Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_05864
- Subject:
- XM_011250518.2
- Aligned Length:
- 3237
- Identities:
- 2510
- Gaps:
- 216
Alignment
Query 1 ATGGGCCGTGGGGCTGGCCGTGAGTACTCACC-TGCCGCCACCACGGCAG--------AGA----ATGGGGGCG 61
|||||...||| |||...|||...|| ||| ||.|||||||.| |||| ||| |.|.|..||
Sbjct 1 ATGGGGTCTGG---TGGTTCTGACAGCT-ACCGTGTCGCCACCTC-GCAGGACAAAAAAGATGACAAGAGCTCG 69
Query 62 -GCAAGAAGAAACAG-AAGGAGAA---------GGAACTGGATGAGCTGAAGAAGGAGGTGGCAATGGATGACC 124
.||||||| || ||||..|| |||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||...||.|
Sbjct 70 CCCAAGAAG----AGCAAGGCCAAAGAGCGCCGGGACCTGGATGACCTCAAGAAGGAAGTGGCTATGACAGAGC 139
Query 125 ACAAGCTGTCCTTGGATGAGCTGGGCCGCAAATACCA-AGTGGACCT--GTCCAAGGGCCTCACCAAC-CAG-C 193
|||||.||||..|.||.|||.|..||||.||||||.| |.|| .|| ||.| ||||.||.|| || ||| .
Sbjct 140 ACAAGATGTCAGTAGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAATACTG--ACTGCGTGC-AGGGTCTGAC--ACACAGTA 208
Query 194 GGGCTCAGGACGTTCTGGCTCGAGATGGGCCCAACGCCCTCACACCACCTCCCACAACCCCTGAGTGGGTCAAG 267
..||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 209 AAGCCCAGGAGATCCTAGCCCGGGATGGGCCTAACGCCCTCACACCACCGCCCACCACCCCAGAATGGGTCAAG 282
Query 268 TTCTGCCGTCAGCTTTTCGGGGGGTTCTCCATCCTGCTGTGGATTGGGGCTATCCTCTGCTTCCTGGCCTACGG 341
||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 283 TTCTGCCGGCAGCTGTTTGGTGGCTTCTCTATCCTGCTGTGGATCGGGGCAATCCTTTGCTTCCTGGCCTATGG 356
Query 342 CATCCAGGCTGCCATGGAGGATGAACCATCCAACGACAATCTATATCTGGGTGTGGTGCTGGCAGCTGTGGTCA 415
|||||||||.|..|.|||||||||.||.|||...||||||||.||.|||||..|.||||||||.||.||.||.|
Sbjct 357 CATCCAGGCAGGGACGGAGGATGACCCTTCCGGTGACAATCTGTACCTGGGCATAGTGCTGGCCGCAGTCGTGA 430
Query 416 TTGTCACTGGCTGCTTCTCCTACTACCAGGAGGCCAAGAGCTCCAAGATCATGGATTCCTTCAAGAACATGGTA 489
|..||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 431 TCATCACCGGCTGCTTCTCCTACTACCAAGAAGCCAAGAGTTCTAAGATCATGGAGTCCTTCAAGAACATGGTC 504
Query 490 CCTCAGCAAGCCCTTGTGATCCGGGAGGGAGAGAAGATGCAGATCAACGCAGAGGAAGTGGTGGTGGGAGACCT 563
||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.|.||.||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 505 CCCCAGCAAGCCCTTGTGATCCGGGAAGGTGAAAAGATGCAGGTGAATGCGGAGGAGGTGGTGGTCGGGGACCT 578
Query 564 GGTGGAGGTGAAGGGTGGAGACCGCGTCCCTGCTGACCTCCGGATCATCTCTTCTCATGGCTGTAAGGTGGATA 637
|||||||.|.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.|
Sbjct 579 GGTGGAGATCAAGGGTGGTGACCGGGTGCCAGCTGACCTGCGCATCATCTCGGCCCATGGCTGCAAGGTGGACA 652
Query 638 ACTCATCCTTAACAGGAGAGTCGGAGCCCCAGACCCGCTCCCCCGAGTTCACCCATGAGAACCCCCTGGAGACC 711
||||.|||.|.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|.|||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 653 ACTCCTCCCTGACTGGCGAATCTGAGCCTCAGACCCGCTCCCCGGACTGCACACACGACAACCCCCTGGAGACT 726
Query 712 CGCAATATCTGTTTCTTCTCCACCAACTGTGTTGAAGGCACTGCCAGGGGCATTGTGATTGCCACAGGAGACCG 785
