Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04142
• Subject: NM_001321239.1
• Aligned Length: 1212
• Identities: 876
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGTCTGTGGAGCGCCTGCAGCAGCGGGTCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTTGCCCAGGAGAGGAGTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCAGGTCCCGAGGAGCGGCGACGGAGGGGGCGGCCGGGTCCGCATCGAGAAGATGAGCTCAGAGGTGGTGGATT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGAATCCCTACAGCCGCTTGATGGCATTGAAACGAATGGGAATTGTAAGCGACTATGAGAAAATCCGTACCTTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCGTAGCAATAGTAGGTGTTGGTGGAGTAGGTAGTGTGACTGCTGAAATGCTGACAAGATGTGGCATTGGTAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GTTGCTACTCTTTGATTATGACAAGGTGGAACTAGCCAATATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATCAAGCAG  370
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGAATAGACTTTTCTTCCAACCTCATCAAGCAG  34

Query  371  GATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTACACAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   35  GATTAAGTAAAGTTCAAGCAGCAGAACATACTCTGAGGAACATTAATCCTGATGTTCTTTTTGAAGTACACAAC  108

Query  445  TATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGAAGGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  TATAATATAACCACAGTGGAAAACTTTCAACATTTCATGGATAGAATAAGTAATGGTGGGTTAGAAGAAGGAAA  182

Query  519  ACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTAATGAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  ACCTGTTGATCTAGTTCTTAGCTGTGTGGACAATTTTGAAGCTCGAATGACAATAAATACAGCTTGTAATGAAC  256

Query  593  TTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATTCCTGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  TTGGACAAACATGGATGGAATCTGGGGTCAGTGAAAATGCAGTTTCAGGGCATATACAGCTTATAATTCCTGGA  330

Query  667  GAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAAACGAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  GAATCTGCTTGTTTTGCGTGTGCTCCACCACTTGTAGTTGCTGCAAATATTGATGAAAAGACTCTGAAACGAGA  404

Query  741  AGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGTTAAAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  AGGTGTTTGTGCAGCCAGTCTTCCTACCACTATGGGTGTGGTTGCTGGGATCTTAGTACAAAACGTGTTAAAGT  478

Query  815  TTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACTATGTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  TTCTGTTAAATTTTGGTACTGTTAGTTTTTACCTTGGATACAATGCAATGCAGGATTTTTTTCCTACTATGTCC  552

Query  889  ATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGTAGCAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  ATGAAGCCAAATCCTCAGTGTGATGACAGAAATTGCAGGAAGCAGCAGGAGGAATATAAGAAAAAGGTAGCAGC  626

Query  963  ACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTGAGCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  ACTGCCTAAACAAGAGGTTATACAAGAAGAGGAAGAGATAATCCATGAAGATAATGAATGGGGTATTGAGCTGG  700

Query 1037  TATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATTACAGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  TATCTGAGGTTTCAGAAGAGGAACTGAAAAATTTTTCAGGTCCAGTTCCAGACTTACCTGAAGGAATTACAGTG  774

Query 1111  GCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAGCTTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  GCATACACAATTCCAAAAAAGCAAGAAGATTCTGTCACTGAGTTAACAGTGGAAGATTCTGGTGAAAGCTTGGA  848

Query 1185  AGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  AGACCTCATGGCCAAAATGAAGAATATG  876