Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00590
• Subject: XM_011535656.2
• Aligned Length: 1516
• Identities: 1175
• Gaps: 341

Alignment

Query    1  ATGAGCAACATCTGTCAGAGGCTCTGGGAGTACCTAGAACCCTATCTCCCCTGTTTGTCCACGGAGGCAGACAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTCAACCGTGATTGAAAATCCAGGGGCCCTTTGCTCTCCCCAGTCACAGAGGCATGGCCACTACTTTGTGGCTT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGTTTGATTACCAGGCTCGGACTGCTGAGGACTTGAGCTTCCGAGCAGGTGACAAACTTCAAGTTCTGGACACT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTGCATGAGGGCTGGTGGTTTGCCAGACACTTGGAGAAAAGACGAGATGGCTCCAGTCAGCAACTACAAGGCTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TATTCCTTCTAACTACGTGGCTGAGGACAGAAGCCTACAGGCA-GAGCCGTGGTTCTTTGGAGCAATCGGAAGA  369
                                                      | |||  |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------ATGAG--GTGGTTCTTTGGAGCAATCGGAAGA  30

Query  370  TCAGATGCAGAGAAACAACTATTATATTCAGAAAACAAGACCGGTTCCTTTCTAATCAGAGAAAGTGAAAGCCA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  TCAGATGCAGAGAAACAACTATTATATTCAGAAAACAAGACCGGTTCCTTTCTAATCAGAGAAAGTGAAAGCCA  104

Query  444  AAAAGGAGAATTCTCTCTTTCAGTTTTAGATGGAGCAGTTGTAAAACACTACAGAATTAAAAGACTGGATGAAG  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  105  AAAAGGAGAATTCTCTCTTTCAGTTTTAGATGGAGCAGTTGTAAAACACTACAGAATTAAAAGACTGGATGAAG  178

Query  518  GGGGATTTTTTCTCACGCGAAGAAGAATCTTTTCAACACTGAACGAATTTGTGAGCCACTACACCAAGACAAGT  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  GGGGATTTTTTCTCACGCGAAGAAGAATCTTTTCAACACTGAACGAATTTGTGAGCCACTACACCAAGACAAGT  252

Query  592  GACGGCCTGTGTGTCAAGCTGGGGAAACCATGCTTAAAGATCCAGGTCCCAGCTCCATTTGATTTGTCGTATAA  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  253  GACGGCCTGTGTGTCAAGCTGGGGAAACCATGCTTAAAGATCCAGGTCCCAGCTCCATTTGATTTGTCGTATAA  326

Query  666  AACCGTGGACCAATGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTCTGAAGCGATTGGGATCTGGTCAGTTTGGCG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  327  AACCGTGGACCAATGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTCTGAAGCGATTGGGATCTGGTCAGTTTGGCG  400

Query  740  AAGTATGGGAAGGTCTGTGGAACAATACCACTCCAGTAGCAGTGAAAACATTAAAACCAGGTTCAATGGATCCA  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  401  AAGTATGGGAAGGTCTGTGGAACAATACCACTCCAGTAGCAGTGAAAACATTAAAACCAGGTTCAATGGATCCA  474

Query  814  AATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAACCTAAGACATCCAAAGCTTATCCAGCTTTATGCTGTTTG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  475  AATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAACCTAAGACATCCAAAGCTTATCCAGCTTTATGCTGTTTG  548

Query  888  CACTTTAGAAGATCCAATTTATATTATTACAGAGTTGATGAGACATGGAAGTCTGCAAGAATATCTCCAAAATG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  549  CACTTTAGAAGATCCAATTTATATTATTACAGAGTTGATGAGACATGGAAGTCTGCAAGAATATCTCCAAAATG  622

Query  962  ACACTGGATCAAAAATCCATCTGACTCAACAGGTAGACATGGCGGCACAGGTTGCCTCTGGAATGGCCTATCTG  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  623  ACACTGGATCAAAAATCCATCTGACTCAACAGGTAGACATGGCGGCACAGGTTGCCTCTGGAATGGCCTATCTG  696

Query 1036  GAGTCTCGGAACTACATTCACAGAGATCTGGCTGCCAGAAATGTCCTCGTTGGTGAACATAATATCTACAAAGT  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  697  GAGTCTCGGAACTACATTCACAGAGATCTGGCTGCCAGAAATGTCCTCGTTGGTGAACATAATATCTACAAAGT  770

Query 1110  AGCAGATTTTGGACTTGCCAGAGTTTTTAAGGTAGATAATGAAGACATCTATGAATCTAGACACGAAATAAAGC  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  771  AGCAGATTTTGGACTTGCCAGAGTTTTTAAGGTAGATAATGAAGACATCTATGAATCTAGACACGAAATAAAGC  844

Query 1184  TGCCGGTGAAGTGGACTGCGCCCGAAGCCATTCGTAGTAATAAATTCAGCATTAAGTCCGATGTATGGTCATTT  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  845  TGCCGGTGAAGTGGACTGCGCCCGAAGCCATTCGTAGTAATAAATTCAGCATTAAGTCCGATGTATGGTCATTT  918

Query 1258  GGAATCCTTCTTTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATGCCTTACAGTGGTATGACAGGTGCCCAGGTAATCCA  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  919  GGAATCCTTCTTTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATGCCTTACAGTGGTATGACAGGTGCCCAGGTAATCCA  992

Query 1332  GATGTTGGCTCAAAACTATAGACTTCCGCAACCATCCAACTGTCCACAGCAATTTTACAACATCATGTTGGAGT  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  GATGTTGGCTCAAAACTATAGACTTCCGCAACCATCCAACTGTCCACAGCAATTTTACAACATCATGTTGGAGT  1066

Query 1406  GCTGGAATGCAGAGCCTAAGGAACGACCTACATTTGAGACACTGCGTTGGAAACTTGAAGACTATTTTGAAACA  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067  GCTGGAATGCAGAGCCTAAGGAACGACCTACATTTGAGACACTGCGTTGGAAACTTGAAGACTATTTTGAAACA  1140

Query 1480  GACTCTTCATATTCAGATGCAAATAACTTCATAAGA  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141  GACTCTTCATATTCAGATGCAAATAACTTCATAAGA  1176