Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02920
• Subject: NM_001018069.2
• Aligned Length: 1224
• Identities: 1161
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC  74

Query   75  GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG  148

Query  149  GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC  222

Query  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT  296

Query  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA  370

Query  371  TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA  444

Query  445  GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG  518

Query  519  GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592

Query  593  GAAGTGATAGATC------------------TGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCAC  648
            |||||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGTGATAGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCAC  666

Query  649  AACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAACAGAGTCCCCCAAATACATTCAGAAACAAATATCTTATAATTACAG  722
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  667  AACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAAC---------------------------------------------  695

Query  723  TGACTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAA  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  TGACTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAA  769

Query  797  ATAAGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  ATAAGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATT  843

Query  871  CAAAATAAGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAA  944
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Sbjct  844  CAAAATAAGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAA  917

Query  945  GGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  GGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGA  991

Query 1019  AGCCAGCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGG  1092
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Sbjct  992  AGCCAGCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGG  1065

Query 1093  GGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGC  1166
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Sbjct 1066  GGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGC  1139

Query 1167  TCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT  1206
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Sbjct 1140  TCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT  1179