Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04898
• Subject: XM_011535461.3
• Aligned Length: 850
• Identities: 703
• Gaps: 122

Alignment

Query   1  ATGGTGGCAGAAAAAGAGACCCTGAGCTTAAACAAATGCCCAGACAAGATGCCGAAGAGGACCAAGCTGCTGGC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGTGGCAGAAAAAGAGACCCTGAGCTTAAACAAATGCCCAGACAAGATGCCGAAGAGGACCAAGCTGCTGGC  74

Query  75  ACAACAGCCGCTCCCGGTGCACCAGCCTCACTCTCTGGTTTCTGAGGGTTTCACAGTCAAAGCCATGATGAAAA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ACAACAGCCGCTCCCGGTGCACCAGCCTCACTCTCTGGTTTCTGAGGGTTTCACAGTCAAAGCCATGATGAAAA  148

Query 149  ACTCAGTCGTGAGAGGCCCTCCAGCTGCAGGGGCATTTAAAGAAAGACCAACCAAGCCCACAGCATTTCGAAAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACTCAGTCGTGAGAGGCCCTCCAGCTGCAGGGGCATTTAAAGAAAGACCAACCAAGCCCACAGCATTTCGAAAA  222

Query 223  TTCTATGAGCGAGGTGACTTCCCAATTGCCCTTGAGCATGATTCGAAAGGAAACAAAATCGCCTGGAAGGTAGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TTCTATGAGCGAGGTGACTTCCCAATTGCCCTTGAGCATGATTCGAAAGGAAACAAAATCGCCTGGAAGGTAGA  296

Query 297  AATTGAGAAGCTGGATTACCATCATTATCTGCCTCTGTTTTTTGATGGGCTTTGTGAAATGACATTTCCCTATG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AATTGAGAAGCTGGATTACCATCATTATCTGCCTCTGTTTTTTGATGGGCTTTGTGAAATGACATTTCCCTATG  370

Query 371  AGTTTTTTGCTCGGCAAGGAATCCACGACATGCTGGAACACGGTGGGAACAAGATCCTACCTGTCCTTCCACAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGTTTTTTGCTCGGCAAGGAATCCACGACATGCTGGAACACGGTGGGAACAAGATCCTACCTGTCCTTCCACAG  444

Query 445  CTCATTATCCCGATAAAAAATGCCTTGAACCTCCGAAACCGACAGGTCATCTGTGTCACTCTCAAGGTCCTCCA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CTCATTATCCCGATAAAAAATGCCTTGAACCTCCGAAACCGACAGGTCATCTGTGTCACTCTCAAGGTCCTCCA  518

Query 519  GCATCTGGTTGTGTCAGCTGAGATGGTGGGCAAGGCCTTGGTGCCTTATTACCGTCAAATCCTCCCTGTCCTGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GCATCTGGTTGTGTCAGCTGAGATGGTGGGCAAGGCCTTGGTGCCTTATTACCGTCAAATCCTCCCTGTCCTGA  592

Query 593  ACATCTTTAAGAATATGAATGTGAACTC-----CGGAGACG-GCATTG-ACTACA-GCCAGCAGAAGAGGGAGA  658
           |||||||||||||||||||||| |||.|     |..|||.| |.|||| .||.|| |..||| ||||       
Sbjct 593  ACATCTTTAAGAATATGAATGT-AACCCATCGACAAAGAAGTGAATTGTCCTCCATGTTAGC-GAAG-------  657

Query 659  ACATTGGGGACTTGATCCAGGAGACACTGG-----AGGCCTTCGAGCGCTACGGAGGAGAAAATGCCTT---TA  724
               ||||||   |.|||||     |||.|     .|.|.||      ||||             |.||   ||
Sbjct 658  ----TGGGGA---GGTCCAG-----ACTTGCTCCTTGTCTTT------CTAC-------------CATTTTCTA  700

Query 725  TCAACATTAAGTACGT---GGTCCCAACCTAC-----GAGTC-----TTGCTT-----GCTAAAC---------  771
           .||.||||  |||.||   .|| |.||.||.|     .||||     .|||||     .||||||         
Sbjct 701  CCATCATT--GTATGTAAAAGT-CTAATCTTCATTTTAAGTCAGTTTATGCTTCCCAGACTAAACTCTGCAACA  771

Query 772  ------------------------------------  771
                                               
Sbjct 772  AATAATATGAATGTCACACATTTCATCATTTGTAAT  807