Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02599
• Subject: XM_017026192.1
• Aligned Length: 1588
• Identities: 1227
• Gaps: 233

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTGTCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCAT  74

Query    1  ----------------------------------ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGA  40
                                              ||||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct   75  CCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA  148

Query   41  GTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGACCCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTG  114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  GTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTG  222

Query  115  ATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGA  188
            |||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||..||.|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  ATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGA  296

Query  189  AAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA  370

Query  263  TCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGAC  336
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||.|.||||||..|||||||
Sbjct  371  TCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGAC  444

Query  337  CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTC  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..||||||||.|||||||.|||
Sbjct  445  CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTC  518

Query  411  AGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCACAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG  484
            |||||||||.||.||||||||.||||.|||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG  592

Query  485  ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCCCCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCC  558
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||.|||||.||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCC  666

Query  559  GTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACC  632
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACC  740

Query  633  CAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  CAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCG  814

Query  707  TGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAG  780
            |||||||||.|||||.||||||.||.|||||||..|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  TGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAC  888

Query  781  GGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCCCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG  854
            ||.||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG  962

Query  855  CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC  1036

Query  929  CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCCGTGGCAGACCCTTCATCTCGGTGCATCCGGGCCCC  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||..||.|.||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCC  1110

Query 1003  ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAA  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||...|.|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAA  1184

Query 1077  GGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCTCAGATCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTA  1150
            ||.|||.||||||||||.|||....|||||.|||||||...||.|||.||..||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  GGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCA  1258

Query 1151  TGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTG  1224
            ||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259  TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTG  1332

Query 1225  TCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGT  1297
            .||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.||  ||||.|.
Sbjct 1333  ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGC  1404

Query 1298  CCGA-TTCCA-------AGGC----TGGAGCAGCTAACACCCTCAGCCCATCACAAAACAAGACTGCCTCACAC  1359
            ||.| .||||       ||||    .|||.||||     ||||||.|||            .||.|..||..|.
Sbjct 1405  CCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGC-----CCCTCACCCC------------CACCGGGTCGGAT  1461

Query 1360  CCCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGCATAGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCT  1433
            ||||||        |||||.||.                                                   
Sbjct 1462  CCCCAG--------AGTGGTGAG---------------------------------------------------  1476

Query 1434  GCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCTC  1467
                                              
Sbjct 1477  ----------------------------------  1476