Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05267
- Subject:
- NM_177682.3
- Aligned Length:
- 1450
- Identities:
- 1284
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGGCTGCAGCGGCGGCCGGGGCCGGGAGCGGGCCCTGGGCGGCCCAGGAGAAGCAGTTCCCGCCGGCGCTGCT 74
|||||.|||||.|||||| ||||||||.| |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCAGCCGCGGCC-GGGCCGGGTG-----CTTGGGCGGCCCAGGAGAAGCAGTTCCCGCCAGCGCTGCT 68
Query 75 GAGTTTCTTCATCTACAACCCGCGCTTCGGGCCGCGCGAAGGACAGGAGGAAAATAAGATTTTATTTTATCATC 148
|||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||.|||.|.|||||.||||
Sbjct 69 GAGCTTCTTCATCTACAACCCCCGTTTCGGGCCGCGCGAGGGAGAGGAAGAAAATAAAATTCTGTTTTACCATC 142
Query 149 CAAATGAGGTAGAAAAGAATGAGAAGATTAGAAATGTCGGATTGTGTGAAGCTATTGTACAGTTTACAAGGACA 222
|||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 143 CAAATGAAGTAGAAAAGAATGAAAAAATTAGAAATGTTGGATTATGTGAAGCAATTGTACAGTTTACAAGGACT 216
Query 223 TTTAGCCCATCAAAACCTGCAAAATCTTTACATACACAGAAGAACAGACAGTTCTTCAATGAACCAGAAGAAAA 296
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 TTTAGCCCATCGAAACCTGCAAAATCTTTACACACACAGAAGAACAGACAGTTCTTCAATGAACCAGAAGAAAA 290
Query 297 TTTCTGGATGGTCATGGTTGTTCGGAATCCTATAATTGAAAAACAGAGTAAAGATGGAAAACCAGTTATTGAAT 370
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||..|.||..|.||.|
Sbjct 291 TTTCTGGATGGTTATGGTTGTTCGGAATCCTATCATCGAGAAGCAAAGTAAAGATGGCAAGGCGGTAGTGGAGT 364
Query 371 ATCAAGAGGAGGAGTTGTTGGACAAGGTTTATAGCTCGGTGCTGCGGCAGTGCTACAGCATGTACAAGCTTTTT 444
|.||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 365 ACCAAGAGGAGGAGCTGTTGGACAAGGTGTACAGCTCAGTGCTGCAGCAGTGCTACAGCATGTACAAGCTTTTC 438
Query 445 AATGGTACATTTCTGAAAGCCATGGAAGACGGAGGCGTCAAGCTTCTGAAAGAAAGATTAGAGAAATTCTTCCA 518
|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 AATGGGACGTTTCTGAAAGCCATGGAAGATGGAGGCGTCAAGCTCCTAAAGGAAAGATTAGAGAAATTCTTCCA 512
Query 519 TCGGTATTTGCAAACGCTACATTTGCAGTCATGTGACCTACTTGACATTTTTGGTGGAATCAGCTTCTTCCCGT 592
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 513 TCGGTATTTGCAGACACTACATTTGCAGTCATGTGACCTACTTGATATTTTTGGTGGAATCAGCTTCTTCCCAT 586
Query 593 TGGATAAAATGACTTATTTGAAAATCCAGTCCTTTATTAATAGAATGGAGGAAAGCCTGAATATAGTCAAATAC 666
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.|.|.||||||||||.
