Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01968
• Subject: NM_177543.3
• Aligned Length: 939
• Identities: 846
• Gaps: 87

Alignment

Query   1  -------------------------------------AT-----------GCAGC-GGA---------GGTGGG  16
                                                ||           ||||| |||         ||.|||
Sbjct   1  ATGGGGGTCGCGAGAGGCCCGGGGAGCCGGGGCCAGCATCCCCCGCCCCGGCAGCAGGAAGTCTGTGCGGAGGG  74

Query  17  TCTTCGTGCTGCTCGACGTG-----------------CTGTGCTTACTGGTCGCCTCCCTGCCCTTCGCTATCC  73
                  ||.||.|| ||.|                 ||| ||   ||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  -------GCCGCGCG-CGCGCCTCCATCCCGCCCCGCCTG-GC---CTGGGAGCCTCCCTGCCCTTCGCTATCC  136

Query  74  TGACGCTGGTGAACGCCCCGTACAAGCGAGGATTTTACTGCGGGGATGACTCCATCCGGTACCCCTACCGTCCA  147
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137  TGACGCTGGTGAACGCCCCGTACAAGCGAGGATTTTACTGCGGGGATGACTCCATCCGGTACCCCTACCGTCCA  210

Query 148  GATACCATCACCCACGGGCTCATGGCTGGGGTCACCATCACGGCCACCGTCATCCTTGTCTCGGCCGGGGAAGC  221
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211  GATACCATCACCCACGGGCTCATGGCTGGGGTCACCATCACGGCCACCGTCATCCTTGTCTCGGCCGGGGAAGC  284

Query 222  CTACCTGGTGTACACAGACCGGCTCTATTCTCGCTCGGACTTCAACAACTACGTGGCTGCTGTATACAAGGTGC  295
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285  CTACCTGGTGTACACAGACCGGCTCTATTCTCGCTCGGACTTCAACAACTACGTGGCTGCTGTATACAAGGTGC  358

Query 296  TGGGGACCTTCCTGTTTGGGGCTGCCGTGAGCCAGTCTCTGACAGACCTGGCCAAGTACATGATTGGGCGTCTG  369
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359  TGGGGACCTTCCTGTTTGGGGCTGCCGTGAGCCAGTCTCTGACAGACCTGGCCAAGTACATGATTGGGCGTCTG  432

Query 370  AGGCCCAACTTCCTAGCCGTCTGCGACCCCGACTGGAGCCGGGTCAACTGCTCGGTCTATGTGCAGCTGGAGAA  443
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433  AGGCCCAACTTCCTAGCCGTCTGCGACCCCGACTGGAGCCGGGTCAACTGCTCGGTCTATGTGCAGCTGGAGAA  506

Query 444  GGTGTGCAGGGGAAACCCTGCTGATGTCACCGAGGCCAGGTTGTCTTTCTACTCGGGACACTCTTCCTTTGGGA  517
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507  GGTGTGCAGGGGAAACCCTGCTGATGTCACCGAGGCCAGGTTGTCTTTCTACTCGGGACACTCTTCCTTTGGGA  580

Query 518  TGTACTGCATGGTGTTCTTGGCGCTGTATGTGCAGGCACGACTCTGTTGGAAGTGGGCACGGCTGCTGCGACCC  591
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581  TGTACTGCATGGTGTTCTTGGCGCTGTATGTGCAGGCACGACTCTGTTGGAAGTGGGCACGGCTGCTGCGACCC  654

Query 592  ACAGTCCAGTTCTTCCTGGTGGCCTTTGCCCTCTACGTGGGCTACACCCGCGTGTCTGATTACAAACACCACTG  665
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655  ACAGTCCAGTTCTTCCTGGTGGCCTTTGCCCTCTACGTGGGCTACACCCGCGTGTCTGATTACAAACACCACTG  728

Query 666  GAGCGATGTCCTTGTTGGCCTCCTGCAGGGGGCACTGGTGGCTGCCCTCACTGTCTGCTACATCTCAGACTTCT  739
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729  GAGCGATGTCCTTGTTGGCCTCCTGCAGGGGGCACTGGTGGCTGCCCTCACTGTCTGCTACATCTCAGACTTCT  802

Query 740  TCAAAGCCCGACCCCCACAGCACTGTCTGAAGGAGGAGGAGCTGGAACGGAAGCCCAGCCTGTCACTGACGTTG  813
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803  TCAAAGCCCGACCCCCACAGCACTGTCTGAAGGAGGAGGAGCTGGAACGGAAGCCCAGCCTGTCACTGACGTTG  876

Query 814  ACCCTGGGCGAGGCTGACCACAACCACTATGGATACCCGCACTCCTCCTCC  864
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877  ACCCTGGGCGAGGCTGACCACAACCACTATGGATACCCGCACTCCTCCTCC  927