Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02903
• Subject: NM_001039386.1
• Aligned Length: 1604
• Identities: 1427
• Gaps: 28

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAG------CGGTGTTCAGGGGCTAC  720
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||      ||||.||||||||||||
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGCCATCTCGGTATTCAGGGGCTAC  732

Query  721  GCGGAGAGGAAGCGCCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCG  794
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  GCGGAGAGGAAGCGTCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCG  806

Query  795  CATGGTCGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGA  868
            ||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CATGGTTGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGTCGCGAACGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGA  880

Query  869  GCGACCCCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGC  942
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  881  GCGACCCCACCCCTATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGC  954

Query  943  ACGCTGGACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGA  1016
            ||.|||||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||
Sbjct  955  ACCCTGGATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGA  1028

Query 1017  AGGCTTCGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCC  1090
            .||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1029  GGGCTTCTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCC  1102

Query 1091  GCCGGGATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAG  1164
            ||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1103  GCAGAGATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAA  1176

Query 1165  ATAGAGAGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCC  1238
            |||||||.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1177  ATAGAGAAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGGCGGCCC  1250

Query 1239  TGGACACCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACT  1312
            |||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1251  TGGACACCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATCCACT  1324

Query 1313  TCTGGAAGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTAC  1386
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  TCTGGAAGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAATGTCATCCACATCATGGGCTGCTAC  1398

Query 1387  ATTCTGGGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTT  1460
            ||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||
Sbjct 1399  ATTCTGGGGAACCCTAACGGGGAGAAGCTATTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACCCCTTACAAGGTTACCTT  1472

Query 1461  CGAGTCACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCC  1534
            .|||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1473  TGAGTCGCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACCTACTTTGACTTCCGGCTGTACCGCC  1546

Query 1535  TGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1584
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1547  TGTGGAAGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCTG  1596