Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_03868
- Subject:
- XM_006516164.3
- Aligned Length:
- 2586
- Identities:
- 2327
- Gaps:
- 72
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGTCTTTTCCACCTCA 17
||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGGACAGACAGAGAAAAGAGGGTCTTTGCCAACTCCTTTGGACTGGTGCAGTCAGAATGTCTTTCCCCCCTCA 74
Query 18 TTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCACTCCCACCAGGGATCCCACCCCCGCAGTTTCCAGGATTTCCTC 91
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 TTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCTCTCCCTCCAGGGATCCCACCCCCACAGTTTCCTGGCTTTCCTC 148
Query 92 CACCTGTACCTCCAGGGACCCCAATGATTCCTGTACCAATGAGCATTATGGCTCCTGCTCCAACTGTCTTAGTA 165
||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 149 CACCAGTACCTCCAGGGACACCGATGATTCCTGTACCAATGAGTATTATGGCTCCTGCTCCAACTGTCCTAGTA 222
Query 166 CCCACTGTGTCTATGGTTGGAAAGCATTTGGGCGCAAGAAAGGATCATCCAGGCTTAAAGGCTAAAGAAAATGA 239
||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||....|||||||||||
Sbjct 223 CCTACCGTGTCCATGGTTGGAAAGCATTTGGGAGCCAGAAAGGATCATCCAGGCTTAAAATTAAAAGAAAATGA 296
Query 240 TGAAAATTGTGGTCCTACTACCACTGTTTTTGTTGGCAACATTTCCGAGAAAGCTTCAGACATGCTTATAAGAC 313
||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct 297 TGAAAATTGTGGCCCTACTACTACAGTTTTTGTTGGGAACATTTCTGAGAAGGCTTCAGACATGCTTATACGAC 370
Query 314 AACTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTTTTGAGCTGGAAGAGAGTACAAGGTGCTTCCGGAAAGCTTCAAGCCTTC 387
|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.
Sbjct 371 AGCTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTGTTGAGCTGGAAGAGAGTGCAAGGTGCTTCTGGGAAACTTCAAGCTTTT 444
Query 388 GGATTCTGTGAGTACAAGGAGCCAGAATCTACCCTCCGTGCACTCAGATTATTACATGACCTGCAAATTGGAGA 461
|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 445 GGATTTTGTGAGTATAAAGAGCCTGAATCTACCCTCCGTGCTCTCAGATTATTGCATGACCTTCAGATTGGAGA 518
Query 462 GAAAAAGCTACTCGTTAAAGTTGATGCAAAGACAAAGGCACAGCTGGATGAATGGAAAGCAAAGAAGAAAGCTT 535
|||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAGAAGCTACTTGTTAAAGTTGATGCCAAGACAAAGGCACAGTTGGATGAATGGAAAGCAAAGAAGAAAG--- 589
Query 536 CTAATGGGAATGCAAGGCCAGAAACTGTCACTAATGACGATGAAGAAGCCTTGGATGAAGAAACAAAGAGGAGA 609
||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 590 CTAATGGGAACGCCAGACCAGAAACTGTCACTAATGATGATGAAGAAGCCTTAGATGAAGAAACAAAGCGAAGA 663
Query 610 GATCAGATGATTAAAGGGGCTATTGAAGTTTTAATTCGTGAATACTCCAGTGAGCTAAATGCCCCCTCACAGGA 683
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GACCAGATGATTAAAGGGGCCATTGAAGTTTTAATCCGAGAATATTCCAGTGAACTAAATGCCCCCTCACAGGA 737
Query 684 ATCTGATTCTCACCCCAGGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGCAGATTTCCAGTGGCCCCAC 757
.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct 738 GTCTGACTCTCACCCCAGAAAGAAGAAAAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGTAGATTTCCAGTGGCCCCAT 811
Query 758 TGATCCCTTATCCACTCATCACTAAGGAGGATATAAATGCTATAGAAATGGAAGAAGACAAAAGAGACCTGATA 831
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 812 TGATCCCTTACCCACTCATCACCAAGGAGGATATAAATGCTATTGAAATGGAAGAAGACAAAAGAGATTTGATA 885
Query 832 TCTCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGACACACATAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGCAAAAAGGAAAAAGAAAG 905
||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 886 TCCCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGATACACACAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGCAAAAAAGAAAAAGAAAG 959
Query 906 ACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAGCGTGAAAGGGAACGAGAAAGGCGAGAACGGGAAC 979
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 ACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAACGTGAAAGGGAACGAGAAAGGCGAGAACGGGAAC 1033
Query 980 GAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAGAAAGAACGGGAGCGGGAACGAGAACGGGATAGGGACCGT 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1034 GAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAAAAAGAACGGGAGCGGGAACGAGAACGGGATAGGGATCGT 1107
Query 1054 GACCGGACAAAAGAGAGAGACCGAGATCGGGATCGAGAGAGAGATCGTGACCGGGATAGAGAAAGGAGCTCAGA 1127
|||||.|||||||||||||||||| |||||||||||||||||.|||||.|||.|||||.||||||||||
Sbjct 1108 GACCGCACAAAAGAGAGAGACCGA------GATCGAGAGAGAGATCGGGACCGAGATCGAGAACGGAGCTCAGA 1175
Query 1128 TCGTAATAAGGATCGCAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACGAGAGCGGGAAAGAGAGA 1201
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |
Sbjct 1176 TCGAAATAAGGATCGGAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACGGGAGCGGGAA------A 1243
Query 1202 GAGAGAGAGAACGAGAGCGAGAACGAGAACGGGAGCGAGAGAGAGAGCGAGAGAGGGAACGGGAGCGAGAAAGA 1275
