Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00760
- Subject:
- XM_005268822.3
- Aligned Length:
- 2010
- Identities:
- 1794
- Gaps:
- 216
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCGCCCCTGCGGTGCAGAGCAGCTCAGGGCCGGCTGGTGCGCGACCCCGGAAAGCGGGGGTGGAGAGGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGCGGAGCCCGCGGGGCCAGGCCTCCACCATGGACAGAGGCCAGGCCCTGCCCCTCCCAGGCAGCCTGGCTCCT 148
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGCCC 6
||||||
Sbjct 149 TCTGCTGGGCCCTGAAGGCAGACGGGATAATGTGGTTGGCCAAGGCCTGTTGGTCCATCCAGAGTGAGATGCCC 222
Query 7 TGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGAC 80
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGAC 296
Query 81 CCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCA 154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCA 370
Query 155 GCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAG 228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAG 444
Query 229 CCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTT 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTT 518
Query 303 CAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCT 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCT 592
Query 377 CCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAG 666
Query 451 CTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGA 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGA 740
Query 525 GCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCC 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCC 814
Query 599 CCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTAT 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTAT 888
Query 673 TCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACC 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACC 962
Query 747 CGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACG 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACG 1036
Query 821 CTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAAC 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAAC 1110
Query 895 GCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCG 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCG 1184
Query 969 CTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCC 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCC 1258
Query 1043 GGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACAC 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACAC 1332
Query 1117 CTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAA 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAA 1406
Query 1191 GGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGG 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGG 1480
Query 1265 AGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTC 1338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTC 1554
Query 1339 TTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACA 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACA 1628
Query 1413 CCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCT 1486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCT 1702
Query 1487 TGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAG 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAG 1776
Query 1561 CCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGA 1634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGA 1850
Query 1635 GCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCC 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCC 1924
Query 1709 TGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGAC 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGAC 1998
Query 1783 ACGCTGCCCTTC 1794
||||||||||||
Sbjct 1999 ACGCTGCCCTTC 2010