Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05500
- Subject:
- XM_011535797.2
- Aligned Length:
- 2838
- Identities:
- 2505
- Gaps:
- 333
Alignment
Query 1 ATGGAGAGCTTCCACACCAGATTTAGTGCCTGGACACCTTTTAGCAACAAGTCATTAAATAGACAGCTCTTTCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAAAGAGTGGCTCTTATAAGTCATTGGTTTGACCTCTGGACTAACAAGCAACGTCAAGAATTCTTATTCGCAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTTTTTTAAGATGCACTAAATCACAATTAAGGTTTGTCCAAGACTGGTTTTCAGAAAGGATGCAAGTGGCCAAA 222
|||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------ATGCAAGTGGCCAAA 15
Query 223 GTGGACTTCTCTACAGTGTTACCACGCTTCATTTCTCTATATATCTTTTCCTTTTTGAGTCCGAAAGATTTGTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 16 GTGGACTTCTCTACAGTGTTACCACGCTTCATTTCTCTATATATCTTTTCCTTTTTGAGTCCGAAAGATTTGTG 89
Query 297 TGCCGCTGCCCAAGTCAGCTGGCCCTGGAAGTTTTTAACTGAACAGGATTGCTTATGGATGCCCAAATGCGTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 TGCCGCTGCCCAAGTCAGCTGGCCCTGGAAGTTTTTAACTGAACAGGATTGCTTATGGATGCCCAAATGCGTTA 163
Query 371 AGTTCGGATGGTTTCTGCCCTATACTCCAACAGATAATGAGTATGGTGCTTGGAAGCGCCATTACATTGCTTGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 AGTTCGGATGGTTTCTGCCCTATACTCCAACAGATAATGAGTATGGTGCTTGGAAGCGCCATTACATTGCTTGT 237
Query 445 GTGTCCCACTTAGACTGGCTGACACCTAGGGAGGCTGCTGCTACTTATGGGACGCTGAATGAACCCAAAACAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 GTGTCCCACTTAGACTGGCTGACACCTAGGGAGGCTGCTGCTACTTATGGGACGCTGAATGAACCCAAAACAGA 311
Query 519 AGATGAGGAACTACTGGAGAGACAAAGAGAAAAGTGCCTGAGGAAAAGAATTTGGGAGAAAATTGCACTACGTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 AGATGAGGAACTACTGGAGAGACAAAGAGAAAAGTGCCTGAGGAAAAGAATTTGGGAGAAAATTGCACTACGTA 385
Query 593 AGAAGGAGTTATTCAAAGTTCGACCCCCTTGGGTGAGTGGAACTTGCTGCTCTAGCGTGCTAAAGCCCAGATGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 386 AGAAGGAGTTATTCAAAGTTCGACCCCCTTGGGTGAGTGGAACTTGCTGCTCTAGCGTGCTAAAGCCCAGATGC 459
Query 667 CAACCACGCCTCTCCCAGACTGTAAGGGAGCGAGTGGGATTACATGAAGCTTTGGAGAAACAGCTTGTTTTGAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 CAACCACGCCTCTCCCAGACTGTAAGGGAGCGAGTGGGATTACATGAAGCTTTGGAGAAACAGCTTGTTTTGAC 533
Query 741 ATCGTTAGAAACCTTGCCCAAGCGAAGCAATATTTCTGGAAGCCATTCCTACCCTTTATTATCAAAGAAAAATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 ATCGTTAGAAACCTTGCCCAAGCGAAGCAATATTTCTGGAAGCCATTCCTACCCTTTATTATCAAAGAAAAATT 607
Query 815 GGCATGGAGTTCATAAAAATGATGACAGATCTTCATATGCTCTCCGGCCACACTTCATGTTAATATCATCCCGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 608 GGCATGGAGTTCATAAAAATGATGACAGATCTTCATATGCTCTCCGGCCACACTTCATGTTAATATCATCCCGG 681
Query 889 ATTCCTGCGTATGAGATGGTGATGGAGAGTGTGAAGGCTGGTGTTGTTTCTGTGGTATATGAACACAGCGTAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 682 ATTCCTGCGTATGAGATGGTGATGGAGAGTGTGAAGGCTGGTGTTGTTTCTGTGGTATATGAACACAGCGTAAC 755
