Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01659
• Subject: XM_011517582.3
• Aligned Length: 1411
• Identities: 940
• Gaps: 470

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGG----CTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACG  366
                                |.|    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------ATGTTCACTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACG  54

Query  367  ATATACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACG  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   55  ATATACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACG  128

Query  441  AATTACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  129  AATTACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAA  202

Query  515  TACAGAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  203  TACAGAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTC  276

Query  589  TTTGAAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAA  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  277  TTTGAAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAA  350

Query  663  AGATACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATT  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  351  AGATACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATT  424

Query  737  ATGTGCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGA  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  ATGTGCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGA  498

Query  811  ACAATAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAA  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  499  ACAATAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAA  572

Query  885  A------------------------------------------------------------AGGTCTCACAAGA  898
            |                                                            |||||||||||||
Sbjct  573  AAGTGTTAGTGACAAACAGTCTGCGGTAACTGAATCCTCAGAGGGTACAGTATCCTTATTGAGGTCTCACAAGA  646

Query  899  ATCTTTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACT  972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  647  ATCTTTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACT  720

Query  973  CCTCAAA-------------------------------------------------------------------  979
            |||||||                                                                   
Sbjct  721  CCTCAAATTACATATATTTGTCTTACCAAACTGACTATGAATAAGAAAGAAGGAGTGAGGAAAGGATTATGCTT  794

Query  980  -----------------------GTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTG  1030
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  795  CTTAGTACTCCTAAAACATTATCGTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTG  868

Query 1031  TTTCAAAGAGTCAGCCGGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGAC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  869  TTTCAAAGAGTCAGCCGGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGAC  942

Query 1105  AAGAATTTGAGATCTGGCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAA  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  943  AAGAATTTGAGATCTGGCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAA  1016

Query 1179  CAACCGGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCG  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017  CAACCGGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCG  1090

Query 1253  AAGAC  1257
            |||||
Sbjct 1091  AAGAC  1095