||.||.|||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||..||||..|.|||.|.||||||||.|||||
Sbjct 727 CGGAACATCACCTTCTTTTCCACCAACTGCGTGGAAGGCACCGCTCGGGGTGTGGTGGTAGCCACAGGTGACCG 800
Query 786 GACGGTGATGGGCCGCATAGCTACTCTCGCCTCAGGCCTGGAGGTTGGGC-GGACACCCATAGCAATGGAGATT 858
.||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||.|||||| ||||| .|||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 801 CACCGTCATGGGCCGCATTGCCACCCTGGCCTCGGGCTTGGAGG-TGGGCAAGACGCCCATCGCCATTGAGATT 873
Query 859 GAACACTTCATCCAGCTGATCACAGGGGTCGCTGTATTCCTGGGGGTCTCCTTCTTCGTGCTCTCCCTCATCCT 932
||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.||
Sbjct 874 GAGCATTTCATCCAGCTCATTACGGGCGTGGCCGTGTTCCTGGGCGTGTCCTTCTTCATCCTCTCTCTCATTCT 947
Query 933 GGGCTACAGCTGGCTGGAGGCAGTCATCTTCCTCATCGGCATCATAGTGGCCAACGTGCCTGAGGGGCTTCTGG 1006
|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 948 GGGTTACACCTGGCTCGAGGCAGTCATCTTCCTCATCGGCATCATTGTGGCCAATGTCCCAGAGGGGCTGCTGG 1021
Query 1007 CCACTGTCACTGTGTGCCTGACCCTGACAGCCAAGCGCATGGCACGGAAGAACTGCCTGGTGAAGAACCTGGAG 1080
|.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 CTACTGTCACGGTGTGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCTCGCAAGAACTGCCTGGTGAAGAACCTGGAG 1095
Query 1081 GCGGTGGAGACGCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCGGACAAGACGGGCACCCTCACCAAGAACCGCATGAC 1154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1096 GCGGTGGAGACGCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCGGACAAGACCGGCACTCTCACCCAGAACCGCATGAC 1169
Query 1155 CGTCGCCCACATGTGGTTCGACAACCAAATCCATGAGGCTGACACCACCGAAGATCAGTCTGGGGCCACTTTTG 1228
||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||.||.||||.|
Sbjct 1170 CGTCGCCCACATGTGGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCAGACACCACAGAGGATCAGTCAGGGACCTCTTTCG 1243
Query 1229 ACAAACGATCCCCTACGTGGACGGCCCTGTCTCGAATTGCTGGTCTCTGCAACCGCGCCGTCTTCAAGGCAGGA 1302
||||..|.||.|..||.|||..|||||||||.|..||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||..||.
Sbjct 1244 ACAAGAGCTCACACACCTGGGTGGCCCTGTCCCACATCGCCGGGCTCTGCAACCGGGCCGTCTTCAAGGGCGGG 1317
Query 1303 CAGGAGAACATCTCCGTGTCT-AAGCGGGACACAGCTGGTGATGCCTCTGAGTCAGCTCTGCTCAAGTGCATTG 1375
|||||.||||||.|.|| .|| |||.|||||...||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1318 CAGGACAACATCCCAGT-ACTCAAGAGGGACGTGGCCGGTGATGCCTCCGAGTCTGCCCTGCTTAAGTGCATTG 1390
Query 1376 AGCTCTCCTGTGGCTCAGTGAGGAAA----ATGAGAG-ACAGAAACCCCAAG---GTGGCAGAGATTCCTTTCA 1441
||||.||||..||.||.|| ||| |||.||| ||.||| |||| |||||.||||||||.||||
Sbjct 1391 AGCTGTCCTCGGGTTCCGT----AAAGCTGATGCGAGAACGGAA----CAAGAAAGTGGCTGAGATTCCGTTCA 1456
Query 1442 ACTCTACCAACAAGTACCAGCTGTCTATCCACGAG--CGAG-------AAGACAGCCCCCAGAGCCACGTGCTG 1506
||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||| .||| |.||||.|| |..||.||||.
