Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_05864
• Subject: NM_001290469.1
• Aligned Length: 1022
• Identities: 887
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  MGRGAGREYSPAATTAENGGGKKKQKE-KELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKGLTNQRAQDVLARD  73
            ||.......||.         |.|.|| ..||.|||||||..||.|..|..|||..|...|||...||..||||
Sbjct    1  MGDKKDDKSSPK---------KSKAKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCVQGLTHSKAQEILARD  65

Query   74  GPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYY  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||.||||||.|||||||.|||||||
Sbjct   66  GPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYY  139

Query  148  QEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESE  221
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  140  QEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESE  213

Query  222  PQTRSPEFTHENPLETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITG  295
            ||||||..||.||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct  214  PQTRSPDCTHDNPLETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITG  287

Query  296  VAVFLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTS  369
            ||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  VAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTS  361

Query  370  TICSDKTGTLTKNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKR  443
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||.|.||.|||.|||||||||||.||.||.|.||
Sbjct  362  TICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKR  435

Query  444  DTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPFNSTNKYQLSIHERED-SPQSHVLVMKGAPERILDRCS  516
            |.||||||||||||||||.|||..||.||.|||||||||||||||||||.|| ......||||||||||||||.
Sbjct  436  DVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCA  509

Query  517  TILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMID  590
            |||.||||.|||.||..||||||.|||||||||||||...||...||.||.||.|..||.|..|||||||||||
Sbjct  510  TILLQGKEQPLDEEMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMID  583

Query  591  PPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAKACVVHG  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||
Sbjct  584  PPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAKACVIHG  657

Query  665  SDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDV  738
            .||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct  658  TDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDV  731

Query  739  SKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTD  812
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  732  SKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTD  805

Query  813  MVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLD  886
            |||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||..|.||||.
Sbjct  806  MVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLN  879

Query  887  WDDRTMNDLEDSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEETA  960
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  880  WDDRTVNDLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETA  953

Query  961  LAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEKETYY  1020
            |||||||||||.|||||||||..|||||||||.|||.|||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  954  LAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKETYY  1013