Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01615
- Subject:
- XM_017023607.2
- Aligned Length:
- 1158
- Identities:
- 858
- Gaps:
- 273
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGAAGCTCCCCCACCCCCAACCCCACCCCTTCCTTCCGGAAGCAAATCTAAGTCCAGCCCCGGCTCCAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCCTCCCACAGTGGACCTAGGAAACCCTCAGCTCAGAGAACAACCCTGCATTCCCCACACAACACCCACAATC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGCCACTGCGGGCGAGGAGGGCACGAGGCCAGGTTCCCAAGAGCTCAGCTCTGGCCCCTAGTAGCAGCTCAGTT 222
Query 1 ---------------------------------------------------ATGGAGCTGATCCAGGACATCTC 23
|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 223 CCTCAATGGGCCGTGTTTGTCCTGGAGCCCAGATGGACTGTGGCCAGGAACATGGAGCTGATCCAGGACACCTC 296
Query 24 TCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA 97
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA 370
Query 98 GCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACCACCTGGGTGAGCCAGATT 171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 371 GCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACTACCTGGGTAAGCCAGATT 444
Query 172 CTGGACATGATCTACCAGGGCGGTGACCTGGAAAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCTTCCT 245
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGACATGATCTACCAGGGTGGTGACCTGGAGAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCTTCCT 518
Query 246 TGAGTTCAAAGTCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAAACACACCAGCCCCACGACTCCTGAAGA 319
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAGTTCAAAGCCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAGACACACCGGCCCCACGACTCCTGAAGA 592
Query 320 CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGCAAC 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGCAAC 666
Query 394 GCAAAGGATGTGGCGGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAAGTGTACCCTCACCCTGGGACCTGGGA 467
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|.||||||||||||||
Sbjct 667 GCAAAGGATGTGGCAGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAGGTGCACCCTGAGCCTGGGACCTGGGA 740
Query 468 AAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGCTGGAGAAGTGTCCTATGGGTCCTGGTACCAGCACGTGCAAGAGTGGTGGG 541
.||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 CAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGTCGGAGAAGTGTCCTACGGATCCTGGTACCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGG 814
Query 542 AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCCAAAAGGGAGATTCAA 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCGAAAAGGGAGATTCAA 888
Query 616 AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACTGTGGACCTCATGGTTGAGCACACGTCGTTCAA 689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACCGTGGACTTCGTGGTTCAGCACACGTCGTTCAA 962
Query 690 GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCGCCGGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT 763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCCCCAGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT 1036
Query 764 TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC 1110
Query 838 TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG 1158