Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04397
• Subject: NM_001321761.2
• Aligned Length: 861
• Identities: 549
• Gaps: 312

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGATACTGACCAAAGCTCAGTACGACGAGATAGCCCAGTGCCTAGTGTCTGTGCCGCCTACCAGGCAGAGCCT  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  GAGGAAGCTGAAGCAGAGGTTTCCCAGTCAATCGCAGGCCACTCTGCTGAGCATCTTCTCCCAGGAGTACCAGA  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  AACACATTAAAAGAACACATGCCAAACATCATACTTCGGAAGCAATTGAAAGTTATTACCAGAGGTACCTGAAT  222

Query   1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                   ||
Sbjct 223  GGAGTGGTGAAAAATGGAGCTGCCCCAGTGCTCCTGGACCTGGCCAATGAGGTGGACTATGCGCCCTCATTAAT  296

Query   3  GGCTCGGCTTATACTGGAGAGGTTTCTACAGGAACACGAGGAAACTCCACCCTCCAAGTCTATTATAAATAGTA  76
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GGCTCGGCTTATACTGGAGAGGTTTCTACAGGAACACGAGGAAACTCCACCCTCCAAGTCTATTATAAATAGTA  370

Query  77  TGCTACGGGACCCTTCTCAGATTCCAGATGGAGTTCTAGCAAATCAGGTCTATCAGTGCATTGTGAACGACTGC  150
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TGCTACGGGACCCTTCTCAGATTCCAGATGGAGTTCTAGCAAATCAGGTCTATCAGTGCATTGTGAACGACTGC  444

Query 151  TGTTACGGACCACTAGTGGACTGCATCAAGCATGCCATTGGTCATGAGCATGAGGTCCTGCTGAGAGACTTGCT  224
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TGTTACGGACCACTAGTGGACTGCATCAAGCATGCCATTGGTCATGAGCATGAGGTCCTGCTGAGAGACTTGCT  518

Query 225  TCTAGAGAAAAACCTGTCCTTCCTAGATGAAGATCAGCTTCGTGCAAAGGGTTATGACAAAACACCAGACTTCA  298
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TCTAGAGAAAAACCTGTCCTTCCTAGATGAAGATCAGCTTCGTGCAAAGGGTTATGACAAAACACCAGACTTCA  592

Query 299  TTTTACAAGTACCAGTT------------------GCTGTAGAAGGGCACATAATTCACTGGATTGAAAGCAAA  354
           |||||||||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TTTTACAAGTACCAGTTGTAATGCTTTGTCCCTTAGCTGTAGAAGGGCACATAATTCACTGGATTGAAAGCAAA  666

Query 355  GCCTCATTTGGTGATGAATGTAGCCACCACGCCTACCTGCATGACCAGTTCTGGAGCTACTGGAATAGATTTGG  428
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GCCTCATTTGGTGATGAATGTAGCCACCACGCCTACCTGCATGACCAGTTCTGGAGCTACTGGAATAGATTTGG  740

Query 429  GCCAGGCTTAGTCATCTATTGGTATGGATTTATCCAGGAGCTGGACTGCAACCGGGAAAGGGGCATCCTGCTCA  502
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  GCCAGGCTTAGTCATCTATTGGTATGGATTTATCCAGGAGCTGGACTGCAACCGGGAAAGGGGCATCCTGCTCA  814

Query 503  AAGCCTGTTTCCCCACGAACATTGTCACCTTATGCCACAGCATAGCT  549
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  AAGCCTGTTTCCCCACGAACATTGTCACCTTATGCCACAGCATAGCT  861