Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02765
- Subject:
- XM_017022042.2
- Aligned Length:
- 3411
- Identities:
- 2529
- Gaps:
- 882
Alignment
Query 1 ATGAGCGACATAGTGGAGAAGACGCTGACGGCGCTGCCGGGACTCTTTCTGCAGAACCAGCCCGGTGGTGGGCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGCGGCCGCCAAGGCGTCCTTCTCCTCGAGGCTGGGCAGCCTTGTCCGCGGCATCACAGCCCTCACCTCCAAGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGAAGAAGAAAAATTAATCCAGCAGGAACTGAGTAGTCTGAAAGCGACTGTTTCTGCTCCTACTACAACACTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAATGATGAAGGAATGTATGGTGAGACTTATATATTGTGAAATGCTTGGATATGATGCTTCCTTTGGCTATAT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TCATGCAATCAAGTTAGCCCAACAAGGAAACCTCTTAGAAAAAAGAGTAGGTTATTTGGCTGTTTCCTTATTTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TACATGAAAGTCATGAATTATTGCTTCTCCTTGTGAATACAGTTGTAAAGGATCTGCAGAGCACTAACCTAGTA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GAAGTGTGTATGGCACTGACTGTTGTTAGCCAGATTTTCCCCTGCGAAATGATTCCAGCTGTTCTTCCATTAAT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGAAGATAAACTTCAACATTCTAAGGAGATTGTACGAAGAAAAGCTGTTCTGGCATTATACAAATTCCATCTCA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TTGCTCCTAATCAAGTACAACATATTCATATTAAGTTTCGGAAAGCACTTTGTGACAGAGATGTTGGGGTCATG 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GCTGCCTCCTTGCATATATATCTTAGAATGATTAAGGAGAATTCATCTGGATATAAAGACTTGACTGGGAGTTT 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TGTAACCATTTTGAAGCAAGTAGTTGGAGGAAAGCTCCCAGTAGAATTCAATTACCACAGTGTGCCAGCACCAT 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 GGTTACAAATTCAGCTCTTGAGAATACTGGGACTTCTAGGAAAAGATGATCAAAGGACAAGTGAATTAATGTAT 888
||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------------ATGTAT 6
Query 889 GATGTTCTTGATGAATCCTTACGAAGAGCTGAGTTAAATCACAATGTCACATATGCTATTTTGTTTGAATGTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7 GATGTTCTTGATGAATCCTTACGAAGAGCTGAGTTAAATCACAATGTCACATATGCTATTTTGTTTGAATGTGT 80
Query 963 GCATACAGTCTATTCTATTTATCCTAAATCGGAATTACTTGAGAAGGCTGCCAAGTGCATTGGAAAATTTGTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 GCATACAGTCTATTCTATTTATCCTAAATCGGAATTACTTGAGAAGGCTGCCAAGTGCATTGGAAAATTTGTTC 154
Query 1037 TGTCACCTAAAATAAATCTAAAATATTTAGGACTGAAGGCTCTTACCTATGTTATCCAACAGGATCCTACTCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 155 TGTCACCTAAAATAAATCTAAAATATTTAGGACTGAAGGCTCTTACCTATGTTATCCAACAGGATCCTACTCTG 228
Query 1111 GCTCTTCAACACCAGATGACAATAATTGAATGTTTAGATCATCCTGATCCCATTATTAAAAGAGAGACTCTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 GCTCTTCAACACCAGATGACAATAATTGAATGTTTAGATCATCCTGATCCCATTATTAAAAGAGAGACTCTGGA 302
Query 1185 ACTTCTTTACAGAATTACTAATGCACAGAATATAACAGTTATTGTCCAGAAAATGCTTGAATATTTACATCAGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 ACTTCTTTACAGAATTACTAATGCACAGAATATAACAGTTATTGTCCAGAAAATGCTTGAATATTTACATCAGA 376
Query 1259 GCAAAGAAGAGTATGTCATCGTCAATTTGGTCGGCAAAATAGCAGAGCTGGCTGAGAAATATGCTCCTGATAAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 GCAAAGAAGAGTATGTCATCGTCAATTTGGTCGGCAAAATAGCAGAGCTGGCTGAGAAATATGCTCCTGATAAT 450