||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1244 GAGAGAGAGAACGAGAACGGGAACGAGAACGAGAGCGAGAGAGAGAACGGGAGAGAGAACGGGAACGGGAAAGA 1317
Query 1276 GAAAAAGACAAAAAACGGGACCGAGAAGAAGATGAAGAAGATGCATACGAACGAAGAAAACTTGAAAGAAAACT 1349
||.||||||||.|||.|.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1318 GAGAAAGACAAGAAAAGAGACAGAGAAGAGGATGAAGAAGATGCATATGAACGAAGAAAACTCGAACGAAAACT 1391
Query 1350 CCGAGAGAAAGAAGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACGAAAGAAAACCCGGGAAT 1423
.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 1392 GCGAGAGAAAGAGGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACGAAAGAAAACTAGGGAAT 1465
Query 1424 ATGAGAAAGAAGCTGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCCAAAGAAGCTAAACGACTAAAAGAATTC 1497
|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 ATGAGAAGGAGGCAGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCTAAGGAGGCTAAACGACTAAAAGAATTC 1539
Query 1498 TTAGAAGACTATGATGATGATAGAGATGACCCCAAATATTACAGAGGAAGTGCTCTTCAGAAAAGGTTGCGTGA 1571
.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1540 CTAGAAGATTATGATGATGATAGAGATGACCCGAAGTACTACAGGGGTAGTGCTCTTCAGAAACGGTTGCGTGA 1613
Query 1572 TAGAGAAAAGGAAATGGAAGCAGATGAACGAGATAGGAAGAGAGAGAAGGAGGAGCTTGAGGAAATCAGGCAGC 1645
|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 TAGGGAAAAAGAAATGGAAGCTGATGAACGAGACAGGAAGAGAGAGAAGGAAGAGCTTGAGGAAATCAGGCAGC 1687
Query 1646 GCCTTCTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAGAGGCTGAGAGGCGCAGG 1719
||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 GCTTACTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAGAGGCTGAGAGGCGCAGG 1761
Query 1720 CAGCCACAAATAAAGCAAGAGCCAGAATCAGAAGAGGAGGAAGAAGAAAAGCAAGAAAAAGAAGAAAAACGAGA 1793
||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 CAACCTCAAATAAAGCAAGAACCAGAATCCGAGGAAGAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAAAGAAGAAAAACGAGA 1835
Query 1794 AGAACCCATGGAAGAGGAAGAGGAGCCAGAGCAAAAGCCTTGTCTGAAACCTACTCTGAGGCCCATCAGCTCTG 1867
.||.||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct 1836 GGAGCCTGTGGAAGAGGAGGAAGAACCAGAGCAAAAGCCTTGTCTCAAGCCGACTTTGAGACCCATCAGCTCTG 1909
Query 1868 CTCCATCTGTTTCCTCTGCCAGTGGCAATGCAACACCTAACACTCCTGGGGATGAGTCTCCCTGTGGTATTATT 1941
|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1910 CCCCATCTGTGTCCTCTGCCAGTGGCAACGCAACCCCCAACACTCCTGGGGATGAGTCTCCTTGTGGTATTATT 1983
Query 1942 ATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAACCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATAGGACTAAGTCTTAAACT 2015
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 1984 ATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAGCCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATAGGACTAAGCCTTAAATT 2057
Query 2016 GGGTGCTTCCAATAGTCCTGGTCAGCCTAATTCTGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGTAGATAGTGTCTTTAACA 2089
|||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058 GGGTGCTTCCAATAGTCCTGGCCAACCTAATTCAGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGTAGATAGTGTCTTTAACA 2131
Query 2090 AATTTGAGGATGAAGACAGTGATGACGTACCCCGAAAAAGGAAACTGGTTCCCTTGGATTATGGTGAAGATGAT 2163
||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 2132 AATTCGAGGATGAGGACAGTGATGATGTGCCCCGAAAAAGGAAACTCGTTCCCCTGGATTATGGCGAAGATGAT 2205
Query 2164 AAAAATGCAACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGTAAACACATTAAGAGTCTCATTGAGAAAATCCC 2237
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2206 AAAAATGCCACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGCAAACACATTAAGAGTCTCATTGAGAAAATTCC 2279
Query 2238 TACAGCCAAACCTGAGCTCTTCGCTTATCCCCTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTATACTGATGGAACGTCGAA 2311
.||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 2280 CACAGCCAAACCTGAGCTCTTTGCTTATCCTTTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTATACTGATGGAACGAAGAA 2353
Query 2312 TTAGACCATGGATTAATAAGAAAATCATAGAATATATAGGTGAAGAAGAAGCTACATTAGTTGATTTTGTTTGT 2385
|..|.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2354 TCCGGCCATGGATCAATAAGAAAATCATCGAATACATAGGTGAAGAAGAAGCTACATTAGTTGATTTTGTTTGC 2427
Query 2386 TCTAAGGTTATGGCTCATAGTTCACCCCAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTACTTGATGAAGAAGCAGA 2459
||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2428 TCTAAGGTTATGGCACATAGTTCACCACAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTACTAGATGAAGAAGCAGA 2501
Query 2460 AGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAATTGGTCTTGTGAAG 2529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2502 AGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAATTGGCCTTGTGAAG 2571