Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02929
• Subject: XM_017014615.2
• Aligned Length: 1362
• Identities: 1167
• Gaps: 195

Alignment

Query    1  ATGGAGAGAAAGGACTTTGAGACATGGCTTGATAACATTTCTGTTACATTTCTTTCTCTGACGGACTTGCAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAGAAAGGACTTTGAGACATGGCTTGATAACATTTCTGTTACATTTCTTTCTCTGACGGACTTGCAGAA  74

Query   75  AAATGAAACTCTGGATCACCTGATTAGTCTGAGTGGGGCAGTCCAGCTCAGGCATCTCTCCAATAACCTAGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAATGAAACTCTGGATCACCTGATTAGTCTGAGTGGGGCAGTCCAGCTCAGGCATCTCTCCAATAACCTAGAGA  148

Query  149  CTCTCCTCAAGCGGGACTTCCTCAAACTCCTTCCCCTGGAGCTCAGTTTTTATTTGTTAAAATGGCTCGATCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCTCCTCAAGCGGGACTTCCTCAAACTCCTTCCCCTGGAGCTCAGTTTTTATTTGTTAAAATGGCTCGATCCT  222

Query  223  CAGACTTTACTCACATGCTGCCTCGTCTCTAAACAGTGGAATAAGGTGATAAGTGCCTGTACAGAGGTGTGGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGACTTTACTCACATGCTGCCTCGTCTCTAAACAGTGGAATAAGGTGATAAGTGCCTGTACAGAGGTGTGGCA  296

Query  297  GACTGCATGTAAAAATTTGGGCTGGCAGATAGATGATTCTGTTCAGGACGCTTTGCACTGGAAGAAGGTTTATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACTGCATGTAAAAATTTGGGCTGGCAGATAGATGATTCTGTTCAGGACGCTTTGCACTGGAAGAAGGTTTATT  370

Query  371  TGAAGGCTATTTTGAGAATGAAGCAACTGGAGGACCATGAAGCCTTTGAAACCTCGTCATTAATTGGACACAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGGCTATTTTGAGAATGAAGCAACTGGAGGACCATGAAGCCTTTGAAACCTCGTCATTAATTGGACACAGT  444

Query  445  GCCAGAGTGTATGCACTTTACTACAAAGATGGACTTCTCTGTACAGGGTCAGATGACTTGTCTGCAAAGCTGTG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct  445  GCCAGAGTGTATGCACTTTACTACAAAGATGGACTTCTCTGTACA-----------------------------  489

Query  519  GGATGTGAGCACAGGGCAGTGCGTTTATGGCATCCAGACCCACACTTGTGCAGCGGTGAAGTTTGATGAACAGA  592
                                                                                      
Sbjct  490  --------------------------------------------------------------------------  489

Query  593  AGCTTGTGACAGGCTCCTTTGACAACACTGTGGCTTGCTGGGAATGGAGTTCCGGAGCCAGGACCCAGCACTTT  666
                                                                                      
Sbjct  490  --------------------------------------------------------------------------  489

Query  667  CGGGGGCACACGGGGGCGGTATTTAGCGTGGACTACAATGATGAACTGGATATCTTGGTGAGCGGCTCTGCAGA  740
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  ------------------GTATTTAGCGTGGACTACAATGATGAACTGGATATCTTGGTGAGCGGCTCTGCAGA  545

Query  741  CTTCACTGTGAAAGTATGGGCTTTATCTGCTGGGACATGCCTGAACACACTCACCGGGCACACGGAATGGGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  CTTCACTGTGAAAGTATGGGCTTTATCTGCTGGGACATGCCTGAACACACTCACCGGGCACACGGAATGGGTCA  619

Query  815  CCAAGGTAGTTTTGCAGAAGTGCAAAGTCAAGTCTCTCTTGCACAGTCCTGGAGACTACATCCTCTTAAGTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  CCAAGGTAGTTTTGCAGAAGTGCAAAGTCAAGTCTCTCTTGCACAGTCCTGGAGACTACATCCTCTTAAGTGCA  693

Query  889  GACAAATATGAGATTAAGATTTGGCCAATTGGGAGAGAAATCAACTGTAAGTGCTTAAAGACATTGTCTGTCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  GACAAATATGAGATTAAGATTTGGCCAATTGGGAGAGAAATCAACTGTAAGTGCTTAAAGACATTGTCTGTCTC  767

Query  963  TGAGGATAGAAGTATCTGCCTGCAGCCAAGACTTCATTTTGATGGCAAATACATTGTCTGTAGTTCAGCACTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  TGAGGATAGAAGTATCTGCCTGCAGCCAAGACTTCATTTTGATGGCAAATACATTGTCTGTAGTTCAGCACTTG  841

Query 1037  GTCTCTACCAGTGGGACTTTGCCAGTTATGATATTCTCAGGGTCATCAAGACTCCTGAGATAGCAAACTTGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  GTCTCTACCAGTGGGACTTTGCCAGTTATGATATTCTCAGGGTCATCAAGACTCCTGAGATAGCAAACTTGGCC  915

Query 1111  TTGCTTGGCTTTGGAGATATCTTTGCCCTGCTGTTTGACAACCGCTACCTGTACATCATGGACTTGCGGACAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  TTGCTTGGCTTTGGAGATATCTTTGCCCTGCTGTTTGACAACCGCTACCTGTACATCATGGACTTGCGGACAGA  989

Query 1185  GAGCCTGATTAGTCGCTGGCCTCTGCCAGAGTACAGGAAATCAAAGAGAGGCTCAAGCTTCCTGGCAGGCGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  GAGCCTGATTAGTCGCTGGCCTCTGCCAGAGTACAGGAAATCAAAGAGAGGCTCAAGCTTCCTGGCAGGCGAAG  1063

Query 1259  CATCCTGGCTGAATGGACTGGATGGGCACAATGACACGGGCTTGGTCTTTGCCACCAGCATGCCTGACCACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064  CATCCTGGCTGAATGGACTGGATGGGCACAATGACACGGGCTTGGTCTTTGCCACCAGCATGCCTGACCACAGT  1137

Query 1333  ATTCACCTGGTGTTGTGGAAGGAGCACGGC  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138  ATTCACCTGGTGTTGTGGAAGGAGCACGGC  1167