTTATACCTGACCAAGTTGCCGCTGCCCCGTGAGG  148

Query  149  GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCTGAAGGCCAGATCGTGCTGTCAGGGGACTCAGGCAAGGCAACTGAGGGCCCATTTGCTATGGATCCAGAT  222

Query  223  TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGGCTTCCTGCTGGTGACCAGGGCCCTGGACCGAGAGGAGCAGGCAGAGTACCAGCTACAGGTCACCCTGGA  296

Query  297  GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAATGACCAGGTGC  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  297  GATGCAGGATGGACATGTCTTGTGGGGTCCACAGCCTGTGCTTGTGCACGTGAAGGATGAGAA-----------  359

Query  371  CCCATTTCTCTCAAGCCATCTACAGAGCTCGGCTGAGCCGGGGTACCAGGCCTGGCATCCCCTTCCTCTTCCTT  444
                                                                                      
Sbjct  360  --------------------------------------------------------------------------  359

Query  445  GAGGCTTCAGACCGGGATGAGCCAGGCACAGCCAACTCGGATCTTCGATTCCACATCCTGAGCCAGGCTCCAGC  518
                                                                                      
Sbjct  360  --------------------------------------------------------------------------  359

Query  519  CCAGCCTTCCCCAGACATGTTCCAGCTGGAGCCTCGGCTGGGGGCTCTGGCCCTCAGCCCCAAGGGGAGCACCA  592
                                                                                      
Sbjct  360  --------------------------------------------------------------------------  359

Query  593  GCCTTGACCACGCCCTGGAGAGGACCTACCAGCTGTTGGTACAGGTCAAGGACATGGGTGACCAGGCCTCAGGC  666
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  360  ----------------------------------------------------------TGACCAGGCCTCAGGC  375

Query  667  CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  376  CACCAGGCCACTGCCACCGTGGAAGTCTCCATCATAGAGAGCACCTGGGTGTCCCTAGAGCCTATCCACCTGGC  449

Query  741  AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  450  AGAGAATCTCAAAGTCCTATACCCGCACCACATGGCCCAGGTACACTGGAGTGGGGGTGATGTGCACTATCACC  523

Query  815  TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524  TGGAGAGCCATCCCCCGGGACCCTTTGAAGTGAATGCAGAGGGAAACCTCTACGTGACCAGAGAGCTGGACAGA  597

Query  889  GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  GAAGCCCAGGCTGAGTACCTGCTCCAGGTGCGGGCTCAGAATTCCCATGGCGAGGACTATGCGGCCCCTCTGGA  671

Query  963  GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  672  GCTGCACGTGCTGGTGATGGATGAGAATGACAACGTGCCTATCTGCCCTCCCCGTGACCCCACAGTCAGCATCC  745

Query 1037  CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  CTGAGCTCAGTCCACCAGGTACTGAAGTGACTAGACTGTCAGCAGAGGATGCAGATGCCCCCGGCTCCCCCAAT  819

Query 1111  TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  TCCCACGTTGTGTATCAGCTCCTGAGCCCTGAGCCTGAGGATGGGGTAGAGGGGAGAGCCTTCCAGGTGGACCC  893

Query 1185  CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  CACTTCAGGCAGTGTGACGCTGGGGGTGCTCCCACTCCGAGCAGGCCAGAACATCCTGCTTCTGGTGCTGGCCA  967

Query 1259  TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  TGGACCTGGCAGGCGCAGAGGGTGGCTTCAGCAGCACGTGTGAAGTCGAAGTCGCAGTCACAGATATCAATGAT  1041

Query 1333  CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  CACGCCCCTGAGTTCATCACTTCCCAGATTGGGCCTATAAGCCTCCCTGAGGATGTGGAGCCCGGGACTCTGGT  1115

Query 1407  GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  GGCCATGCTAACAGCCATTGATGCTGACCTCGAGCCCGCCTTCCGCCTCATGGATTTTGCCATTGAGAGGGGAG  1189

Query 1481  ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  ACACAGAAGGGACTTTTGGCCTGGATTGGGAGCCAGACTCTGGGCATGTTAGACTCAGACTCTGCAAGAACCTC  1263

Query 1555  AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264  AGTTATGAGGCAGCTCCAAGTCATGAGGTGGTGGTGGTGGTGCAGAGTGTGGCGAAGCTGGTGGGGCCAGGCCC  1337

Query 1629  AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338  AGGCCCTGGAGCCACCGCCACGGTGACTGTGCTAGTGGAGAGAGTGATGCCACCCCCCAAGTTGGACCAGGAGA  1411

Query 1703  GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412  GCTACGAGGCCAGTGTCCCCATCAGTGCCCCAGCCGGCTCTTTCCTGCTGACCATCCAGCCCTCCGACCCCATC  1485

Query 1777  AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1486  AGCCGAACCCTCAGGTTCTCCCTAGTCAATGACTCAGAGGGCTGGCTCTGCATTGAGAAATTCTCCGGGGAGGT  1559

Query 1851  GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560  GCACACCGCCCAGTCCCTGCAGGGCGCCCAGCCTGGGGACACCTACACGGTGCTTGTGGAGGCCCAGGATACAG  1633

Query 1925  ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634  ATGAGCCGAGACTGAGCGCTTCTGCACCCCTGGTGATCCACTTCCTAAAGGCCCCTCCTGCCCCAGCCCTGACT  1707

Query 1999  CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1708  CTTGCCCCTGTGCCCTCCCAATACCTCTGCACACCCCGCCAAGACCATGGCTTGATCGTGAGTGGACCCAGCAA  1781

Query 2073  GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782  GGACCCCGATCTGGCCAGTGGGCACGGTCCCTACAGCTTCACCCTTGGTCCCAACCCCACGGTGCAACGGGATT  1855

Query 2147  GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856  GGCGCCTCCAGACTCTCAATGGTTCCCATGCCTACCTCACCTTGGCCCTGCATTGGGTGGAGCCACGTGAACAC  1929

Query 2221  ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1930  ATAATCCCCGTGGTGGTCAGCCACAATGCCCAGATGTGGCAGCTCCTGGTTCGAGTGATCGTGTGTCGCTGCAA  2003

Query 2295  CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004  CGTGGAGGGGCAGTGCATGCGCAAGGTGGGCCGCATGAAGGGCATGCCCACGAAGCTGTCGGCAGTGGGCATCC  2077

Query 2369  TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078  TTGTAGGCACCCTGGTAGCAATAGGAATCTTCCTCATCCTCATTTTCACCCACTGGACCATGTCAAGGAAGAAG  2151

Query 2443  GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC  2487
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152  GACCCGGATCAACCAGCAGACAGCGTGCCCCTGAAGGCGACTGTC  2196