Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04050
• Subject: NM_175123.4
• Aligned Length: 1011
• Identities: 874
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGCTGAGTCCGGAGCGCCTAGCCCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGCGACATGTCCTCACCTACATGGA  74
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAGTCCCGAGCGCCTAGCTCTACCGGACTACGAGTATCTGGCTCAGAGACATGTCCTCACGTACATGGA  74

Query   75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTAGAAAACAGGGAAGATATTAGCCAATATGGAATTGCCAGGTTCTTCACTGAAT  148
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|
Sbjct   75  GGATGCAGTGTGCCAGCTGCTGGAGAACAGGGAGGATATTAGCCAGTATGGCATTGCCCGGTTCTTCACTGACT  148

Query  149  ATTTTAACAGTGTATGCCAGGGAACACACATTCTCTTTCGAGAATTCAGCTTCGTCCAAGCCACCCCCCACAAT  222
            ||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||.|||
Sbjct  149  ATTTTAACAGCGTATGCCAAGGAACTCACATTCTCTTCCGGGAATTCAGCTTTATACAAGCCACACCTCATAAT  222

Query  223  AGGGTATCATTTTTACGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTGGGCAAAAATGGCGATTTGCTGACCATGAA  296
            ||.|.||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..||||||||||||.
Sbjct  223  AGAGCATCATTCCTTCGGGCCTTCTGGAGATGCTTCCGAACTGTAGGGAAAAATGGTGACCTGCTGACCATGAG  296

Query  297  AGAATATCACTGTTTGCTGCAATTACTGTGTCCTGATTTCCCGCTGGAGCTCACTCAGAAAGCAGCCAGGATTG  370
            .||.||.||||||.|||||||.|||.||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GGAGTACCACTGTCTGCTGCAGTTATTGTGCCCAGACTTCCCGCTGGAGCTTACTCAGAAAGCCGCCAGGATTG  370

Query  371  TGCTCATGGACGATGCCATGGACTGCTTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTCTTTGCCTTCCAGATCCAGTTTTAC  444
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TGCTCATGGATGATGCCATGGACTGCCTGATGTCTTTTTCAGATTTCCTTTTCGCCTTCCAGATCCAGTTTTAT  444

Query  445  TACTCAGAATTCCTGGACAGTGTGGCTGCCATCTATGAGGACCTGCTGTCAGGCAAGAACCCCAACACAGTGAT  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  TACTCAGAATTCCTGGAGAGTGTGGCTGCCATCTATCAGGACTTGCTATCTGGGAAAAACCCCAATACAGTGAT  518

Query  519  TGTGCCGACGTCGTCCAGTGGGCAGCACCGCCAACGACCTGCCTTGGGCGGGGCCGGCACGCTGGAGGGCGTGG  592
            |||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|..|||||.|.||||||.||.||||
Sbjct  519  TGTCCCAACATCATCCAGTGGGCAACACCGCCAACGACCTGCCTTGGGTGATGCCGGTATGCTGGATGGAGTGG  592

Query  593  AGGCGTCGCTGTTCTACCAGTGTCTGGAAAACCTGTGTGATCGGCACAAGTACAGCTGCCCACCCCCAGCACTT  666
            |.||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  593  AAGCATCACTGTTCTATCAGCGCCTGGAAAACCTGTGTGACCGGCACAAGTACAGCTGTCCACCACCAGCGCTT  666

Query  667  GTCAAAGAGGCCCTCAGCAATGTTCAGAGACTGACCTTCTATGGATTCCTCATGGCTCTCTCAAAGCACCGTGG  740
            |||||||||..|||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||.|.|||
Sbjct  667  GTCAAAGAGATCCTGAGCAATGTCCAGAGGCTGACTTTCTATGGATTCCTTGTGGCCCTCTCAAAGCATCATGG  740

Query  741  AATCAACCAAGCCCTCGGAGCTTTGCCTGACAAGGGGGATCTGATGCACGACCCAGCAATGGATGAAGAGCTGG  814
            .||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GATCAACCAAGCCCTGGGAGCTTTGCCAGACAAAGGAGACCTGATGCACGACCCAGCCATGGATGAAGAGCTGG  814

Query  815  AACGGCTGCTTCTTCCCTTCTTCAGGCTGGCCCAGGTCCCAGGCCTGGTCAACTCGGTCACAGCCAGTCCAGAG  888
            |||||||                  |||||.||||||||||||||||||||||||..||||.||||.|.|.|||
Sbjct  815  AACGGCT------------------GCTGGTCCAGGTCCCAGGCCTGGTCAACTCCATCACTGCCACTTCTGAG  870

Query  889  GCCAGTTGCCTGCCTTCCCGGACCCCTCCCCGGGTTGGCTCTCCCTGGAGACCTCTCCATCATTCCCGAAAAGT  962
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||.|||.|||||||..|||||.|||.|
Sbjct  871  GCCAGCTGCCTGCCTTCCCGAACCCCTCCCCGGGTTGGTTCCCCGTGGAAACCCCTCCATCGCTCCCGCAAATT  944

Query  963  GGATGGAGAGAGTGATGGCTCCACTGAAGAGACAGACGAGTCGGAGACT  1011
            |||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  945  GGATGCAGAGAGCGATGGCTCCACTGAAGAGACAGATGAGTCTGAGACT  993