Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01615
Subject:
XM_017023607.2
Aligned Length:
1158
Identities:
858
Gaps:
273

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGAAGCTCCCCCACCCCCAACCCCACCCCTTCCTTCCGGAAGCAAATCTAAGTCCAGCCCCGGCTCCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCCTCCCACAGTGGACCTAGGAAACCCTCAGCTCAGAGAACAACCCTGCATTCCCCACACAACACCCACAATC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCCACTGCGGGCGAGGAGGGCACGAGGCCAGGTTCCCAAGAGCTCAGCTCTGGCCCCTAGTAGCAGCTCAGTT  222

Query    1  ---------------------------------------------------ATGGAGCTGATCCAGGACATCTC  23
                                                               |||||||||||||||||||.|||
Sbjct  223  CCTCAATGGGCCGTGTTTGTCCTGGAGCCCAGATGGACTGTGGCCAGGAACATGGAGCTGATCCAGGACACCTC  296

Query   24  TCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA  97
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA  370

Query   98  GCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACCACCTGGGTGAGCCAGATT  171
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  371  GCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACTACCTGGGTAAGCCAGATT  444

Query  172  CTGGACATGATCTACCAGGGCGGTGACCTGGAAAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCTTCCT  245
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGACATGATCTACCAGGGTGGTGACCTGGAGAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCTTCCT  518

Query  246  TGAGTTCAAAGTCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAAACACACCAGCCCCACGACTCCTGAAGA  319
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGTTCAAAGCCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAGACACACCGGCCCCACGACTCCTGAAGA  592

Query  320  CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGCAAC  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGCAAC  666

Query  394  GCAAAGGATGTGGCGGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAAGTGTACCCTCACCCTGGGACCTGGGA  467
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|.||||||||||||||
Sbjct  667  GCAAAGGATGTGGCAGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAGGTGCACCCTGAGCCTGGGACCTGGGA  740

Query  468  AAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGCTGGAGAAGTGTCCTATGGGTCCTGGTACCAGCACGTGCAAGAGTGGTGGG  541
            .||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  CAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGTCGGAGAAGTGTCCTACGGATCCTGGTACCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGG  814

Query  542  AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCCAAAAGGGAGATTCAA  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCGAAAAGGGAGATTCAA  888

Query  616  AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACTGTGGACCTCATGGTTGAGCACACGTCGTTCAA  689
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACCGTGGACTTCGTGGTTCAGCACACGTCGTTCAA  962

Query  690  GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCGCCGGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT  763
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCCCCAGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT  1036

Query  764  TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC  1110

Query  838  TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG  1158