Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_03795
• Subject: XM_006516246.2
• Aligned Length: 1576
• Identities: 1162
• Gaps: 212

Alignment

Query    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCGTGGACCAGCATGGCTCTTGCTGCCTCTGGCATCTACTTCTACAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||..|||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGAAAGGCTCTCAAGCTTGCTTCATGGACCAGCGTGGCTCTTGCTGCCTCCGGTGTCTACCTCTACAG  74

Query   75  TAACAAGTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCAGTTGCTACGACGGCTGTCATCA  148
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TAACAACTACTTGGACCCTAATGACTTTGGCGCTGTCAGGGTGGGCAGAGCTGTTGCTACGACAGCTGTCATCA  148

Query  149  GTTACGACTACCTCACTTCCCTGAAGAGTGTCCCTTATGGCTCAGAGGAGTACTTGCAGCTGAGATCTAAGGTG  222
            |.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||.||||||||.|||||                
Sbjct  149  GCTATGACTACCTCACCTCCCTGAGGAGTGTCCCATATGGCTCTGAGGAGTATTTGCA----------------  206

Query  223  CACCTTCGCTCTGCCAGGCGTCTCTGTGAGCTCTGCTGTGCCAACCGGGGCACCTTCATCAAGGTGGGCCAGCA  296
                             |||||                                                    
Sbjct  207  -----------------GCGTC----------------------------------------------------  211

Query  297  CCTGGGGGCTCTGGACTACCTGTTGCCAGAGGAGTACACCAGCACGCTGAAGGTACTGCACAGCCAGGCTCCAC  370
                                                                                      
Sbjct  212  --------------------------------------------------------------------------  211

Query  371  AGAGCAGCATGCAAGAGATCCGCCAGGTCATCCGAGAAGATCTGGGCAAGGAGATCCATGATTTGTTCCAGAGC  444
                            |||||                             .|||||||.||||||||||.||||
Sbjct  212  ----------------GATCC-----------------------------CAGATCCACGATTTGTTCCTGAGC  240

Query  445  TTCGATGACACCCCTCTGGGGACGGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCAGTGCTGCATGATGGGCGGACGGT  518
            |||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||
Sbjct  241  TTCGATGACACCCCTCTTGGGGCAGCCTCCCTGGCCCAGGTCCACAAGGCGGTGTTGCATGATGGTCGGACAGT  314

Query  519  GGCCGTGAAGGTCCAGCACCCAAAGGTGCGGGCTCAGAGCTCGAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTCGTTC  592
            |||.||.||||||||||||||.|||||.|.||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  315  GGCAGTTAAGGTCCAGCACCCGAAGGTTCAGGCTCAAAGCTCTAAGGACATTCTCCTGATGGAGGTGCTTGTCC  388

Query  593  TGGCTGTGAAGCAGCTGTTCCCAGAGTTTGAGTTTATGTGGCTTGTGGATGAAGCCAAGAAGAACCTGCCTTTG  666
            ||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.
Sbjct  389  TGGCCGTGAAGCAACTTTTCCCAGATTTTGAATTCATGTGGCTGGTGGATGAAGCGAAGAAGAACCTGCCTCTC  462

Query  667  GAGCTGGATTTCCTCAATGAAGGGAGGAATGCTGAGAAGGTGTCCCAGATGCTCAGGCATTTTGACTTCTTGAA  740
            |||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||.|.||
Sbjct  463  GAGTTGGACTTCCTGAATGAAGGGAGGAACGCTGAGAAAGTGGCCCACATGCTCAGGCACTTTGACTTCCTAAA  536

Query  741  GGTCCCCCGAATCCACTGGGACCTGTCCACGGAGCGGGTCCTCCTGATGGAGTTTGTGGATGGCGGGCAGGTCA  814
            |||.||||..|||||||||||.|||||.||..||.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||
Sbjct  537  GGTTCCCCAGATCCACTGGGAGCTGTCTACCAAGAGGGTGCTCCTGATGGAATTTGTAGAGGGAGGTCAAGTCA  610

