Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02164
• Subject: XM_011536259.2
• Aligned Length: 1030
• Identities: 935
• Gaps: 86

Alignment

Query    1  ATGGTCGGGGAAATGGAAACGAAGGAGAAGCCGAAGCCCACCCCAGATTACCTGATGCAGCTGATGAACGACAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCGGGGAAATGGAAACGAAGGAGAAGCCGAAGCCCACCCCAGATTACCTGATGCAGCTGATGAACGACAA  74

Query   75  GAAGCTCATGAGCAGCCTGCCCAACTTCTGCGGGATCTTCAACCACCTCGAGCGGCTGCTGGACGAAGAAATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCTCATGAGCAGCCTGCCCAACTTCTGCGGGATCTTCAACCACCTCGAGCGGCTGCTGGACGAAGAAATTA  148

Query  149  GCAGAGTACGGAAAGACATGTACAATGACACATTAAATGGCAGTACAGAGAAAAGGAGTGCAGAATTGCCTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGAGTACGGAAAGACATGTACAATGACACATTAAATGGCAGTACAGAGAAAAGGAGTGCAGAATTGCCTGAT  222

Query  223  GCTGTGGGACCTATTGTTCAGTTACAAGAGAAACTTTATGTGCCTGTAAAAGAATACCCAGATTTTAATTTTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTGGGACCTATTGTTCAGTTACAAGAGAAACTTTATGTGCCTGTAAAAGAATACCCAGATTTTAATTTTGT  296

Query  297  TGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCCAAACAACTTGAAGCAGAAACCGGATGTAAAATCATGGTCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGAGAATCCTTGGACCTAGAGGACTTACAGCCAAACAACTTGAAGCAGAAACCGGATGTAAAATCATGGTCC  370

Query  371  GAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAAAAGGAGGAGCAAAATAGAGGCAAGCCCAATTGGGAGCATCTAAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGGCAAAGGCTCAATGAGGGATAAAAAAAAGGAGGAGCAAAATAGAGGCAAGCCCAATTGGGAGCATCTAAAT  444

Query  445  GAAGATTTACATGTACTAATCACTGTGGAAGATGCTCAGAACAGAGCAGAAATCAAATTGAAGAGAGCAGTTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGATTTACATGTACTAATCACTGTGGAAGATGCTCAGAACAGAGCAGAAATCAAATTGAAGAGAGCAGTTGA  518

Query  519  AGAAGTGAAGAAATTATTGGTACCTGCAGCAGAAGGAGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGTGAAGAAATTATTGGTACCTGCAGCAGAAGGAGAAGACAGCCTGAAGAAGATGCAGCTGATGGAGCTTG  592

Query  593  CGATTCTGAATGGCACCTACAGAGATGCCAACATTAAATCACCAGCCCTTGCCTTTTCTCTTGCAGCAACAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        ||||||||
Sbjct  593  CGATTCTGAATGGCACCTACAGAGATGCCAACATTAAATCAC------------------------CAACAGCC  642

Query  667  CAGGCTGCTCCAAGGATCATTACTGGGCCTGCGCCGGTTCTCCCACCAGCTGCCCTGCGTACTCCTACGCCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  CAGGCTGCTCCAAGGATCATTACTGGGCCTGCGCCGGTTCTCCCACCAGCTGCCCTGCGTACTCCTACGCCAGC  716

Query  741  TGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  TGGCCCTACCATAATGCCTTTGATCAGACAAATACAGACCGCTGTCATGCCAAACGGAACTCCTCACCCAACTG  790

Query  815  CTGCAATAGTTCCTCCAGGGCCCGAAGCTGGTTTAATCTATACACCCTATGAGTACCCCTACACATTGGCACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  CTGCAATAGTTCCTCCAGGGCCCGAAGCTGGTTTAATCTATACACCCTATGAGTACCCCTACACATTGGCACCA  864

Query  889  GCTACATCAATCCTTGAGTATCCTATTGAACCTAGTGGTGTATTAGGTGCGGTGGCTACTAAAGTTCGA---AG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    .||||  |.|.||.|.|.|   |.
Sbjct  865  GCTACATCAATCCTTGAGTATCCTATTGAACCTAGTGGTGTATTAG----AGTGG--ATTGAAATGCCAGTCAT  932

Query  960  GCACGATAT----GCGTGTCCATCCTTACCAAAGGATTGTGACCGCAGACCGAGCCGCCACCGGCAAC  1023
            ||..|||||    ||    ||||                                             
Sbjct  933  GCCTGATATTTCAGC----CCAT---------------------------------------------  951