Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02263
• Subject: XM_017002957.2
• Aligned Length: 2430
• Identities: 2429
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCTAATCAAGGAGAAGACTGCTATTTTTTTTTCTATTCCACATGTACCAAAGGCGACAGCTGCCCATTCCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTAATCAAGGAGAAGACTGCTATTTTTTTTTCTATTCCACATGTACCAAAGGTGACAGCTGCCCATTCCG  74

Query   75  TCACTGTGAAGCTGCAATAGGAAATGAAACTGTTTGCACATTATGGCAAGAAGGGCGCTGTTTTCGACAGGTGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCACTGTGAAGCTGCAATAGGAAATGAAACTGTTTGCACATTATGGCAAGAAGGGCGCTGTTTTCGACAGGTGT  148

Query  149  GCAGGTTTCGGCACATGGAGATTGATAAAAAACGCAGTGAAATTCCTTGTTATTGGGAAAATCAGCCAACAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGGTTTCGGCACATGGAGATTGATAAAAAACGCAGTGAAATTCCTTGTTATTGGGAAAATCAGCCAACAGGA  222

Query  223  TGTCAAAAATTAAACTGCGCTTTCCATCACAATAGAGGACGATATGTTGATGGCCTTTTCCTACCTCCGAGCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGTCAAAAATTAAACTGCGCTTTCCATCACAATAGAGGACGATATGTTGATGGCCTTTTCCTACCTCCGAGCAA  296

Query  297  AACTGTGTTGCCCACTGTGCCTGAGTCACCAGAAGAGGAAGTGAAGGCTAGCCAACTTTCAGTTCAGCAGAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTGTGTTGCCCACTGTGCCTGAGTCACCAGAAGAGGAAGTGAAGGCTAGCCAACTTTCAGTTCAGCAGAACA  370

Query  371  AATTGTCTGTCCAGTCCAATCCTTCCCCTCAGCTGCGGAGCGTTATGAAAGTAGAAAGTTCCGAAAATGTTCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATTGTCTGTCCAGTCCAATCCTTCCCCTCAGCTGCGGAGCGTTATGAAAGTAGAAAGTTCCGAAAATGTTCCT  444

Query  445  AGCCCCACGCATCCACCAGTTGTAATTAATGCTGCAGATGATGATGAAGATGATGATGATCAGTTTTCTGAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCCCACGCATCCACCAGTTGTAATTAATGCTGCAGATGATGATGAAGATGATGATGATCAGTTTTCTGAGGA  518

Query  519  AGGTGATGAAACCAAAACACCTACCCTGCAACCAACTCCTGAAGTTCACAATGGATTACGAGTGACTTCTGTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGTGATGAAACCAAAACACCTACCCTGCAACCAACTCCTGAAGTTCACAATGGATTACGAGTGACTTCTGTCC  592

Query  593  GGAAACCTGCAGTCAATATAAAGCAAGGTGAATGTTTGAATTTTGGAATAAAAACTCTTGAGGAAATTAAGTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGAAACCTGCAGTCAATATAAAGCAAGGTGAATGTTTGAATTTTGGAATAAAAACTCTTGAGGAAATTAAGTCA  666

Query  667  AAGAAAATGAAGGAAAAATCTAAGAAGCAAGGTGAGGGTTCTTCAGGAGTTTCCAGTCTTTTACTCCACCCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAAATGAAGGAAAAATCTAAGAAGCAAGGTGAGGGTTCTTCAGGAGTTTCCAGTCTTTTACTCCACCCTGA  740

Query  741  GCCCGTTCCAGGTCCTGAAAAAGAAAATGTCAGGACTGTGGTGAGGACAGTAACTCTCTCCACCAAACAAGGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCGTTCCAGGTCCTGAAAAAGAAAATGTCAGGACTGTGGTGAGGACAGTAACTCTCTCCACCAAACAAGGAG  814