Sbjct 1457 ACTCGACCAACAAATACCAGCTATCCATCCATGAGACTGAGGATCCCAATGACAACC------GGTACCTGCTA 1524
Query 1507 GTGATGAAGGGGGCCCCAGAGCGCATTCTGGACCGGTGCTCCACCATCCTGGTGCAGGGCAAGGAGATCCCGCT 1580
|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||..||||||||||..||||||||||||||...||.||
Sbjct 1525 GTGATGAAGGGCGCCCCCGAACGCATTCTGGACCGCTGTGCCACCATCCTCCTGCAGGGCAAGGAGCAGCCTCT 1598
Query 1581 CGACAAGGAGATGCAAGATGCCTTTCAAAATGCCTACATGGAGCTGGGGGGACTTGGGGAGCGTGTGCTGGGAT 1654
.||..||||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1599 GGATGAGGAGATGAAGGAGGCCTTCCAGAATGCCTACCTGGAGCTTGGTGGCCTGGGCGAGCGTGTGCTGGGTT 1672
Query 1655 TCTGTCA--ACTGAATCTGCCATCTGGAA-AGTTTCCTCGGGGCTTCAAATTCGACACGGATGAGCTGAACTTT 1725
||||.|| ||| |.||||| |..|||| ||||.||...||||||....||.|||...|||||..|||||||.
Sbjct 1673 TCTGCCATTACT--ACCTGCC-TGAGGAACAGTTCCCCAAGGGCTTTGCCTTTGACTGTGATGACGTGAACTTC 1743
Query 1726 CCCACGGAGAAGCTTTGCTTTGTGGGGCTCATGTCTATGATTGACCCTCCCCGGGCTGCTGTGCCAGATGCTGT 1799
.||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 1744 ACCACAGACAACCTTTGCTTTGTGGGTCTCATGTCCATGATTGACCCTCCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGCTGT 1817
Query 1800 GGGCAAGTGCCGAAGCGCAGGCATCAAGGTGATCATGGTAACCGGGGATCACCCTATCACAGCCAAGGCCATTG 1873
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1818 GGGCAAATGCCGAAGCGCAGGCATCAAGGTCATCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACTGCCAAGGCCATTG 1891
Query 1874 CCAAAGGCGTGGGCATCATATCAGAGGGTAACGAGACTGTGGAGGACATTGCAGCCCGGCTCAACATTCCCATG 1947
||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..|.
Sbjct 1892 CCAAGGGTGTGGGTATCATCTCTGAGGGTAACGAGACTGTCGAAGACATCGCTGCCCGGCTCAACATCCCTGTC 1965
Query 1948 AGTCAAGTCAACCCCAGAGAAGCCAAGGCATGCGTGGTGCACGGCTCTGACCTGAAGGACATGACATCGGAGCA 2021
||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||.|||.|.||||||.|.|||||.||||||.|.||.||||||||
Sbjct 1966 AGCCAGGTGAACCCCAGGGATGCCAAAGCCTGTGTGATTCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCGGAGCA 2039
Query 2022 GCTCGATGAGATCCTCAAGAACCACACAGAGATCGTCTTTGCTCGAACGTCTCCCCAGCAGAAGCTCATCATTG 2095
|.|.||.|||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2040 GATTGACGAGATTCTGCAGAACCACACCGAGATCGTCTTTGCCCGAACCTCCCCTCAGCAGAAGCTCATCATCG 2113
Query 2096 TGGAGGGATGTCAGAGGCAGGGAGCCATTGTGGCCGTGACGGGTGACGGGGTGAACGACTCCCCTGCATTGAAG 2169
|||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 2114 TGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGAGCAATTGTGGCTGTGACTGGCGATGGTGTGAATGACTCCCCTGCTCTGAAG 2187
Query 2170 AAGGCTGACATTGGCATTGCCATGGGCATCTCTGGCTCTGACGTCTCTAAGCAGGCAGCCGACATGATCCTGCT 2243
|||||||||||.||..|.|||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2188 AAGGCTGACATCGGGGTGGCCATGGGCATTGCTGGCTCTGATGTCTCTAAGCAGGCTGCCGACATGATTCTGCT 2261
Query 2244 GGATGACAACTTTGCCTCCATCGTCACGGGGGTGGAGGAGGGCCGCCTGATCTTTGACAACTTGAAGAAATCCA 2317
|||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2262 GGATGACAACTTTGCTTCCATTGTCACTGGTGTGGAGGAAGGCCGCCTGATCTTTGACAACCTGAAGAAATCCA 2335
