Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02816
• Subject: NM_001321966.2
• Aligned Length: 1398
• Identities: 978
• Gaps: 420

Alignment

Query    1  ATGGGCTGGATCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGTCATTTTTTCCCTGGAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCCGGGATTTAAAAATTCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTTGAATATTTGAATTTAGCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACTTGACCTGACTGTGAATTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGCTCTTTCTCATGGGGAACC  370
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGGGGAACC  10

Query  371  CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA  84

Query  445  GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA  158

Query  519  AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  159  AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG  232

Query  593  AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  233  AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG  306

Query  667  AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307  AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT  380

Query  741  GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  381  GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC  454

Query  815  GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  455  GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG  528

Query  889  AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAAGCAGATCATCCTGGACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  529  AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAA------------------------------------------------  554

Query  963  TGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA  1036
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  ------------GTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA  616

Query 1037  AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA  690

Query 1111  ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT  764

Query 1185  GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  765  GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC  838

Query 1259  CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839  CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA  912

Query 1333  CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT  978