Query  815  AAGAACCCTTGGTTAGATTGAGTCTTACTGAGAGACTGGGGAAACGAAAATTTTCAGCAGGCGGTGACAGTGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAACCCTTGGTTAGATTGAGTCTTACTGAGAGACTGGGGAAACGAAAATTTTCAGCAGGCGGTGACAGTGAT  888

Query  889  CCTCCATTAAAGCGTAGCCTGGCACAGAGGCTAGGGAAGAAAGTTGAAGCTCCAGAAACTAACATTGACAAAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTCCATTAAAGCGTAGCCTGGCACAGAGGCTAGGGAAGAAAGTTGAAGCTCCAGAAACTAACATTGACAAAAC  962

Query  963  ACCAAAGAAAGCTCAAGTTTCCAAGTCTCTTAAGGAGCGATTAGGCATGTCAGCTGATCCAGATAATGAGGATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCAAAGAAAGCTCAAGTTTCCAAGTCTCTTAAGGAGCGATTAGGCATGTCAGCTGATCCAGATAATGAGGATG  1036

Query 1037  CAACAGATAAAGTTAATAAAGTTGGTGAGATCCATGTGAAGACATTAGAAGAAATTCTTCTTGAAAGAGCCAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAACAGATAAAGTTAATAAAGTTGGTGAGATCCATGTGAAGACATTAGAAGAAATTCTTCTTGAAAGAGCCAGT  1110

Query 1111  CAGAAACGTGGAGAATTGCAAACTAAACTCAAGACAGAAGGACCTTCAAAAACTGATGATTCTACTTCAGGAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAAACGTGGAGAATTGCAAACTAAACTCAAGACAGAAGGACCTTCAAAAACTGATGATTCTACTTCAGGAGC  1184

Query 1185  AAGAAGCTCCTCCACTATCCGTATCAAAACCTTCTCTGAGGTCCTGGCTGAAAAAAAACATCGGCAGCAGGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGAAGCTCCTCCACTATCCGTATCAAAACCTTCTCTGAGGTCCTGGCTGAAAAAAAACATCGGCAGCAGGAAG  1258

Query 1259  CAGAGAGACAAAAAAGCAAAAAGGATACAACTTGCATCAAGCTAAAGATTGATAGTGAAATTAAAAAAACAGTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAGAGACAAAAAAGCAAAAAGGATACAACTTGCATCAAGCTAAAGATTGATAGTGAAATTAAAAAAACAGTA  1332

Query 1333  GTTTTGCCACCCATTGTTGCCAGCAGAGGACAATCAGAGGAGCCTGCAGGTAAAACAAAGTCTATGCAGGAGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTTTGCCACCCATTGTTGCCAGCAGAGGACAATCAGAGGAGCCTGCAGGTAAAACAAAGTCTATGCAGGAGGT  1406

Query 1407  GCACATCAAGACGCTGGAAGAAATTAAACTGGAGAAGGCACTGAGGGTGCAGCAGAGCTCTGAGAGCAGCACCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCACATCAAGACGCTGGAAGAAATTAAACTGGAGAAGGCACTGAGGGTGCAGCAGAGCTCTGAGAGCAGCACCA  1480

Query 1481  GCTCCCCGTCTCAACACGAGGCCACTCCAGGGGCAAGGCGGCTGCTGCGAATCACCAAAAGAACAGGGATGAAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCTCCCCGTCTCAACACGAGGCCACTCCAGGGGCAAGGCGGCTGCTGCGAATCACCAAAAGAACAGGGATGAAA  1554

Query 1555  GAAGAGAAGAACCTTCAGGAAGGAAATGAAGTTGATTCTCAGAGCAGTATTAGAACAGAAGCTAAAGAGGCTTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAGAGAAGAACCTTCAGGAAGGAAATGAAGTTGATTCTCAGAGCAGTATTAGAACAGAAGCTAAAGAGGCTTC  1628

