Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01659
- Subject:
- NM_017489.3
- Aligned Length:
- 1317
- Identities:
- 1257
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA 74
Query 75 GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC 148
Query 149 AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT 222
Query 223 GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG 296
Query 297 CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACGATAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACGATAT 370
Query 371 ACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATT 444
Query 445 ACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAATACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAATACA 518
Query 519 GAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTCTTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTCTTTG 592
Query 593 AAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAAAGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAAAGAT 666
Query 667 ACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGT 740
Query 741 GCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGAACAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGAACAA 814
Query 815 TAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAA--- 885
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAAAGT 888
Query 886 ---------------------------------------------------------AGGTCTCACAAGAATCT 902
|||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTAGTGACAAACAGTCTGCGGTAACTGAATCCTCAGAGGGTACAGTATCCTTATTGAGGTCTCACAAGAATCT 962
Query 903 TTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACTCCTC 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACTCCTC 1036
Query 977 AAAGTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTCAAAGAGTCAGCCGGTA 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAGTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTCAAAGAGTCAGCCGGTA 1110
Query 1051 ACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGAATTTGAGATCTGGCGT 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGAATTTGAGATCTGGCGT 1184
Query 1125 GAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAACCGGACAAGTGTCATGT 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAACCGGACAAGTGTCATGT 1258
Query 1199 TAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGAC 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGAC 1317