Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05065
• Subject: NM_001331079.1
• Aligned Length: 869
• Identities: 855
• Gaps: 14

Alignment

Query   1  --------------MSFVRVNRCGPRVGVRKTPKVKKKKTSVKQEWDNTVTDLTVHRATPEDLVRRHEIHKSKN  60
                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MRVRTAFGSFCTELMSFVRVNRCGPRVGVRKTPKVKKKKTSVKQEWDNTVTDLTVHRATPEDLVRRHEIHKSKN  74

Query  61  RALVHWELQEKALKRKWRKQKPETLNLEKRRLSIMKEILSDQYQMQDVLEKSDHLIAAAKELFPRRRTGFPNVT  134
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  RALVHWELQEKALKRKWRKQKPETLNLEKRRLSIMKEILSDQYQMQDVLEKSDHLIAAAKELFPRRRTGFPNVT  148

Query 135  VAPDSSQGPIVVNQDPITQSIFNESVIEPQALNDVDGEEEGTVNSQSGESENENELDNSLNSQSNTNTDRFLQQ  208
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  VAPDSSQGPIVVNQDPITQSIFNESVIEPQALNDVDGEEEGTVNSQSGESENENELDNSLNSQSNTNTDRFLQQ  222

Query 209  LTEENFELISKLWTDIQQKIATQSQITPPGTPSSALSSGEQRAALNATNAVKRLQTRLQPEESTETLDSSYVVG  282
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  LTEENFELISKLWTDIQQKIATQSQITPPGTPSSALSSGEQRAALNATNAVKRLQTRLQPEESTETLDSSYVVG  296

Query 283  HVLNSRKQKQLLNKVKRKPNLHALSKPKKNISSGSTTSADLPNRTNSNLDVLKHMIHEVEHEMEEYERWTGREV  356
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  HVLNSRKQKQLLNKVKRKPNLHALSKPKKNISSGSTTSADLPNRTNSNLDVLKHMIHEVEHEMEEYERWTGREV  370

Query 357  KGLQSSQGLTGFTLSLVSSLCRLVRYLKESEIQLRKEVETRQQLEQVLGDHRELIDALTAEILRLREENAATQA  430
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  KGLQSSQGLTGFTLSLVSSLCRLVRYLKESEIQLRKEVETRQQLEQVLGDHRELIDALTAEILRLREENAATQA  444

Query 431  RLQQYMVTTDEQLISLTHAIKNCPVINNRQEIQASESGATGRRVMDSPERPVVNANVSVPLMFREEVAEFPQEE  504
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  RLQQYMVTTDEQLISLTHAIKNCPVINNRQEIQASESGATGRRVMDSPERPVVNANVSVPLMFREEVAEFPQEE  518

Query 505  LPVKLSQVPDPPDNMNLAKNFPAHIFEPAVLLTPPRQKSNLKFSPLQDVLRRTVQTRPAPRLPPTVEIIEKEQN  578
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  LPVKLSQVPDPPDNMNLAKNFPAHIFEPAVLLTPPRQKSNLKFSPLQDVLRRTVQTRPAPRLPPTVEIIEKEQN  592

Query 579  WEEKTLPIDTDIQNSSEENRLFTQRWRVSHMGEDLENKTQAPFVNLSQPLCNSHSNTQQSRSPTFSEELPVLGD  652
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  WEEKTLPIDTDIQNSSEENRLFTQRWRVSHMGEDLENKTQAPFVNLSQPLCNSHSNTQQSRSPTFSEELPVLGD  666

Query 653  GQQLRTNESLIQRKDIMTRIADLTLQNSAIKAHMNNIIEPRGEQGDGLRELNKQESASDMTSTFPVAQSLTPGS  726
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GQQLRTNESLIQRKDIMTRIADLTLQNSAIKAHMNNIIEPRGEQGDGLRELNKQESASDMTSTFPVAQSLTPGS  740

Query 727  MEERIAELNRQSMEARGKLLQLIEQQKLVGLNLSPPMSPVQLPLRAWTEGAKRTIEVSIPGAEAPESSKCSTVS  800
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  MEERIAELNRQSMEARGKLLQLIEQQKLVGLNLSPPMSPVQLPLRAWTEGAKRTIEVSIPGAEAPESSKCSTVS  814

Query 801  PVSGINTRRSSGATGNSCSPLNATSGSGRFTPLNPRAKIEKQNEEGWFALSTHVS  855
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  PVSGINTRRSSGATGNSCSPLNATSGSGRFTPLNPRAKIEKQNEEGWFALSTHVS  869