Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04417
• Subject: XM_017023790.1
• Aligned Length: 1569
• Identities: 1136
• Gaps: 432

Alignment

Query    1  ATGCAGCGGGCGGCGGCGCTGGTCCGGCGGGGCTGTGGTCCCCGGACCCCCAGCTCCTGGGGCCGCAGCCAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAGCGCGGCCGCCGAGGCCTCGGCGGTGCTCAAGGTGCGGCCCGAGCGCAGCCGGCGCGAGCGCATCCTCACGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGAGTCCATGAACCCGCAGGTGAAGGCGGTGGAGTACGCCGTGCGGGGACCCATCGTGCTCAAGGCCGGCGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATCGAGCTCGAGCTGCAGCGGGGTATCAAAAAGCCATTCACAGAGGTCATCCGAGCCAACATCGGGGACGCCCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGCTATGGGGCAGCAGCCAATCACCTTCCTCCGGCAGGTGATGGCACTATGCACCTACCCAAACCTGCTGGACA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GCCCCAGCTTCCCAGAAGATGCTAAGAAACGTGCCCGGCGGATCCTGCAGGCTTGTGGCGGGAACAGCCTGGGG  444
                                                            |.||         |||     |||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------ATGC---------GAA-----TGGGG  12

Query  445  TCCTACAGTGCTAGCCAGGGTGTCAACTGCATCCGTGAAGATGTGGCTGCCTACATCACCAGGAGGGATGGCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  TCCTACAGTGCTAGCCAGGGTGTCAACTGCATCCGTGAAGATGTGGCTGCCTACATCACCAGGAGGGATGGCGG  86

Query  519  TGTGCCTGCGGACCCCGACAACATCTACCTGACCACGGGAGCTAGTGACGGCATTTCTACGATCCTGAAGATCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   87  TGTGCCTGCGGACCCCGACAACATCTACCTGACCACGGGAGCTAGTGACGGCATTTCTACGATCCTGAAGATCC  160

Query  593  TCGTCTCCGGGGGCGGCAAGTCACGGACAGGTGTGATGATCCCCATCCCACAATATCCCCTCTATTCAGCTGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  161  TCGTCTCCGGGGGCGGCAAGTCACGGACAGGTGTGATGATCCCCATCCCACAATATCCCCTCTATTCAGCTGTC  234

Query  667  ATCTCTGAGCTCGACGCCATCCAGGTGAATTACTACCTGGACGAGGAGAACTGCTGGGCGCTGAATGTGAATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  ATCTCTGAGCTCGACGCCATCCAGGTGAATTACTACCTGGACGAGGAGAACTGCTGGGCGCTGAATGTGAATGA  308

Query  741  GCTCCGGCGGGCGGTGCAGGAGGCCAAAGACCACTGTGATCCTAAGGTGCTCTGCATAATCAACCCTGGGAACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  GCTCCGGCGGGCGGTGCAGGAGGCCAAAGACCACTGTGATCCTAAGGTGCTCTGCATAATCAACCCTGGGAACC  382

Query  815  CCACAGGCCAGGTACAAAGCAGAAAGTGCATAGAAGATGTGATCCACTTTGCCTGGGAAGAGAAGCTCTTTCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  CCACAGGCCAGGTACAAAGCAGAAAGTGCATAGAAGATGTGATCCACTTTGCCTGGGAAGAGAAGCTCTTTCTC  456

Query  889  CTGGCTGATGAGGTGTACCAGGACAACGTGTACTCTCCAGATTGCAGATTCCACTCCTTCAAGAAGGTGCTGTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457  CTGGCTGATGAGGTGTACCAGGACAACGTGTACTCTCCAGATTGCAGATTCCACTCCTTCAAGAAGGTGCTGTA  530

Query  963  CGAGATGGGGCCCGAGTACTCCAGCAACGTGGAGCTCGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCTACATGGGCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  531  CGAGATGGGGCCCGAGTACTCCAGCAACGTGGAGCTCGCCTCCTTCCACTCCACCTCCAAGGGCTACATGGGCG  604

Query 1037  AGTGTGGTTACAGAGGAGGCTACATGGAGGTGATCAACCTGCACCCTGAGATCAAGGGCCAGCTGGTGAAGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  AGTGTGGTTACAGAGGAGGCTACATGGAGGTGATCAACCTGCACCCTGAGATCAAGGGCCAGCTGGTGAAGCTG  678

Query 1111  CTGTCGGTGCGCCTGTGCCCCCCAGTGTCTGGGCAGGCCGCCATGGACATTGTCGTGAACCCCCCGGTGGCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  CTGTCGGTGCGCCTGTGCCCCCCAGTGTCTGGGCAGGCCGCCATGGACATTGTCGTGAACCCCCCGGTGGCAGG  752

Query 1185  AGAGGAGTCCTTTGAGCAATTCAGCCGAGAGAAGGAGTCGGTCCTGGGTAATCTGGCCAAAAAAGCAAAGCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  753  AGAGGAGTCCTTTGAGCAATTCAGCCGAGAGAAGGAGTCGGTCCTGGGTAATCTGGCCAAAAAAGCAAAGCTGA  826

Query 1259  CGGAAGACCTGTTTAACCAAGTCCCAGGAATTCACTGCAACCCCTTGCAGGGGGCCATGTACGCCTTCCCTCGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  CGGAAGACCTGTTTAACCAAGTCCCAGGAATTCACTGCAACCCCTTGCAGGGGGCCATGTACGCCTTCCCTCGG  900

Query 1333  ATCTTCATTCCTGCCAAAGCTGTGGAGGCTGCTCAGGCCCATCAAATGGCTCCAGACATGTTCTACTGCATGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  ATCTTCATTCCTGCCAAAGCTGTGGAGGCTGCTCAGGCCCATCAAATGGCTCCAGACATGTTCTACTGCATGAA  974

Query 1407  GCTCCTGGAGGAGACTGGCATCTGTGTCGTGCCCGGCAGTGGCTTTGGGCAGAGGGAAGGCACTTACCACTTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  975  GCTCCTGGAGGAGACTGGCATCTGTGTCGTGCCCGGCAGTGGCTTTGGGCAGAGGGAAGGCACTTACCACTTCA  1048

Query 1481  GGATGACTATCCTCCCTCCAGTGGAGAAGCTGAAAACGGTGCTGCAGAAGGTGAAAGACTTCCACATCAACTTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049  GGATGACTATCCTCCCTCCAGTGGAGAAGCTGAAAACGGTGCTGCAGAAGGTGAAAGACTTCCACATCAACTTC  1122

Query 1555  CTGGAGAAGTACGCG  1569
            |||||||||||||||
Sbjct 1123  CTGGAGAAGTACGCG  1137