Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04145
• Subject: NM_001160108.1
• Aligned Length: 929
• Identities: 811
• Gaps: 13

Alignment

Query   1  ATGAGAATGTCTTCAAAGTTTCCATCACCACCTCTACCAATTTTTCTTCCACCGGAGCCAGTGGACTTAGGTTC  74
           ||||.|||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||||.||..||||.|||||||..||||||||.||
Sbjct   1  ATGAAAATGTCTTCAAGGTTTTCATCACCATCTCTACCAGTTTTCCTCTCACCAGAGCCAGCTGACTTAGGCTC  74

Query  75  CATAACAAGCTCCTCTTGTTCACTGAATGAGCTAGACAATATTTCCCACCTTTTAAGGAAAATATCAGCTGATA  148
           ..|.|||||..|.|||||||||||.||||||||.|.||||||||||.|||||||.|||||||||.||.||||||
Sbjct  75  TCTGACAAGTGCTTCTTGTTCACTAAATGAGCTGGGCAATATTTCCTACCTTTTGAGGAAAATAGCAACTGATA  148

Query 149  TCAATGAAATTAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATCTAAATGTTAGAGTG  222
           ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 149  TCAATGAAATGAAAGGAATGAAAGCAGCTATTTTGACAGTGGAAGCAAATCTTTTTGATTTGAATGTTAGAGTG  222

Query 223  TCCAAGAATGAAGCAAAAATTTCATCTTTGGAGGTTAAAATGAATGAATATT---CAACAACATATGAATGCAA  293
           |||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||   ||.||||||.|||||||||
Sbjct 223  TCCCAGAACGAAGCAAAAATTTCATCTTTAGAGGTTAAAATGAATGAATATTTAACATCAACATCTGAATGCAA  296

Query 294  CAGACAGTTTGAAGA---TCAAGA-AGA--AGATACTGAATCACAGTCAAGA-ACTACTGATGTAAAAATAATC  360
           |||||||||.|||||   |||||| |||  |||...|||.|||||||| ||| ||||||||||.|||..||||.
Sbjct 297  CAGACAGTTGGAAGATTTTCAAGAGAGACTAGAATTTGAGTCACAGTC-AGAGACTACTGATGCAAACCTAATT  369

Query 361  GGCTTCCTTAGAAACGTTGAGAAAGGAACTCAACAGAGGCAATTATTATCCCGACTGCAAATCGACCCAGTAAT  434
           ||||||||.|.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 370  GGCTTCCTAACAGAGGTTGAGAAAGGAACTCAACAGAGGCAATTGTTATCCCGACTGCAAATTGATCCAGTAAT  443

Query 435  GGCAGAAACTCTGCAGATGAGTCAAGCTGAGATGAGTGAACTGAGTGTGGCACAGAAACCAGAAAAACTTTTGG  508
           ||.||||||..||.|||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 444  GGTAGAAACAATGGAGATGAGTCAAGCCGAGATGACTGACCTGAGTGTGGCACAGAAACCAGAAAAACTTCTGG  517

Query 509  AGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCTTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGCCTACCATCACCCCATCTCACCCTGCAAA  582
           ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 518  AGCGCTGCAAGTACTGGCCTGCCTGTAAAAATGGGGATGAGTGTGTATACCATCATCCCATTTCACCTTGCAAA  591

Query 583  GCCTTCCCCAATTGTAAATTTGCTGAAAAATGTTTGTTTGTTCACCCAAATTGTAAATATGATGCAAAGTGTAC  656
           |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||||||||||
Sbjct 592  GCCTTTCCCAACTGTAAATTTGCTGAGAAATGTTTGTTTGTGCATCCAAATTGTAAATATGACACAAAGTGTAC  665

Query 657  TAAACCAGATTGTCCCTTCACTCATGTGAGTAGAAGA-ATTCCAGTACTGTCTCCAAAACCAGTTGCACCACCA  729
           ||||.|||||||||||||||||||..||||||||||| ..||.| |||||.|||||||||||||..|..|||||
Sbjct 666  TAAAGCAGATTGTCCCTTCACTCACATGAGTAGAAGAGCCTCGA-TACTGACTCCAAAACCAGTGTCGTCACCA  738

Query 730  GCACCACCTTCCAGTAGTCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAGATGGAATGTCCCTTCTATCATCC  803
           |||||..||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 739  GCACCGTCTTCTAATGGCCAGCTCTGCCGTTACTTCCCTGCTTGTAAGAAAATGGAATGTCCCTTCTACCACCC  812

Query 804  AAAACATTGTAGGTTTAACACTCAATGTACAAGACCGGACTGCACATTCTACCATCCCACCATTAATGTCCCAC  877
           ||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||.|||.||||
Sbjct 813  AAAACACTGTAGGTTTAACACTCAGTGTACGAGACCTGACTGCACATTTTATCACCCCACCATTACTGTGCCAC  886

Query 878  CACGACATGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAAACCAGCGAA  918
           ||.||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||.
Sbjct 887  CAAGACACGCCTTGAAATGGATTCGACCTCAGAGCAGTGAG  927