Query 2318 TCGCCTACACCCTGACCAGCAACATCCCCGAGATCACCCCCTTCCTGCTGTTCATCATTGCCAACATCCCCCTA 2391
||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 2336 TCGCCTACACTCTGACTAGCAACATCCCTGAGATCACACCCTTCCTGCTCTTCATCATGGCTAACATCCCACTG 2409
Query 2392 CCTCTGGGCACTGTGACCATCCTTTGCATTGACCTGGGCACAGATATGGTCCCTGCCATCTCCTTGGCCTATGA 2465
|||||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.|||||||.||
Sbjct 2410 CCTCTTGGCACCATCACCATCCTCTGCATTGACCTGGGTACCGACATGGTCCCTGCAATCTCCCTGGCCTACGA 2483
Query 2466 GGCAGCTGAGAGTGATATCATGAAGCGGCAGCCACGAAACTCCCAGACGGACAAGCTGGTGAATGAGAGGCTCA 2539
|||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||..|.|||.|.|..||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 2484 GGCTGCCGAGAGCGACATCATGAAGAGGCAGCCCAGGAACCCACGCACAGACAAACTGGTCAACGAAAGGCTCA 2557
Query 2540 TCAGCATGGCCTACGGACAGATCGGGATGATCCAGGCACTGGGTGGCTTCTTCACCTACTTTGTGATCCTGGCA 2613
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 2558 TCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGGATGATCCAGGCCCTCGGTGGTTTCTTCTCCTACTTTGTCATCCTGGCA 2631
Query 2614 GAGAACGGTTTCCTGCCATCACGG----CTACTGGGAATCCGCCTCGACTGGGATGACCGGACCATGAATGATC 2683
||.||.||.|||.|||| ||| ||..||||.|||||.|||.||||||||||.||.||..|.|||||.|
Sbjct 2632 GAAAATGGCTTCTTGCC----CGGAAACCTGGTGGGCATCCGGCTCAACTGGGATGATCGCACTGTCAATGACC 2701
Query 2684 TGGAGGACAGCTATGGACAGGAGTGGACCTATGAGCAGCGGAAGGTGGTGGAGTTCACGTGCCACACGGCATTC 2757
|.||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 2702 TAGAAGACAGTTATGGGCAGCAGTGGACTTATGAGCAGAGGAAGGTGGTAGAGTTCACATGCCACACAGCCTTC 2775
Query 2758 TTTGCCAGCATCGTGGTGGTGCAGTGGGCTGACCTCATCATCTGCAAGACCCGCCGCAACTCAGTCTTCCAGCA 2831
||||..||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|..|.|||||.|||||||||||
Sbjct 2776 TTTGTGAGTATCGTGGTGGTCCAGTGGGCTGACCTGATCATCTGCAAGACCAGGAGGAACTCCGTCTTCCAGCA 2849
Query 2832 GGGCATGAAGAACAAGATCCTGATTTTTGGGCTCCTGGAGGAGACGGCGTTGGCTGCCTTTCTCTCTTACTGCC 2905
||||||||||||.||||||.||||.||.||..|..|.|||||||||||..|.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 2850 GGGCATGAAGAATAAGATCTTGATCTTCGGCTTGTTTGAGGAGACGGCCCTCGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCC 2923
Query 2906 CAGGCATGGGTGTAGCCCTCCGCATGTACCCGCTCAAAGTCACCTGGTGGTTCTGCGCCTTCCCCTACAGCCTC 2979
|||||||||.|||.|||||.|||||||||||.|||||...||.||||||||||||.||||||||||||||..||
Sbjct 2924 CAGGCATGGATGTGGCCCTTCGCATGTACCCTCTCAAGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTC 2997
Query 2980 CTCATCTTCATCTATGATGAGGTCCGAAAGCTCATCCTGCGGCGGTATCCTGG--------------------- 3032
|||||||||.|||||||||||.|.||.||.|||||||||||..||.|.||.||
Sbjct 2998 CTCATCTTCGTCTATGATGAGATTCGCAAACTCATCCTGCGCAGGAACCCCGGGGGTGAGGGCCGCATGGCCAG 3071
Query 3033 ------TGGCTGGGTGGAGAAGGAGA-------CATACTAC--------------------------------- 3060
.|||||||.||.||||.||| | |||.|
Sbjct 3072 GGGTAAAGGCTGGGAGGGGAAGCAGAGGGTGAGC--ACTCCCTGTGCCTCTCAGATGTGTCCGTTCTTCTTTCT 3143
Query 3061 ------------------------------------------------------- 3060
Sbjct 3144 CTTCCCTCTCTCCCCGCCTTGCCTTTCACTCTCTTTCCAAGTGCGACTGTGTGTC 3198