Query 1333 GCATGGTTTATTCAGACAATGAATGCTGTGTTTTCAGTAGGAGGAGATGTAATGCATCCTGATATTCCCAATAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 GCATGGTTTATTCAGACAATGAATGCTGTGTTTTCAGTAGGAGGAGATGTAATGCATCCTGATATTCCCAATAA 524
Query 1407 CTTTCTGAGACTACTAGCGGAAGGTTTTGATGATGAAACAGAAGATCAGCAATTAAGACTCTATGCAGTTCAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 525 CTTTCTGAGACTACTAGCGGAAGGTTTTGATGATGAAACAGAAGATCAGCAATTAAGACTCTATGCAGTTCAGT 598
Query 1481 CTTATCTCACTTTACTGGATATGGAAAATGTGTTCTATCCACAGAGATTTCTTCAAGTTATGAGTTGGGTATTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 CTTATCTCACTTTACTGGATATGGAAAATGTGTTCTATCCACAGAGATTTCTTCAAGTTATGAGTTGGGTATTA 672
Query 1555 GGGGAATATTCCTACCTCTTAGATAAGGAAACGCCAGAGGAAGTTATAGCTAAGCTCTACAAGTTACTTATGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 GGGGAATATTCCTACCTCTTAGATAAGGAAACGCCAGAGGAAGTTATAGCTAAGCTCTACAAGTTACTTATGAA 746
Query 1629 TGACTCTGTGTCTTCAGAAACAAAAGCCTGGTTAATTGCTGCTGTGACCAAATTGACATCTCAGGCGCACTCTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 747 TGACTCTGTGTCTTCAGAAACAAAAGCCTGGTTAATTGCTGCTGTGACCAAATTGACATCTCAGGCGCACTCTT 820
Query 1703 CTAATACAGTTGAGAGATTAATCCATGAATTTACCATATCTTTGGATACTTGTATGAGACAACATGCATTTGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 CTAATACAGTTGAGAGATTAATCCATGAATTTACCATATCTTTGGATACTTGTATGAGACAACATGCATTTGAA 894
Query 1777 TTAAAACATTTGCATGAGAATGTGGAACTTATGAAGAGCTTGCTTCCAGTTGACAGGAGTTGTGAAGACTTGGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 TTAAAACATTTGCATGAGAATGTGGAACTTATGAAGAGCTTGCTTCCAGTTGACAGGAGTTGTGAAGACTTGGT 968
Query 1851 GGTAGATGCTTCTTTATCTTTTCTGGATGGTTTTGTGGCTGAAGGACTCAGTCAGGGTGCAGCGCCTTACAAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 GGTAGATGCTTCTTTATCTTTTCTGGATGGTTTTGTGGCTGAAGGACTCAGTCAGGGTGCAGCGCCTTACAAAC 1042
Query 1925 CTCCCCATCAACGCCAGGAGGAAAAGCTTTCTCAGGAAAAAGTTCTCAATTTTGAACCATATGGACTCTCCTTT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043 CTCCCCATCAACGCCAGGAGGAAAAGCTTTCTCAGGAAAAAGTTCTCAATTTTGAACCATATGGACTCTCCTTT 1116
Query 1999 TCTTCATCTGGCTTCACTGGACGACAGTCTCCTGCTGGCATTTCTCTTGGTTCAGATGTATCTGGGAATAGTGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 TCTTCATCTGGCTTCACTGGACGACAGTCTCCTGCTGGCATTTCTCTTGGTTCAGATGTATCTGGGAATAGTGC 1190
Query 2073 TGAGACAGGACTGAAAGAGACAAATAGCTTGAAGCTGGAAGGTATAAAGAAATTGTGGGGGAAAGAAGGCTATC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 TGAGACAGGACTGAAAGAGACAAATAGCTTGAAGCTGGAAGGTATAAAGAAATTGTGGGGGAAAGAAGGCTATC 1264
Query 2147 TTCCCAAGAAGGAAAGCAAAACTGGTGATGAAAGTGGAGCTCTGCCTGTTCCTCAAGAGAGTATAATGGAGAAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 TTCCCAAGAAGGAAAGCAAAACTGGTGATGAAAGTGGAGCTCTGCCTGTTCCTCAAGAGAGTATAATGGAGAAT 1338
Query 2221 GTAGATCAAGCTATAACTAAAAAGGATCAATCTCAAGTTCTTACCCAATCTAAAGAGGAGAAAGAAAAGCAGCT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 GTAGATCAAGCTATAACTAAAAAGGATCAATCTCAAGTTCTTACCCAATCTAAAGAGGAGAAAGAAAAGCAGCT 1412
Query 2295 GCTGGCATCATCATTATTTGTTGGTCTAGGATCAGAAAGTACAATCAACCTGCTGGGAAAAGCAGATACTGTCT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413 GCTGGCATCATCATTATTTGTTGGTCTAGGATCAGAAAGTACAATCAACCTGCTGGGAAAAGCAGATACTGTCT 1486
