Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00760
- Subject:
- XM_017019247.1
- Aligned Length:
- 1806
- Identities:
- 1794
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ------------ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCT 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAAGAGGAGATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCT 74
Query 63 GGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTG 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTG 148
Query 137 CCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAG 210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAG 222
Query 211 CTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTC 284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTC 296
Query 285 CCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAG 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAG 370
Query 359 TGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCC 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCC 444
Query 433 AGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGG 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGG 518
Query 507 CCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTC 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTC 592
Query 581 CTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTG 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTG 666
Query 655 GGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTC 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTC 740
Query 729 GGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTG 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTG 814
Query 803 CTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAG 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAG 888
Query 877 CGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAA 962
Query 951 CCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCC 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCC 1036
Query 1025 TGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACT 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACT 1110
Query 1099 TCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGT 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGT 1184
Query 1173 GCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGG 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGG 1258
Query 1247 TCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAG 1332
Query 1321 TCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTG 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTG 1406
Query 1395 CTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCT 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCT 1480
Query 1469 CAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGAC 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGAC 1554
Query 1543 CGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGT 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGT 1628
Query 1617 GGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGA 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGA 1702
Query 1691 CCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATT 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATT 1776
Query 1765 GACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC 1794
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC 1806