Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01806
• Subject: XR_001743620.2
• Aligned Length: 2811
• Identities: 1708
• Gaps: 1101

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TGGGCGCTCAGCCTCGCTGGCCATGCGTCACCCCGGCCTTGGTGGGGGCGGGGCTCCGAAGAGCTCGGTTCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCCGGCCGCCTGGGCTCCAGGAGCCCCGGAACCAGGATAAGTTGGATGGCTGCCGCGGCGAAGCGGGGGGCGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGTGGACCGTGCCCGGTATTTTCTATACGGGTTCCGGGGCCCGGTAGAGGCGCGCCAAGAGGAAAGGAAAGTGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGCGGCCCTGGAACCTGGATATCGCGCGAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTGTGGCTCTT  296

Query    1  ----------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA  370

Query   23  CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG  444

Query   97  GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA  518

Query  171  GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGGCTATGACC  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGGCTATGACC  592

Query  245  CCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCG  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCG  666

Query  319  GAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAG  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAG  740

Query  393  TGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAA  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAA  814

Query  467  AAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCAT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCAT  888

Query  541  CACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGC  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGC  962

Query  615  CTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGG  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGG  1036

Query  689  AGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCG  1110

Query  763  TTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCA  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCA  1184

Query  837  CACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGA  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGA  1258

Query  911  ATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAG  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCACGTGCGCATCCACACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAG  1332

Query  985  TACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGAC  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGAC  1406

Query 1059  CTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTG  1132
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  CTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCG  1480

Query 1133  AGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCC  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCC  1554

Query 1207  CGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGA  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGA  1628

Query 1281  AGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGC  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGC  1702

Query 1355  AGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCC  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCC  1776

Query 1429  GACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCC--------  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1777  GACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTATGACC  1850

Query 1495  -----GTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAG  1563
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGCGGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAG  1924

Query 1564  GTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGC  1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGC  1998

Query 1638  CATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC-  1710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1999  CATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGCT  2072

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2073  GAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGGAAGTGCCATCTGCATGGCCACTCTTGCCCCCAAGGGC  2146

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2147  CCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAGGTCTCTGGGGTGAGAAGACAGCAAGAAAACTGCCTAA  2220

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2221  CTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCAGGCAGCTGGAATCAGGGGAGTGCATCATCCTCGGGAG  2294

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2295  CTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCTCAAAATCAGCTGGGCGCCCACTCTCCTCCTAAAGAAC  2368

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2369  ACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTAGAGATTGGGGCTGCTATGGGGACTGGCCCTGTAGGGT  2442

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2443  TGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGAGCAGGCCCTGTCCTGCCCTCCCAGCAATAACCACCTC  2516

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2517  CCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACCAGGGACTTCCTGACACCACAGTCAATTAATTCCTCAG  2590

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2591  GGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACCACTCCTCAGCTGCCCCCCAACCTCTCTATGGCAGAGA  2664

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2665  GGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATTGGGTTTGATTTGTTTTGTTTTTTTTAATTCCATTTTG  2738

Query 1711  -------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                     
Sbjct 2739  ATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATGGATGAATGAGTATTTAATAAAAGTTCCAAATTTCCA  2811