Query 963 CTTGGAAAGCCTTCTGTATCTTATAGAAAAAGCTCTGGATGGGCAGAAGGCACAGAGCATCGGAATATTTAGCG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 756 CTTGGAAAGCCTTCTGTATCTTATAGAAAAAGCTCTGGATGGGCAGAAGGCACAGAGCATCGGAATATTTAGCG 829
Query 1037 ATGGAGACAGCAGAGAAATCAATTTACTCCAAGGCTATAAAATTGGTGTTAAAAATTTACTGAGGCCTGAAGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 830 ATGGAGACAGCAGAGAAATCAATTTACTCCAAGGCTATAAAATTGGTGTTAAAAATTTACTGAGGCCTGAAGTG 903
Query 1111 AGAGATTTCTGGGAGAAATTAGGAAGCTATGTGGCCACTGAAGAAGAAGGGGGTCACGTGGACTTCTTCGTGCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 904 AGAGATTTCTGGGAGAAATTAGGAAGCTATGTGGCCACTGAAGAAGAAGGGGGTCACGTGGACTTCTTCGTGCC 977
Query 1185 CCTTGGAGCATCAGAGGCAGGAATTGAAGTTCTTTCCCAGCTGTCTCAACTAACTGGCACGTTCTTTACGGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 978 CCTTGGAGCATCAGAGGCAGGAATTGAAGTTCTTTCCCAGCTGTCTCAACTAACTGGCACGTTCTTTACGGCCC 1051
Query 1259 CCACTGGGATTGCAACTGGCTCTTACCAGCACATTCTTAGTGATTGGCTGGGATCCCAATGGGGAAAGGCCCCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 CCACTGGGATTGCAACTGGCTCTTACCAGCACATTCTTAGTGATTGGCTGGGATCCCAATGGGGAAAGGCCCCC 1125
Query 1333 TCTTCCATCTACTTCTGCGAATCGAAGCTACAGACGTGGTCCAGCTTCACAGACTTCCTAGAAGAAACCTTGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126 TCTTCCATCTACTTCTGCGAATCGAAGCTACAGACGTGGTCCAGCTTCACAGACTTCCTAGAAGAAACCTTGAA 1199
Query 1407 AACAGTAAGGAAGCAGCTGTATCCTTTCTTCAAGGAACTGCAGAAGAGCATCAGTGGCAGGATGATAGGGCAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 AACAGTAAGGAAGCAGCTGTATCCTTTCTTCAAGGAACTGCAGAAGAGCATCAGTGGCAGGATGATAGGGCAGT 1273
Query 1481 TTATGTTTGACACCATGGGTATGACCAACATTCTAAACAACCAAGATACTGCGCAAGCTCTGGCAGATGGATTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274 TTATGTTTGACACCATGGGTATGACCAACATTCTAAACAACCAAGATACTGCGCAAGCTCTGGCAGATGGATTG 1347
Query 1555 ATGGAGTTGTCAAAAGAAGATTCT-------------------------------------------------- 1578
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348 ATGGAGTTGTCAAAAGAAGATTCTGACAAACCTCTGGAATTTTTGTCGTATTTTCTGCTGAAGAAATGTGGCAA 1421
Query 1579 -------------------------------------------------------------------------- 1578
Sbjct 1422 AAAGATCAAAGATGTTGAAGGAAATGTTATTCCAACAAAATGTGACCCAAAGACAACATTCAGTTTATTCATGA 1495
Query 1579 --GAAAGAAATGTTGTAGAAGACAATTCTTGGGACACAAAGTCCAGGCTCAGCAAAAATGATTTAAATTTTGAA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 AGGAAAGAAATGTTGTAGAAGACAATTCTTGGGACACAAAGTCCAGGCTCAGCAAAAATGATTTAAATTTTGAA 1569
Query 1651 GCACTGATTAATCTGGAGAGAATACTCCAGAAGGACTCAGCAGAAAAGCGAGCTAGAGTTGTCAGAGAACTCTT 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 GCACTGATTAATCTGGAGAGAATACTCCAGAAGGACTCAGCAGAAAAGCGAGCTAGAGTTGTCAGAGAACTCTT 1643
Query 1725 ACAGAGTGAGAGAAAATACGTGCAGATACTGGAAATTGTGAGAGATGTTTATGTCGCACCACTGAAAGCAGCAT 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1644 ACAGAGTGAGAGAAAATACGTGCAGATACTGGAAATTGTGAGAGATGTTTATGTCGCACCACTGAAAGCAGCAT 1717
