Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02599
• Subject: NM_001081637.2
• Aligned Length: 1995
• Identities: 1290
• Gaps: 567

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC  74
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222
            |||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  223  CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTT  296
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA  296

Query  297  CTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370
            |||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370

Query  371  AACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAG  444
            ||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||.||||.|||||||
Sbjct  371  AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG  444

Query  445  GTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCG  518
            ||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA  518

Query  519  TACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT  592
            |.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  519  TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT  592

Query  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666

Query  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.
Sbjct  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG  740

Query  741  TTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCAC  814
            .|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||
Sbjct  741  CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC  814

Query  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888

Query  889  TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA  962
            ||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA  962

Query  963  GTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036
            ||||..||.||||..||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT  1036

Query 1037  GTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGA  1110
            ||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||
Sbjct 1037  GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA  1110

Query 1111  TCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTA  1184
            ||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 1111  TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA  1184

Query 1185  CAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCT  1258
            |||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1185  CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT  1258

Query 1259  CAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-TTCCA-------AGGC----TGGAGCAGC  1319
            |||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.||  ||||.|.||.| .||||       ||||    .|||.||||
Sbjct 1259  CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC  1330

Query 1320  TAACACCCTCAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCACACCCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCT-------C  1386
                 ||||||.|||            .||.|..||..|.||||||        |||||    |||       |
Sbjct 1331  -----CCCTCACCCC------------CACCGGGTCGGATCCCCAG--------AGTGG----TCTGGGAAGGC  1375

Query 1387  ATCCG--------CATGGGCATAGCTGGCTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC------------------  1425
            |.|.|        .||.|||||      |||||         ||||..||.|||||                  
Sbjct 1376  ACCTGGGGGTTGTGATCGGCAT------CTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTC  1443

Query 1426  -----------------------GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT------------  1440
                                   |||   |..||                    ||| ||||            
Sbjct 1444  CTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGC  1517

Query 1441  -GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTC-----------------------------------  1467
             |.||||       |||    |||||.|||||  ||||.                                   
Sbjct 1518  AGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGA  1589

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1590  AGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCAC  1663

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1664  ACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCT  1737

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1738  CCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGA  1811

Query 1468  --------------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                      
Sbjct 1812  GGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAA  1885

Query 1468  -----------------------------------------------------------------------  1467
                                                                                   
Sbjct 1886  CTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1956