Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_03366
Subject:
NM_001282150.1
Aligned Length:
642
Identities:
557
Gaps:
84

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGAGCAGGTGTGCTCTCAGAGGGCGGGATTTGGCGCTTGCAATTGCTGGAACTGTTTCTTTCCACGGGTTGCT  74

Query   1  ----------ATGGCTGGGCACAGATTGGTGTTGGTATTAGGAGATCTGCACATCCCACACCGGTGCAACAGTT  64
                     |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACGCCTCTTTAGGGCTGGGCACAGATTGGTGTTGGTATTAGGAGATCTGCACATCCCACACCGGTGCAACAGTT  148

Query  65  TGCCAGCTAAATTCAAAAAACTCCTGGTGCCAGGAAAAATTCAGCACATTCTCTGCACAGGAAACCTTTGCACC  138
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGCCAGCTAAATTCAAAAAACTCCTGGTGCCAGGAAAAATTCAGCACATTCTCTGCACAGGAAACCTTTGCACC  222

Query 139  AAAGAGAGTTATGACTATCTCAAGACTCTGGCTGGTGATGTTCATATTGTGAGAGGAGACTTCGATGAGAATCT  212
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAAGAGAGTTATGACTATCTCAAGACTCTGGCTGGTGATGTTCATATTGTGAGAGGAGACTTCGATGAGAATCT  296

Query 213  GAATTATCCAGAACAGAAAGTTGTGACTGTTGGACAGTTCAAAATTGGTCTGATCCATGGACATCAAGTTATTC  286
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GAATTATCCAGAACAGAAAGTTGTGACTGTTGGACAGTTCAAAATTGGTCTGATCCATGGACATCAAGTTATTC  370

Query 287  CATGGGGAGATATGGCCAGCTTAGCCCTGTTGCAGAGGCAATTTGATGTGGACATTCTTATCTCGGGACACACA  360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CATGGGGAGATATGGCCAGCTTAGCCCTGTTGCAGAGGCAATTTGATGTGGACATTCTTATCTCGGGACACACA  444

Query 361  CACAAATTTGAAGCATTTGAGCATGAAAATAAATTCTACATTAATCCAGGTTCTGCCACTGGGGCATATAATGC  434
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CACAAATTTGAAGCATTTGAGCATGAAAATAAATTCTACATTAATCCAGGTTCTGCCACTGGGGCATATAATGC  518

Query 435  CTTGGAAACAAACATTATTCCATCATTTGTGTTGATGGATATCCAGGCTTCTACAGTGGTCACCTATGTGTATC  508
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CTTGGAAACAAACATTATTCCATCATTTGTGTTGATGGATATCCAGGCTTCTACAGTGGTCACCTATGTGTATC  592

Query 509  AGCTAATTGGAGATGATGTGAAAGTAGAACGAATCGAATACAAAAAACCT  558
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGCTAATTGGAGATGATGTGAAAGTAGAACGAATCGAATACAAAAAACCT  642