Query 2369 CTCACAAGTTCAGAAGGAAATCAAAAGTCAAAGAAGCTAAAAGTGGCGAAACAACCAGTACTCATAATATGACC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 CTCACAAGTTCAGAAGGAAATCAAAAGTCAAAGAAGCTAAAAGTGGCGAAACAACCAGTACTCATAATATGACC 1560
Query 2443 TGTTCTTCCTTTAGTTCTTTGTCAAATGTGGCATATGAAGATGATTATTATTCGAATACTTTGCACGATACAGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TGTTCTTCCTTTAGTTCTTTGTCAAATGTGGCATATGAAGATGATTATTATTCGAATACTTTGCACGATACAGG 1634
Query 2517 AGACAAGGAATTAAAGAAATTTTCTCTCACTTCAGAACTTTTGGATTCTGAGTCACTCACAGAACTGCCCTTGG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 AGACAAGGAATTAAAGAAATTTTCTCTCACTTCAGAACTTTTGGATTCTGAGTCACTCACAGAACTGCCCTTGG 1708
Query 2591 TTGAGAAATTCTCATATTGTAGTCTGTCTACACCTTCATTGTTTGCTAATAACAACATGGAAATTTTTCACCCT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 TTGAGAAATTCTCATATTGTAGTCTGTCTACACCTTCATTGTTTGCTAATAACAACATGGAAATTTTTCACCCT 1782
Query 2665 CCTCAATCTACTGCAGCCTCAGTTGCCAAGGAAAGCTCTTTAGCTTCATCTTTTTTGGAAGAAACTACTGAATA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 CCTCAATCTACTGCAGCCTCAGTTGCCAAGGAAAGCTCTTTAGCTTCATCTTTTTTGGAAGAAACTACTGAATA 1856
Query 2739 CATACACTCAAATGCTATGGAAGTCTGTAATAATGAAACTATATCAGTGTCTTCTTATAAAATTTGGAAAGATG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 CATACACTCAAATGCTATGGAAGTCTGTAATAATGAAACTATATCAGTGTCTTCTTATAAAATTTGGAAAGATG 1930
Query 2813 ATTGTTTATTGATGGTCTGGTCAGTCACTAATAAGAGTGGTTTGGAATTGAAAAGTGCTGACTTAGAAATTTTT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 ATTGTTTATTGATGGTCTGGTCAGTCACTAATAAGAGTGGTTTGGAATTGAAAAGTGCTGACTTAGAAATTTTT 2004
Query 2887 CCTGCAGAAAATTTCAAGGTGACTGAGCAACCTGGATGCTGTTTGCCTGTAATGGAAGCAGAAAGCACCAAAAG 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005 CCTGCAGAAAATTTCAAGGTGACTGAGCAACCTGGATGCTGTTTGCCTGTAATGGAAGCAGAAAGCACCAAAAG 2078
Query 2961 CTTTCAATATAGTGTGCAGATAGAAAAACCTTTTACAGAAGGAAATCTTACTGGTTTTATTAGTTATCATATGA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 CTTTCAATATAGTGTGCAGATAGAAAAACCTTTTACAGAAGGAAATCTTACTGGTTTTATTAGTTATCATATGA 2152
Query 3035 TGGATACTCATTCTGCTCAGCTGGAATTTTCTGTAAACTTATCACTATTAGATTTCATTAGACCATTAAAAATC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153 TGGATACTCATTCTGCTCAGCTGGAATTTTCTGTAAACTTATCACTATTAGATTTCATTAGACCATTAAAAATC 2226
Query 3109 TCAAGTGACGACTTTGGGAAACTCTGGTTATCCTTCGCAAATGATGTGAAACAAAATGTAAAAATGTCAGAATC 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2227 TCAAGTGACGACTTTGGGAAACTCTGGTTATCCTTCGCAAATGATGTGAAACAAAATGTAAAAATGTCAGAATC 2300
Query 3183 TCAAGCTGCACTTCCTTCTGCACTAAAGACTCTGCAACAGAAACTAAGACTCCATATTATTGAGATTATAGGCA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 TCAAGCTGCACTTCCTTCTGCACTAAAGACTCTGCAACAGAAACTAAGACTCCATATTATTGAGATTATAGGCA 2374
Query 3257 ATGAAGGGCTATTGGCCTGTCAGCTGCTCCCATCCATCCCCTGCTTACTGCATTGCCGAGTTCATGCAGATGTA 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2375 ATGAAGGGCTATTGGCCTGTCAGCTGCTCCCATCCATCCCCTGCTTACTGCATTGCCGAGTTCATGCAGATGTA 2448
Query 3331 TTAGCCCTGTGGTTCAGATCCTCCTGTTCTACTCTTCCTGACTATTTACTGTATCAGTGTCAAAAGGTGATGGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 TTAGCCCTGTGGTTCAGATCCTCCTGTTCTACTCTTCCTGACTATTTACTGTATCAGTGTCAAAAGGTGATGGA 2522
Query 3405 GGGATCC 3411
|||||||
Sbjct 2523 GGGATCC 2529