Query 1799 TGTCATCAAACAGAGCGATTCTGAGTGCTGCCAATATCCAGATCATTTTCTGTGACATTCTACAGATTTTAAGT 1872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718 TGTCATCAAACAGAGCGATTCTGAGTGCTGCCAATATCCAGATCATTTTCTGTGACATTCTACAGATTTTAAGT 1791
Query 1873 CTCAACAGGCAGTTTCTAGATAACCTGAGAGACAGACTGCAGGAATGGGGCCCAGCTCACTGTGTGGGAGAAAT 1946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792 CTCAACAGGCAGTTTCTAGATAACCTGAGAGACAGACTGCAGGAATGGGGCCCAGCTCACTGTGTGGGAGAAAT 1865
Query 1947 AGTCACGAAGTTTGGAAGCCAGTTAAACACATATACCAATTTCTTCAACAATTACCCTGTCATTCTGAAAACTA 2020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866 AGTCACGAAGTTTGGAAGCCAGTTAAACACATATACCAATTTCTTCAACAATTACCCTGTCATTCTGAAAACTA 1939
Query 2021 TTGAGAAGTGCAGAGAAATGATACCAGCATTCCGAACTTTCCTGAAGAGGCATGATAAGACCATTGTTACCAAA 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940 TTGAGAAGTGCAGAGAAATGATACCAGCATTCCGAACTTTCCTGAAGAGGCATGATAAGACCATTGTTACCAAA 2013
Query 2095 ATGCTGAGCCTGCCAGAGCTGCTGCTGTACCCATCCCGAAGATTTGAAGAATACCTTAATCTTCTCTACGCTGT 2168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2014 ATGCTGAGCCTGCCAGAGCTGCTGCTGTACCCATCCCGAAGATTTGAAGAATACCTTAATCTTCTCTACGCTGT 2087
Query 2169 CAGGCTTCATACCCCTGCAGAGCATGTTGACCGTGGGGACTTGACCACTGCAATTGACCAAATCAAAAAATATA 2242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088 CAGGCTTCATACCCCTGCAGAGCATGTTGACCGTGGGGACTTGACCACTGCAATTGACCAAATCAAAAAATATA 2161
Query 2243 AAGGTTATATAGATCAGATGAAGCAAAACATCACTATGAAGGATCATCTGTCAGATATACAGAGAATCATCTGG 2316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2162 AAGGTTATATAGATCAGATGAAGCAAAACATCACTATGAAGGATCATCTGTCAGATATACAGAGAATCATCTGG 2235
Query 2317 GGATGCCCTACTCTATCAGAAGTAAACAGATATCTGATTAGGGTACAAGATGTAGCCCAACTTCATTGCTGTGA 2390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2236 GGATGCCCTACTCTATCAGAAGTAAACAGATATCTGATTAGGGTACAAGATGTAGCCCAACTTCATTGCTGTGA 2309
Query 2391 TGAAGAAATAAGTTTCTCTTTAAGGCTCTATGAACACATCCATGATCTCAGCCTTTTCCTCTTCAATGATGCCC 2464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2310 TGAAGAAATAAGTTTCTCTTTAAGGCTCTATGAACACATCCATGATCTCAGCCTTTTCCTCTTCAATGATGCCC 2383
Query 2465 TGCTCGTTTCTAGTCGGGGCACATCTCACACTCCATTTGAGAGGACTTCAAAAACAACCTACCAGTTCATTGCA 2538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384 TGCTCGTTTCTAGTCGGGGCACATCTCACACTCCATTTGAGAGGACTTCAAAAACAACCTACCAGTTCATTGCA 2457
Query 2539 TCAGTGGCCCTTCATCGGTTACTCATAGAAAATATTCCAGATTCCAAGTATGTCAAGAATGCATTTATTCTTCA 2612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 TCAGTGGCCCTTCATCGGTTACTCATAGAAAATATTCCAGATTCCAAGTATGTCAAGAATGCATTTATTCTTCA 2531
Query 2613 GGGTCCAAAATATAAATGGATTTGTGCTACAGAAATAGAGGATGATAAGTTCCTATGGCTGTCAGTACTTCGAA 2686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2532 GGGTCCAAAATATAAATGGATTTGTGCTACAGAAATAGAGGATGATAAGTTCCTATGGCTGTCAGTACTTCGAA 2605
Query 2687 ATGCAATCAAAAGCAGTATGGAGAAG 2712
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606 ATGCAATCAAAAGCAGTATGGAGAAG 2631