Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01615
• Subject: XR_001751973.1
• Aligned Length: 1358
• Identities: 858
• Gaps: 473

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATCCCTCCCACAGTGGACCTAGGAAACCCTCAGCTCAGAGAACAACCCTGCATTCCCCACACAACACCCACAAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAGCCACTGCGGGCGAGGAGGGCACGAGGCCAGGTTCCCAAGAGCTCAGCAGCTCTGGCCCCTAGTAGCAGCTC  148

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGAGCTGATCCAGGACA  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTTCCTCAATGGGCCGTGTTTGTCCTGGAGCCCAGATGGACTGTGGCCAGGAACATGGAGCTGATCCAGGACA  222

Query   20  TCTCTCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTG  93
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCCCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTG  296

Query   94  CAGAGCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACCACCTGGGTGAGCCA  167
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  297  CAGAGCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACTACCTGGGTAAGCCA  370

Query  168  GATTCTGGACATGATCTACCAGGGCGGTGACCTGGAAAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCT  241
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GATTCTGGACATGATCTACCAGGGTGGTGACCTGGAGAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCT  444

Query  242  TCCTTGAGTTCAAAGTCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAAACACACCAGCCCCACGACTCCTG  315
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||
Sbjct  445  TCCTTGAGTTCAAAGCCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAGACACACCGGCCCCACGACTCCTG  518

Query  316  AAGACACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCG  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGACACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCG  592

Query  390  CAACGCAAAGGATGTGGCGGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAAGTGTACCCTCACCCTGGGACCT  463
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|.||||||||||
Sbjct  593  CAACGCAAAGGATGTGGCAGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAGGTGCACCCTGAGCCTGGGACCT  666

Query  464  GGGAAAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGCTGGAGAAGTGTCCTATGGGTCCTGGTACCAGCACGTGCAAGAGTGG  537
            ||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  667  GGGACAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGTCGGAGAAGTGTCCTACGGATCCTGGTACCAGCACGTGCAGGAGTGG  740

Query  538  TGGGAGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGG-------------------  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  741  TGGGAGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGTAATCCGAGCCTCCACT  814

Query  593  -------------------AGAACCCCAAAAGGGAGATTCAAAAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCC  647
                               |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGGGCCCTCTGCTGCTCAGAACCCGAAAAGGGAGATTCAAAAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCC  888

Query  648  AGAGGAGACTGTGGACCTCATGGTTGAGCACACGTCGTTCAAGGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACA  721
            |||||||||.||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGAGGAGACCGTGGACTTCGTGGTTCAGCACACGTCGTTCAAGGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACA  962

Query  722  CCACCGTCCGCCGGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCTTCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAG  795
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACCGTCCCCCAGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCTTCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAG  1036

Query  796  ACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGACTATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAG  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGACTATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAG  1110

Query  870  CTTCCGCTCTGAGCTG----------------------------------------------------------  885
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct 1111  CTTCCGCTCTGAGCTGTGAGAGGGGCTCCTGGAGTCACTGCAGAGGGAGTGTGCGAATCAAACCTGACCAAGCG  1184

Query  886  --------------------------------------------------------------------------  885
                                                                                      
Sbjct 1185  GCTCAAGAATAAAATATGAATTGAGGGCCCGGGACGGTAGGTCATGTCTGTAATCCCAGCAATTTGGAGGCTGA  1258

Query  886  --------------------------------------------------------------------------  885
                                                                                      
Sbjct 1259  GGTGGGAGGATCATTTGAGCCCAGGAGTTCGAGACCAACCTGGGCAACATAGTGAGATTCTGTTAAAAAAATAA  1332

Query  886  --------------------------  885
                                      
Sbjct 1333  AATAAAATAAAACCAATTTTTAAAAA  1358