Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02816
• Subject: XM_017013297.1
• Aligned Length: 1398
• Identities: 1038
• Gaps: 360

Alignment

Query    1  ATGGGCTGGATCACAGAAGATCTTATTAGACGGAATGCTGAACACAACGACTGTGTCATTTTTTCCCTGGAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACTCTCGTTGCATCAGCAAGAAATAGAAAGACTAGAACACATTGATAAATGGTGCCGGGATTTAAAAATTCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATCTTCAAAATAATCTTATTGGGAAAATTGAAAATGTTAGCAAACTCAAGAAACTTGAATATTTGAATTTAGCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTAAACAACATTGAAAAAATAGAAAACTTGGAAGGATGTGAAGAGCTGGCAAAACTTGACCTGACTGTGAATTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CATTGGAGAGCTGAGCAGCATTAAAAACTTGCAGCACAATATCCATCTGAAGGAGCTCTTTCTCATGGGGAACC  370
                                                                            ||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------ATGGGGAACC  10

Query  371  CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   11  CATGTGCTTCCTTTGACCACTATAGGGAGTTCGTGGTAGCAACTCTTCCACAATTAAAGTGGTTGGATGGTAAA  84

Query  445  GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   85  GAAATAGAGCCTTCAGAAAGGATTAAGGCATTGCAGGACTATTCAGTAATTGAACCACAAATCAGAGAGCAGGA  158

Query  519  AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  159  AAAAGATCACTGTCTTAAACGAGCCAAACTCAAGGAAGAGGCTCAGAGGAAACACCAAGAAGAGGATAAAAATG  232

Query  593  AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  233  AAGACAAGAGAAGTAACGCAGGCTTTGATGGACGTTGGTACACAGACATCAATGCTACTCTTTCCTCTTTAGAG  306

Query  667  AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307  AGCAAAGACCACCTACAGGCACCAGACACAGAGGAACACAACACAAAGAAATTAGACAACAGTGAAGATGACTT  380

Query  741  GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  381  GGAATTCTGGAATAAGCCCTGTTTGTTTACTCCTGAATCAAGATTGGAAACTCTTAGACACATGGAAAAACAAC  454

Query  815  GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  455  GGAAGAAACAGGAAAAATTAAGTGAAAAAAAGAAGAAAGTGAAACCACCCAGGACTTTGATCACTGAAGATGGG  528

Query  889  AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAAGCAGATCATCCTGGACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  529  AAAGCCCTAAATGTGAATGAGCCCAAAATTGACTTCTCTTTGAAAGATAACGAAAAGCAGATCATCCTGGACCT  602

Query  963  TGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  603  TGCTGTCTATAGGTATATGGATACCTCTTTAATCGATGTTGATGTGCAACCAACTTACGTGCGAGTAATGATCA  676

Query 1037  AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  AAGGAAAGCCATTTCAGCTTGTCCTTCCTGCAGAAGTGAAACCCGATAGTAGTTCTGCTAAAAGATCTCAGACA  750

Query 1111  ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  751  ACGGGTCATTTGGTCATCTGCATGCCCAAGGTAGGAGAAGTAATCACAGGTGGTCAGCGAGCATTCAAATCTAT  824

Query 1185  GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  GAAAACTACCTCGGACAGGAGCAGAGAACAAACAAATACAAGAAGCAAGCACATGGAGAAACTAGAAGTAGACC  898

Query 1259  CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  CTAGCAAGCACTCATTCCCTGATGTGACTAACATAGTTCAAGAGAAAAAACACACACCCAGAAGACGACCTGAA  972

Query 1333  CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  CCCAAAATTATACCAAGTGAGGAAGACCCAACCTTTGAAGACAACCCTGAAGTGCCTCCGCTGATT  1038