Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01621
Subject:
XM_017023607.2
Aligned Length:
1158
Identities:
836
Gaps:
273

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGAAGCTCCCCCACCCCCAACCCCACCCCTTCCTTCCGGAAGCAAATCTAAGTCCAGCCCCGGCTCCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCCTCCCACAGTGGACCTAGGAAACCCTCAGCTCAGAGAACAACCCTGCATTCCCCACACAACACCCACAATC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCCACTGCGGGCGAGGAGGGCACGAGGCCAGGTTCCCAAGAGCTCAGCTCTGGCCCCTAGTAGCAGCTCAGTT  222

Query    1  ---------------------------------------------------ATGGAGCTGATCCAGGACACCTC  23
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCAATGGGCCGTGTTTGTCCTGGAGCCCAGATGGACTGTGGCCAGGAACATGGAGCTGATCCAGGACACCTC  296

Query   24  CCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA  97
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA  370

Query   98  GCTTCCAAGCCCGACCTGATGACCTGCTCATCAACACCTACCCCAAGTCTGGCACCACCTGGGTGAGCCAGATA  171
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  371  GCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACTACCTGGGTAAGCCAGATT  444

Query  172  CTGGACATGATCTACCAGGGCGGCGACCTAGAGAAGTGTAACCGGGCTCCCATCTACGTACGGGTGCCCTTCCT  245
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||.|.|.||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGACATGATCTACCAGGGTGGTGACCTGGAGAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCTTCCT  518

Query  246  TGAGGTCAATGATCCAGGGGAACCCTCAGGGCTGGAGACTCTGAAAGACACACCGCCCCCACGGCTCATCAAGT  319
            ||||.||||.|..||||||...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|.|||.
Sbjct  519  TGAGTTCAAAGCCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAGACACACCGGCCCCACGACTCCTGAAGA  592

Query  320  CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCTCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGAAAC  393
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGCAAC  666

Query  394  CCAAAGGACGTGGCGGTCTCCTACTACCATTTCCACCGTATGGAAAAGGCGCACCCTGAGCCTGGGACCTGGGA  467
            .|||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.|||..||||..||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAAAGGATGTGGCAGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAGGTGCACCCTGAGCCTGGGACCTGGGA  740

Query  468  CAGCTTCCTGGAAAAGTTCATGGCTGGAGAAGTGTCCTACGGGTCCTGGTACCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGG  541
            ||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGTCGGAGAAGTGTCCTACGGATCCTGGTACCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGG  814

Query  542  AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCCAAAAGGGAGATTCAA  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCGAAAAGGGAGATTCAA  888

Query  616  AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACCATGGACTTCATGGTTCAGCACACGTCGTTCAA  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACCGTGGACTTCGTGGTTCAGCACACGTCGTTCAA  962

Query  690  GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCCCCAGGAGCTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT  763
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCCCCAGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT  1036

Query  764  TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC  1110

Query  838  TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG  1158