Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01968
• Subject: NM_015817.3
• Aligned Length: 865
• Identities: 702
• Gaps: 38

Alignment

Query   1  ATGCAGCGGAGGTGGGTCTTCGTGCTGCTCGACGTGCTGTGCTTACTGGTCGCCTCCCTGCCCTTCGCTATCCT  74
           |||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|..||||||||||.|||||.|||...|||||
Sbjct   1  ATGGAGCGGAGGTGGGTCTTCGTGCTGCTGGACGTGCTGTGCGTGTTGGTCGCCTCTCTGCCTTTCATCATCCT  74

Query  75  GACGCTGGTGAACGCCCCGTACAAGCGAGGATTTTACTGCGGGGATGACTCCATCCGGTACCCCTACCGTCCAG  148
           |||.||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  75  GACCCTGGTGAATGCACCATATAAGCGGGGGTTCTACTGTGGAGATGACTCCATCCGGTACCCATACCGTCCAG  148

Query 149  ATACCATCACCCACGGGCTCATGGCTGGGGTCACCATCACGGCCACCGTCATCCTTGTCTCGGCCGGGGAAGCC  222
           |.||.|||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||.||.||||||||||||||....||.||||||
Sbjct 149  ACACGATCACCCACGGACTCATGGCTGGGGTCATCATCACAGCTACTGTCATCCTTGTCTCATTGGGAGAAGCC  222

Query 223  TACCTGGTGTACACAGACCGGCTCTATTCTCGCTCGGACTTCAACAACTACGTGGCTGCTGTATACAAGGTGCT  296
           ||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||..|||||||||||||.||.|||||..|.|||||||||||
Sbjct 223  TACCTGGTGTACACAGACCGTCTTTATTCGCGATCCAACTTCAACAACTATGTAGCTGCCATCTACAAGGTGCT  296

Query 297  GGGGACCTTCCTGTTTGGGGCTGCCGTGAGCCAGTCTCTGACAGACCTGGCCAAGTACATGATTGGGCGTCTGA  370
           |||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||..
Sbjct 297  GGGAACCTTTCTGTTCGGGGCTGCTGTGAGCCAGTCTCTCACCGACCTGGCCAAGTACATGATTGGCCGTCTTC  370

Query 371  GGCCCAACTTCCTAGCCGTCTGCGACCCCGACTGGAGCCGGGTCAACTGCTCGGTCTATGTGCAGCTGGAGAAG  444
           |.||||..|||.|.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||||||.||.|.||||||||||||||   ||
Sbjct 371  GACCCAGTTTCTTGGCTGTCTGTGACCCTGACTGGAGCCAGGTCAACTGTTCTGGCTATGTGCAGCTGG---AG  441

Query 445  GTGTGCAGGGGAAACCCTGCTGATGTCACCGAGGCCAGGTTGTCTTTCTACTCGGGACACTCTTCCTTTGGGAT  518
           |||||||||||.|.|||||||.|||||||.|||||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 442  GTGTGCAGGGGCAGCCCTGCTAATGTCACGGAGGCCAGGCTGTCCTTCTACTCTGGCCACTCCTCCTTTGGCAT  515

Query 519  GTACTGCATGGTGTTCTTGGCGCTGTATGTGCAGGCACGACTCTGTTGGAAGTGGGCACGGCTGCTGCGACCCA  592
           |||.||||||.|||||.|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 516  GTATTGCATGTTGTTCCTGGCGCTATATGTGCAGGCCCGGCTCTGCTGGAAGTGGGCACGGCTGCTGAGGCCCA  589

Query 593  CAGTCCAGTTCTTCCTGGTGGCCTTTGCCCTCTACGTGGGCTACACCCGCGTGTCTGATTACAAACACCACTGG  666
           |.||.|||||||||.|||||||||||||..||||.||||||||.|||||.||||||||..||||.|||||||||
Sbjct 590  CTGTTCAGTTCTTCTTGGTGGCCTTTGCAATCTATGTGGGCTATACCCGAGTGTCTGACCACAAGCACCACTGG  663

Query 667  AGCGATGTCCTTGTTGGCCTCCTGCAGGGGGCACTGGTGG-CTGCCCTCACTGTCTGCTACATCTCAGACTTCT  739
           ||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||| ||| ||||||.|||.||||..|.|||||.||||
Sbjct 664  AGTGATGTCCTTGTCGGCCTCCTGCAGGGAGCCCTGGTGGCCTG-CCTCACGGTCCGCTATGTTTCAGATTTCT  736

Query 740  TCAAAGCCCGACCCCCACAGCACTGTCTGAAGGAGGAGGAGCTGGAACGGAAGCCCAGCCTGTCACTGACGTTG  813
           |||||.||||.||.||.||||.|||.|.|.||||.||.|.||.|||.||.||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 737  TCAAATCCCGGCCACCCCAGCCCTGCCAGGAGGATGAAGTGCCGGAGCGCAAGCCCAGTCTGTCACTGACGCTG  810

Query 814  ACCCTGGGCGAGGCTGACCACAACCACTATGGATACCCGCACTCCTCCTCC  864
           |||||.||.||  |.||||.                               
Sbjct 811  ACCCTTGGTGA--CCGACCC-------------------------------  828