Query 1629  AGGTGAGACCACAGGAGTTGACATCACTAAAATTCAAGTCAAGAGATGTGAGACCATGAGAGAGAAGCACATGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGTGAGACCACAGGAGTTGACATCACTAAAATTCAAGTCAAGAGATGTGAGACCATGAGAGAGAAGCACATGC  1702

Query 1703  AGAAACAGCAGGAGAGGGAAAAATCAGTCTTGACACCTCTTCGGGGAGATGTAGCCTCTTGCAATACCCAAGTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAAACAGCAGGAGAGGGAAAAATCAGTCTTGACACCTCTTCGGGGAGATGTAGCCTCTTGCAATACCCAAGTG  1776

Query 1777  GCAGAGAAACCAGTGCTCACTGCTGTGCCAGGAATCACACGGCACCTGACCAAGCGGCTTCCCACAAAGTCATC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCAGAGAAACCAGTGCTCACTGCTGTGCCAGGAATCACACGGCACCTGACCAAGCGGCTTCCCACAAAGTCATC  1850

Query 1851  CCAGAAGGTGGAGGTAGAAACCTCAGGGATTGGAGACTCATTATTGAATGTGAAATGTGCAGCACAGACCTTGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCAGAAGGTGGAGGTAGAAACCTCAGGGATTGGAGACTCATTATTGAATGTGAAATGTGCAGCACAGACCTTGG  1924

Query 1925  AAAAAAGGGGTAAAGCTAAACCCAAAGTGAACGTGAAGCCATCTGTGGTTAAAGTTGTGTCATCCCCCAAATTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAAAAAGGGGTAAAGCTAAACCCAAAGTGAACGTGAAGCCATCTGTGGTTAAAGTTGTGTCATCCCCCAAATTG  1998

Query 1999  GCCCCAAAACGTAAGGCAGTGGAGATGCACGCTGCTGTCATTGCCGCTGTGAAGCCACTCAGCTCCAGCAGTGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCCCAAAACGTAAGGCAGTGGAGATGCACGCTGCTGTCATTGCCGCTGTGAAGCCACTCAGCTCCAGCAGTGT  2072

Query 2073  CCTACAGGAACCCCCAGCCAAAAAGGCAGCTGTGGCTGTTGTCCCGCTTGTCTCTGAGGACAAATCAGTCACTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTACAGGAACCCCCAGCCAAAAAGGCAGCTGTGGCTGTTGTCCCGCTTGTCTCTGAGGACAAATCAGTCACTG  2146

Query 2147  TGCCTGAAGCAGAAAATCCTAGAGACAGTCTTGTGCTGCCTCCAACCCAGTCCTCTTCAGATTCCTCACCCCCG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCCTGAAGCAGAAAATCCTAGAGACAGTCTTGTGCTGCCTCCAACCCAGTCCTCTTCAGATTCCTCACCCCCG  2220

Query 2221  GAGGTGTCTGGCCCTTCCTCATCCCAAATGAGCATGAAAACTCGCCGACTCAGCTCTGCCTCAACAGGAAAGCC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GAGGTGTCTGGCCCTTCCTCATCCCAAATGAGCATGAAAACTCGCCGACTCAGCTCTGCCTCAACAGGAAAGCC  2294

Query 2295  CCCACTCTCTGTGGAGGATGATTTTGAGAAACTAATATGGGAGATTTCAGGAGGCAAATTGGAAGCTGAGATTG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCCACTCTCTGTGGAGGATGATTTTGAGAAACTAATATGGGAGATTTCAGGAGGCAAATTGGAAGCTGAGATTG  2368

Query 2369  ACCTGGATCCTGGGAAAGATGAAGATGACCTTCTGCTTGAGCTATCAGAAATGATTGATAGC  2430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACCTGGATCCTGGGAAAGATGAAGATGACCTTCTGCTTGAGCTATCAGAAATGATTGATAGC  2430