Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_00760
- Subject:
- XM_017316436.1
- Aligned Length:
- 1803
- Identities:
- 1548
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCC 74
|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||.||.|||||.||||||||||||.|..|.||.||
Sbjct 1 ATGCCCTGTATTCAAGCTCAATATGGAACACCAGCAACGAGCCCAGGACCGCGTGACCACCTGACCGGTGATCC 74
Query 75 CCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCC 148
||||.|||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.||..||.|.|
Sbjct 75 CCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGCCTACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGACAGCACCTGCCGCACCTGCTACAC 148
Query 149 TGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACA 222
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 149 TGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGGTACACCGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCGGGGACG 222
Query 223 GTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCA------CATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGC 290
..||||||.|||||||||||.|..|||||.|||||||||| |.|||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 223 ACCCAGCCGTGCTCCTCAGCTTGTTCCTCTGCCTCCTCCACGTCTTCTTCCTCATCCTCGGCCACCTCCCCCGC 296
Query 291 CTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATG 364
.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|.||||
Sbjct 297 TTCGGCGTCCTTCAAGTTTGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCGGGCACCCTGAGCGGCCCATTAGATG 370
Query 365 AGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTC 438
||.||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||.||||
Sbjct 371 AGACCCTATCCTCCAGCGGCTCTGAGTACTATGGCAGTCCCTGCTCAGCCCCCTCGCCATCTACACCCAACTTC 444
Query 439 CAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCG 512
||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||..|
Sbjct 445 CAGCCGTCCCAGCTTTCTCCCTGGGACGGCTCATTTGGCCACTTCTCCCCGAGCCAGACTTATGAAGGCCTCTG 518
Query 513 GGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCT---GGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTC 583
||||||||||||||||.||||.||.||.||| |||||.||.|..||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 GGCATGGACAGAGCAGTTGCCTAAGGCTTCTTCAGGGCCTCCGCCACCTCCAACCTTCTTCTCCTTCAGTCCTC 592
Query 584 CCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGG 657
||||.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||..|||..||||||||||||||.|||
Sbjct 593 CCACTGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGTTCTCTGAAATTGTTCCCACCACCAGCCACCCACCAGCTTGGG 666
Query 658 GAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGG 731
|||||.|||||||||||||||||..|.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|||.|||....||.||
Sbjct 667 GAGGGGGAGAGCTATTCCATGCCAGCAGCTTTCCCCGGCTTGGCACCCACCTCTCCGAACCGTGACACTTCCGG 740
Query 732 GATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTG 805
.||.|||||..|||||||||||||.||||||.|||||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 741 CATTCTGGACGCACCCGTGACCTCCACCAAGTCCCGGAGCGGGGCTTCAGGTGGCAGCGAGGGCCGCTGTGCAG 814
Query 806 TGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGC 879
|.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTGTGGTGACAATGCTTCGTGTCAGCACTATGGGGTCCGCACCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGC 888
Query 880 ACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCG 953
|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 ACAGTACAGAAAAGCGCCAAGTACATCTGCCTGGCAAACAAGGATTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGGAACCG 962
Query 954 CTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGA 1027
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 963 CTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCTGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTACGGACAGACAGCCTAA 1036
Query 1028 AGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCC 1101
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1037 AAGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCTCCAGATGCCTCCCCTACCAATCTTCTCACTTCC 1110
Query 1102 CTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCT 1175
||..||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 CTCATCCGGGCACACTTGGACTCCGGGCCTAGCACTGCCAAATTGGACTATTCCAAGTTCCAGGAACTGGTGCT 1184
Query 1176 GCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCA 1249
|||||.|||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||.|||.|||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1185 GCCCCGCTTCGGGAAGGAAGATGCCGGTGACGTGCAACAATTTTATGACTTGCTCTCTGGTTCCCTGGACGTTA 1258
Query 1250 TCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCG 1323
||||.||||||||.||.||.|||||||||||...||||||.|..||.|..|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1259 TCCGAAAGTGGGCAGAAAAAATCCCTGGCTTCATTGAGCTTTGCCCAGGAGACCAAGACCTGTTGCTAGAGTCT 1332
Query 1324 GCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTC 1397
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCTTCCTGGAACTCTTCATCCTCCGCCTGGCATACCGATCTAAACCCGGTGAGGGGAAGCTCATCTTCTGCTC 1406
Query 1398 AGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAA 1471
|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||..|||||||||||||||.
Sbjct 1407 AGGCCTGGTACTACACCAGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTTGGTGATTGGATTGACAACATCCTGGCCTTCTCAC 1480
Query 1472 GGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGG 1545
|||||||||||||||||..|||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1481 GGTCCCTGCACAGCTTGGGTGTTGATGTTCCCGCCTTTGCCTGCCTGTCCGCTCTGGTCCTCATCACTGATCGA 1554
Query 1546 CATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGC 1619
||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1555 CACGGGCTCCAGGACCCTCGTCGGGTGGAAGAGCTGCAGAATCGCATTGCTAGCTGTCTGAAGGAGCACATGGC 1628
Query 1620 AGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCC 1693
..|.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1629 TACCGTGGCAGGAGACCCACAGCCGGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGCTGGGCAAACTGCCTGAGCTTCGGACCC 1702
Query 1694 TGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGAC 1767
|||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||..|.|||
Sbjct 1703 TGTGCACTCAAGGCCTGCAGCGCATCTTTTGCCTCAAGTTGGAGGACTTGGTACCCCCTCCACCTATTGTGGAC 1776
Query 1768 AAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC 1794
||||||||.||||||||..||.|.|||
Sbjct 1777 AAGATCTTTATGGACACATTGTCTTTC 1803