Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03803
- Subject:
- XM_006716065.2
- Aligned Length:
- 1274
- Identities:
- 1062
- Gaps:
- 184
Alignment
Query 1 ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC 74
Query 75 TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA 148
Query 149 GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA 222
Query 223 AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA 296
Query 297 ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG 370
Query 371 AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC 444
Query 445 TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG 518
Query 519 AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA 592
Query 593 GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG 666
Query 667 ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT 740
Query 741 GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG 814
Query 815 GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC 888
Query 889 TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGAATGTCGTACT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.||.
Sbjct 889 TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGA-----GAACC 957
Query 963 CT----------CAGGAGGCTCCACCA--TGTTCAGGGATTTCGGACGCCGACTGCAGAGGGATTTGAAGAGAG 1024
|| |.|...||.|||||| ||.|| |.|||| ||| |||
Sbjct 958 CTGACTGGCACACTGCCCGCACCACCAACTGCTC-----TCTCGG--GCC-----CAG---------------- 1003
Query 1025 TGGTG--GATGCTAGGCTG-AGGCTCAGCGAGGAGCTCAGCGGCGGGAGGATCAAGCCGAAGC-CTGTGGAGGT 1094
|||| |||| ||.|| ||.| ||| |||||.|| || .|
Sbjct 1004 -GGTGGCGATG---GGTTGTAGCC----------GCT------------------GCCGATGCTCT------TT 1039
Query 1095 CCAGGTGGTCACGCATCACATGCAGCGCTACGCCGTGTGGTTCGGAGGCTCCATGCTGGCCTCGACTCCCGAGT 1168
||...|||| || ||.||||||| |||.|
Sbjct 1040 CCTTCTGGT---GC--CAGATGCAGC--------------TTCAG----------------------------- 1065
Query 1169 TCTTTCAGGTCTGCCACACCAA----GAAGGACTATGAAGAGTACGGGCCCAGCATCTGCCGCCACAACCCCGT 1238
|.||| |||| ||| |..||||..|||.||.| ||...||||| ||
Sbjct 1066 --TATCA--TCTG------CAAGTTGGGGGGACCGTGATGATT--GGAGTCAGCA-CT---------------- 1110
Query 1239 CTTTGGAGTCATGTCC 1254
Sbjct 1111 ---------------- 1110