Sbjct 587 TGGATAAAATGACTTACTTGAAAATCCAGTCCTTTATTAACCGAATGGAAGAAAGCCTAAGTGTAGTCAAATAT 660
Query 667 ACTGCTTTTCTCTATAACGATCAGCTCATCTGGAGTGGATTAGAACAAGATGACATGAGAATTTTATACAAATA 740
||.||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 661 ACAGCATTCCTCTACAATGACCAACTTATCTGGAGTGGACTAGAGCAAGATGACATGAGAATTTTGTACAAATA 734
Query 741 CCTTACCACCTCCCTTTTCCCAAGGCACATCGAACCTGAGTTAGCAGGAAGGGATTCTCCAATAAGAGCAGAAA 814
|||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||.|.||.|||||.|
Sbjct 735 CCTCACCACCTCACTGTTCCCCAGGCACATCGAACCTGAGTTGGCGGGAAGGGACTCCCCAGTCAGGGCAGAGA 808
Query 815 TGCCAGGAAATCTTCAACACTATGGAAGATTTCTTACCGGACCCTTGAACCTCAATGATCCAGATGCAAAATGC 888
||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 809 TGCCTGGGAATCTTCAGCACTATGGAAGATTTCTTACTGGACCCTTGAACCTTAATGATCCAGAAGCAAAATGC 882
Query 889 AGATTCCCCAAAATTTTTGTAAATACAGATGACACTTATGAAGAGCTCCATTTAATCGTTTATAAGGCCATGAG 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 883 AGATTCCCCAAAATTTTTGTAAATACAGATGACACGTATGAAGAGCTCCATTTAATTGTTTATAAGGCCATGAG 956
Query 963 TGCGGCTGTGTGCTTTATGATCGACGCCTCTGTCCAC----CCAACGTTGGATTTTTGCCGAAGACTGGACAGC 1032
|||.||.||||||||.|||||.|||||| ||||| |..|||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 957 TGCAGCCGTGTGCTTCATGATTGACGCC----TCCACGCCGCTCACGCTGGATTTCTGCCGAAGACTGGACAGC 1026
Query 1033 ATCGTTGGGCCCCAGCTCACAGTGCTGGCCTCTGACATCTGTGAACAGTTTAACATCAACAAGAGGATGTCTGG 1106
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1027 ATCGTTGGGCCCCAGCTTACGGTGCTGGCATCTGACATCTGTGAGCAGTTTAATATCAACAAGAGGATCTCTGG 1100
Query 1107 GTCTGAGAAAGAACCCCAGTTTAAGTTTATCTACTTCAACCACATGAATCTCGCCGAGAAGAGCACAGTTCACA 1180
||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||.|||.||||||
Sbjct 1101 GTCTGAAAAGGAGCCCCAGTTTAAGTTCATCTACTTCAACCACATGAATTTAGCAGAGAAAAGTACAATTCACA 1174
Query 1181 TGAGGAAAACGCCCAGCGTGTCGCTCACTTCCGTGCACCCGGATTTAATGAAGATTCTCGGTGACATCAACAGT 1254
||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||||||||..|.||.||||||||||||
Sbjct 1175 TGAGGAAAACGCCCAGTGTGTCACTCACATCCGTCCACCCAGATCTAATGAAGATATTAGGGGACATCAACAGT 1248
Query 1255 GACTTTACCAGAGTGGATGAAGATGAGGAGATCATTGTGAAGGCCATGAGTGATTACTGGGTTGTTGGAAAGAA 1328
|||||||||||||..|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1249 GACTTTACCAGAGCAGATGAAGATGAAGAAATCATTGTGAAGGCCATGAGCGACTACTGGGTTGTTGGGAAGAA 1322
Query 1329 GTCTGATCGGCGGGAGCTCTATGTTATTTTGAATCAAAAAAATGCAAACCTGATTGAAGTAAATGAAGAGGTCA 1402
||||||.|.|||||||||.||.||.|||.|.|.|||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1323 GTCTGACCAGCGGGAGCTGTACGTGATTCTCAGTCAGAAGAATGCGAACCTGATCGAGGTCAATGAAGAGGTGA 1396
Query 1403 AGAAACTTTGTGCAACGCAGTTCAACAACATCTTCTTCTTGGAT 1446
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 AGAAACTGTGTGCCACGCAGTTCAACAACATCTTCTTCTTGGAT 1440