Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02214
• Subject: XM_006516070.3
• Aligned Length: 1428
• Identities: 989
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT  74
            ||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCTCAGGGGTCCGGGGACCAGCGAGCAGTGGGGATCGCTGATCCAGAAGAGAGTTCTCCCAACATGATTGT  74

Query   75  TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA  148
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CTACTGCAAAATTGAGGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTTA  148

Query  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTACAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222

Query  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA  296
            |||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACCTGGGAAGCCTTATTGCCGCCCAGGGCTACATCTTCCCAATCTCAGA  296

Query  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGACGATGGCACCTTTTACCGTTTCCAGGCTCCTTACTTCTGGCCTTCAAACTGCT  370

Query  371  GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG  444
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAACCTGAAAACACGGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACGATGCAGAACAAAGCAAGGCTGGAACTG  444

Query  445  GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518
            ||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGACTACGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCAAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518

Query  519  AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG  592
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|
Sbjct  519  AGCAGAAGCACAAGTGAAGATTGACCGGAAAAAGGATAAGACAGAAAGAAAAATTCTGGATAGCCAAGAACGGG  592

Query  593  CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT  666
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct  593  CCTTCTGGGATGTCCACAGGCCAGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCAGAAAATGTCGGCGT  666

Query  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||
Sbjct  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCAGTATATGGTGTGACAGACGAGACCCAGTCACAGAGTCCAGTGCA  740

Query  741  TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA  814
            ..|||..|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  CATACCAAGCCAGCCAATCAGGAAAACTACAAAAGATGACATCCGAAAACAGATAACGTTTTTGAATGCACAGA  814

Query  815  TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT  888
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  815  TTGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATCGCTTACACGGAGCAGTATGTGGAGTAC  888

Query  889  GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT  962
            |||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|..|.||.||||||||||||||
Sbjct  889  GACCCATTCATAACACCAGCAGAGCCATCTAATCCTTGGATCAGCGATGACATCACCTTATGGGACATAGAGAT  962

Query  963  GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCT-----TTCGATG--AGATATTGAAGGAC  1029
            ||||...||             |..|||.|      .|||||||||     |.|.|||  ||.|     ||.||
Sbjct  963  GAGCTTTGA-------------CTTGTACA------TGGCTTCTCTGTGTCTCCAATGGCAGCT-----AGCAC  1012

Query 1030  CAGGTGGGGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAG---TTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCT  1100
            |                   |||.|                  ||||   ||||         .||.|||||||
Sbjct 1013  C-------------------TCTCC------------------TCAGCGTTTCA---------TGGCTCTGGCT  1040

Query 1101  GGCTGTCCAAGATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTC  1174
            |                              |.|||          ||||.|||.|    |||          |
Sbjct 1041  G------------------------------CTGGA----------AGGGAAGACG----CTG----------C  1060

Query 1175  TGGCTCCAGGGGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGAT  1248
            ||.|                    |||||.||   ||||    ||.|                           
Sbjct 1061  TGCC--------------------TCAACTTG---TCTC----CTTT---------------------------  1080

Query 1249  GGAGGGAGATATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACA--AGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGC  1320
                          ||.|.|.|.|||     ||||     |||  |||                          
Sbjct 1081  --------------ATCTCAGGTCGC-----AGCA-----ACACTAGC--------------------------  1104

Query 1321  TTCCTCCGGTCAAATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAAGGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCT  1394
                                                                                      
Sbjct 1105  --------------------------------------------------------------------------  1104

Query 1395  CACGGGCCTGATGCAGTCCTCC  1416
                                  
Sbjct 1105  ----------------------  1104