Query  815  ATGACAGAGACTACATGGAGAGGAACAAGATCGACGTCAATGAGATCTCACGCCACCTGGGCAAGATGTATAGT  888
            |.|||||.|.|||||||||||.||||.|||||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct  611  ACGACAGGGCCTACATGGAGAAGAACCAGATCGATGTGAATGAGATCTCCTGCCACCTGGGCAAGATGTACAGT  684

Query  889  GAGATGATCTTCGTCAATGGCTTCGTGCACTGCGATCCCCACCCCGGCAATGTACTGGTGCGGAAGCACCCCGG  962
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||..||.|.
Sbjct  685  GAGATGATCTTTGTCAATGGCTTCGTGCACTGTGACCCCCACCCAGGCAACGTACTGGTACGGAAGCGTCCTGA  758

Query  963  CACGGGAAAGGCGGAGATTGTCCTGTTGGACCATGGGCTTTACCAGATGCTCACGGAAGAATTCCGCCTGAATT  1036
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct  759  CACGGGCAAGGCTGAGATTGTCCTCTTAGACCATGGGCTTTACCAGGTGCTCACGGAGGAGTTCCGCCTGGACT  832

Query 1037  ACTGCCACCTCTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGAAGAGAGTGAAGGAGTACAGCCAGCGACTGGGAGCC  1110
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|..|..||||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct  833  ACTGCCATCTGTGGCAGTCTCTGATCTGGACTGACATGGACGGGCTGAAACAGTACAGCCAGCGCCTGGGAGCT  906

Query 1111  GGGGATCTCTACCCCTTGTTTGCCTGCATGCTGACGGCGCGATCGTGGGACTCGGTC-AACAGAGGCATCAGCC  1183
            |..||.||||||||..||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||| ||||| |||||..|.|
Sbjct  907  GCAGACCTCTACCCACTGTTTGCCTGTATGCTGACAGCCCGGTCCTGGGACTCAGTCAAACAG-GGCATTGGGC  979

Query 1184  AAGCTCCCGTCACTGCCACTGAGGACTTAGAGATTCGCAACAACGCGGCCAACTACCTCCCCCAGATCAGCCAT  1257
            |||||||.|||.||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||..||||||.||..||||||||||.
Sbjct  980  AAGCTCCAGTCTCTGCTACTGAGGACTCAGAGATTCGCAATAATGCAGCCTGCTACCTGCCTGAGATCAGCCAG  1053

Query 1258  CTCCTCAACCACGTGCCGCGCCAGATGCTGCTCATCTTGAAGACCAACGACCTGCTGCGTGGCATTGAGGCCGC  1331
            |||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||.|||.||||||||.||.|
Sbjct 1054  CTCCTTAACCATGTGCCTCGCCAGATGCTGCTCATCCTGAAGACTAATGATCTACTCCGTAGCATTGAGACCAC  1127

Query 1332  CCTGGGCACCCGCGCCAGCGCCAGCTCCTTTCTCAACATGTCACGTTGCTGCATCAGAGCGCTAGCTGAGCACA  1405
            |||||||||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1128  CCTGGGCACGCGCTCCAGTGCCAGTTCCTTCCTCAACATGTCTCGGTGTTGTATCAGGGCGCTGGCTGAACACA  1201

Query 1406  AGAAGAAGAATACCTGTTCATTCTTCAGAAGGACCCAGATCTCTTTCAGCGAGGCCTTCAACTTATGGCAGATC  1479
            ||||||.|.||.||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.|.|.|||||||||
Sbjct 1202  AGAAGAGGGATGCCGGCTCTTTCTTCAGAAGGACTCAGATATCTTTCAGTGAGGCCTTTAGCCTGTGGCAGATC  1275

Query 1480  AACCTCCATGAGCTCATCCTGCGTGTGAAGGGGTTGAAGCTGGCTGACCGGGTCTTGGCCCTAATATGCTGGCT  1553
            |||||.|||||.||..|.||.||.||||.||..||||.|||.|||..|.||||||..||.||..|..|||||||
Sbjct 1276  AACCTTCATGAACTTCTGCTTCGAGTGAGGGCCTTGAGGCTAGCTTGCTGGGTCTCAGCTCTCCTGGGCTGGCT  1349

Query 1554  GTTCCCTGCTCCACTC------  1569
            |...|..|||||||.|      
Sbjct 1350  GACTCGGGCTCCACACAGAATG  1371