Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02460
- Subject:
- NM_001349237.2
- Aligned Length:
- 2109
- Identities:
- 1869
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 ATGGCGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACTGCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACTGCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGG 74
Query 75 GTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGTATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGTATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTT 148
Query 149 ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGCTTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGCTTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCT 222
Query 223 CCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACTGTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACTGTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGC 296
Query 297 AGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGATATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGATATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAA 370
Query 371 ACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTTGCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTTGCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTT 444
Query 445 TGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCTCATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCTCATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTC 518
Query 519 ACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATAATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATAATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTT 592
Query 593 ACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTTTCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTTTCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT 666
Query 667 CAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTGTAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTGTAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA 740
Query 741 TTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTTTCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTTTCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTA 814
Query 815 CCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATCTTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATCTTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA 888
Query 889 GATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGA 962
Query 963 ATGTATGGACCCTAAAAGGTTAGCTGAGTCATCAGTGGATCTAAATCTCAAACTGATGTGTTGGAGATTGGTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATGTATGGACCCTAAAAGGTTAGCTGAGTCATCAGTGGATCTAAATCTCAAACTGATGTGTTGGAGATTGGTTC 1036
Query 1037 CTACTTTAGACTTGGACAAGGTTGTGTCTGTCAAATGTCTGCTGCTTGGAGCCGGCACCTTGGGTTGCAATGTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTACTTTAGACTTGGACAAGGTTGTGTCTGTCAAATGTCTGCTGCTTGGAGCCGGCACCTTGGGTTGCAATGTA 1110
Query 1111 GCTAGGACGTTGATGGGTTGGGGCGTGAGACACATCACATTTGTGGACAATGCCAAGATCTCCTACTCCAATCC 1184
|||||||||||||
Sbjct 1111 GCTAGGACGTTGA------------------------------------------------------------- 1123
Query 1185 TGTGAGGCAGCCTCTCTATGAGTTTGAAGATTGCCTAGGGGGTGGTAAGCCCAAGGCTCTGGCAGCAGCGGACC 1258
Sbjct 1124 -------------------------------------------------------------------------- 1123
Query 1259 GGCTCCAGAAAATATTCCCCGGTGTGAATGCCAGAGGATTCAACATGAGCATACCTATGCCTGGGCATCCAGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 ------------------------TGAATGCCAGAGGATTCAACATGAGCATACCTATGCCTGGGCATCCAGTG 1173
Query 1333 AACTTCTCCAGTGTCACTCTGGAGCAAGCCCGCAGAGATGTGGAGCAACTGGAGCAGCTCATCGAAAGCCATGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 AACTTCTCCAGTGTCACTCTGGAGCAAGCCCGCAGAGATGTGGAGCAACTGGAGCAGCTCATCGAAAGCCATGA 1247
Query 1407 TGTCGTCTTCCTATTGATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTGCCGTCATTGCTGCAAGCAAGAGAAAGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 TGTCGTCTTCCTATTGATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTGCCGTCATTGCTGCAAGCAAGAGAAAGC 1321
Query 1481 TGGTCATCAATGCTGCTTTGGGATTTGACACATTTGTTGTCATGAGACATGGTCTGAAGAAACCAAAGCAGCAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322 TGGTCATCAATGCTGCTTTGGGATTTGACACATTTGTTGTCATGAGACATGGTCTGAAGAAACCAAAGCAGCAA 1395
Query 1555 GGAGCTGGGGACTTGTGTCCAAACCACCCTGTGGCATCTGCTGACCTCCTGGGCTCATCGCTTTTTGCCAACAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396 GGAGCTGGGGACTTGTGTCCAAACCACCCTGTGGCATCTGCTGACCTCCTGGGCTCATCGCTTTTTGCCAACAT 1469
Query 1629 CCCTGGTTACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCCCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470 CCCTGGTTACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCCCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACCT 1543
Query 1703 TGGACCAGCAGTGCACTGTGAGTCGTCCAGGACTGGCCGTGATTGCAGGAGCCCTGGCCGTGGAATTGATGGTA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 TGGACCAGCAGTGCACTGTGAGTCGTCCAGGACTGGCCGTGATTGCAGGAGCCCTGGCCGTGGAATTGATGGTA 1617
Query 1777 TCTGTTTTGCAGCATCCAGAAGGGGGCTATGCCATTGCCAGCAGCAGTGACGATCGGATGAATGAGCCTCCAAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 TCTGTTTTGCAGCATCCAGAAGGGGGCTATGCCATTGCCAGCAGCAGTGACGATCGGATGAATGAGCCTCCAAC 1691
Query 1851 CTCTCTTGGGCTTGTGCCTCACCAG------------------------------------------------- 1875
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 CTCTCTTGGGCTTGTGCCTCACCAGATCCGGGGATTTCTTTCACGGTTTGATAATGTCCTTCCCGTCAGCCTGG 1765
Query 1876 --------------------------------GTTCTTGATCAATATGAACGAGAAGGATTTAACTTCCTAGCC 1917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 CATTTGACAAATGTACAGCTTGTTCTTCCAAAGTTCTTGATCAATATGAACGAGAAGGATTTAACTTCCTAGCC 1839
Query 1918 AAGGTGTTTAATTCTTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACTGGTCTTACATTGCTGCATCAAGAAACCCAAGC 1991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 AAGGTGTTTAATTCTTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACTGGTCTTACATTGCTGCATCAAGAAACCCAAGC 1913
Query 1992 TGCTGAGATCTGGGACATGAGCGATGATGAGACCATC 2028
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914 TGCTGAGATCTGGGACATGAGCGATGATGAGACCATC 1950