Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_06063
Subject:
NM_001282599.1
Aligned Length:
918
Identities:
557
Gaps:
347

Alignment

Query   1  MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHVLAASVEQATQNFLEK  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMR  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  LLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFGKEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYT  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  ASQAFLRHPDVAATRANRDYVFKQVQEAIAGISNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMTFSE  296
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 297  ARFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMNN-------------TGRKE  357
                                                 ....|..||........|             |||||
Sbjct   1  --------------------------------------MDGWRRPLQSVGKVCEKNMKTSEMHTMSGAQTGRKE  36

Query 358  KGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEV  431
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  37  KGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEV  110

Query 432  ANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITS  505
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111  ANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITS  184

Query 506  VDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSE  579
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185  VDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSE  258

Query 580  TVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRT  653
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259  TVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRT  332

Query 654  SVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTD  727
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333  SVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTD  406

Query 728  FTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQN  801
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407  FTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQN  480

Query 802  LGGELIVSGLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPE  875
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481  LGGELIVSGLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPE  554

Query 876  EFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF  905
           ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555  EFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF  584