Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_04946
• Subject: NM_001351664.2
• Aligned Length: 720
• Identities: 639
• Gaps: 81

Alignment

Query   1  ATGAATGAGTTTTTCTCCGTAGACGATAATAATGAAGAAGAAGAGGATGTTGAAATGAAAGAAGATTCAGATGA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAATGAGTTTTTCTCCGTAGACGATAATAATGAAGAAGAAGAGGATGTTGAAATGAAAGAAGATTCAGATGA  74

Query  75  GAACGGTCCAGAGGAGAAGCAAAGTGTGGAAGAAATGGAAGAGCAGAGCCAAGATGCAGATGGTGTCAACACTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAACGGTCCAGAGGAGAAGCAAAGTGTGGAAGAAATGGAAGAGCAGAGCCAAGATGCAGATGGTGTCAACACTG  148

Query 149  TCACTGTGCCCGGCCCTGCTTCAGAAGAGGCAGTTGAAGACTGTAAAGATGAAGATTTTGCAAAGGATGAAAAT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TCACTGTGCCCGGCCCTGCTTCAGAAGAGGCAGTTGAAGACTGTAAAGATGAAGATTTTGCAAAGGATGAAAAT  222

Query 223  ATTACAAAAGGCGGTGAAGTGACAGATCATTCTGTGCGTGACCAAGATCATCCCGATG----------------  280
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 223  ATTACAAAAGGCGGTGAAGTGACAGATCATTCTGTGCGTGACCAAGATCATCCCGATGGGTTCTCTGCAACAAA  296

Query 281  -----------------------------------------------------------------GACAAGAGA  289
                                                                            |||||||||
Sbjct 297  TATAATGTGTGGAGTGCTTAGTAGCATACAAGACTTTACCTTGTTGTTAAAGGATGCAAGAGAAAGACAAGAGA  370

Query 290  ATGATTCAACGAAGAATGAAATAAAAATTGAAACAGAATCGCAGAGCTCATATATGGAAACAGAAGAACTTTCA  363
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATGATTCAACGAAGAATGAAATAAAAATTGAAACAGAATCGCAGAGCTCATATATGGAAACAGAAGAACTTTCA  444

Query 364  TCAAACCAAGAAGATGCCGTGATTGTGGAGCAACCAGAAGTGATTCCATTAACAGAGGACCAAGAAGAAAAAGA  437
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TCAAACCAAGAAGATGCCGTGATTGTGGAGCAACCAGAAGTGATTCCATTAACAGAGGACCAAGAAGAAAAAGA  518

Query 438  AGGTGAAAAAGCTCCAGGCGAGGACACACCTAGGATGCCTGGGAAAAGTGAAGGCTCCAGTGACCTAGAAAATA  511
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AGGTGAAAAAGCTCCAGGCGAGGACACACCTAGGATGCCTGGGAAAAGTGAAGGCTCCAGTGACCTAGAAAATA  592

Query 512  CTCCAGGTCCTGATGTTGAAATGAATAGTCAGGTTGACAAGGTAAATGACCCAACAGAGAGTCAACAAGAAGAT  585
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CTCCAGGTCCTGATGTTGAAATGAATAGTCAGGTTGACAAGGTAAATGACCCAACAGAGAGTCAACAAGAAGAT  666

Query 586  CAACTAATAGCAGGGGCACAAGATGAAGCGAAGGAACAAAGAAATGGAACTAAA  639
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  CAACTAATAGCAGGGGCACAAGATGAAGCGAAGGAACAAAGAAATGGAACTAAA  720