Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01575
• Subject: NM_009225.2
• Aligned Length: 720
• Identities: 565
• Gaps: 27

Alignment

Query   1  ATGACTGTTGGCAAGAGTAGCAAGATGCTGCAGCACATTGACTATAGAATGAGATGTATCCTGCAAGATGGCCG  74
           |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct   1  ATGACGGTGGGCAAGAGCAGCAAGATGCTGCAGCACATTGACTACAGGATGAGGTGCATCCTGCAGGACGGCCG  74

Query  75  AATCTTCATTGGCACCTTTAAGGCTTTTGACAAGCATATGAATTTGATCCTCTGTGATTGTGATGAGTTCAGAA  148
           .||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  75  CATCTTCATCGGGACCTTCAAAGCCTTTGACAAGCACATGAACTTGATCCTGTGTGACTGTGATGAGTTCAGGA  148

Query 149  AGATCAAGCCAAAGAATGCGAAGCAACCAGAGCGTGAAGAAAAGCGGGTTTTGGGTCTGGTGTTGCTGCGTGGG  222
           ||||||||||||||||..|.||.|||.||||..|.|||||.|||||.||..|.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149  AGATCAAGCCAAAGAACTCCAAACAAGCAGAAAGGGAAGAGAAGCGAGTCCTTGGTCTGGTGTTGCTTCGAGGG  222

Query 223  GAGAACTTGGTATCCATGACTGTGGAGGGGCCACCCCCCAAAGATACTGGCATTGCTCGGGTACCACTTGCTGG  296
           ||||||.||||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 223  GAGAACCTGGTCTCCATGACAGTAGAAGGACCTCCTCCCAAAGATACTGGCATTGCCCGAGTGCCACTTGCTGG  296

Query 297  AGCTGCTGGAGGCCCTGGGGTTGGTAGGGCAGCTGGTAGAGGAGTACCAGCTGGTGTGCCAATTCCCCAGGCCC  370
           |||||||||.||.||.||..|.||.|||||.|||||.||||||.|.||.||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 297  AGCTGCTGGGGGGCCAGGCATCGGCAGGGCTGCTGGCAGAGGAATCCCGGCTGGTGTTCCTATGCCCCAGGCTC  370

Query 371  CTGCTGGATTGGCAGGCCCTGTCCGAGGAGTTGGGGGACCATCCCAGCAGGTAATGACTCCACAGGGAAGAGGC  444
           ||||.|||.|.||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371  CTGCAGGACTTGCTGGGCCAGTCCGAGGTGTTGGAGGGCCATCCCAACAGGTGATGACCCCACAAGGAAGAGGC  444

Query 445  ACTGTAGCAGCTGCTGCTGTTGCTGCGACTGCCAGTATTGCTGGAGCCCCAACACAGTACCCACCAGGACGGGG  518
           |||||.|||||||||||.|.|||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 445  ACTGTTGCAGCTGCTGCCGCTGCAGCCACAGCCAGTATTGCAGGAGCCCCAACTCAGTACCCACCTGGTCGTGG  518

Query 519  CACTCCGCCCCCACCCGTCGGCAGAGCAACCCCACCTCCAGGCATTATGGCTCCTCCACCTGGTATGAGACCAC  592
           ...|||.||.|||||..|.|||.|||.|.||||.||||||||.||.||||..||.||.|||||.|||.|.||.|
Sbjct 519  GGGTCCTCCTCCACCTATGGGCCGAGGAGCCCCTCCTCCAGGTATGATGGGCCCACCTCCTGGCATGCGGCCTC  592

Query 593  CCATGGGCCCACCAATTGGGCTTCCCCCTGCTCGAGGGACGCCAATAGGCATGCCGCCTCCGGGAATGAGACCC  666
           |||||||.||.|||||.|||||.||.||||..|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|.||.
Sbjct 593  CCATGGGTCCCCCAATGGGGCTCCCTCCTGGCCGAGGAACTCCAATGGGCATGCCCCCTCCTGGCATGCGGCCT  666

Query 667  CCTCCACCAGGCATTAGAGGTCCACCTCCCCCAGGAATGCGTCCACCAAGACCT  720
           |||||.||||||||..||||||               |||.|            
Sbjct 667  CCTCCTCCAGGCATGCGAGGTC---------------TGCTT------------  693