Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06063
• Subject: XM_011241195.2
• Aligned Length: 2905
• Identities: 2272
• Gaps: 386

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATG  35
                                                   |||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||
Sbjct    1  ATGACAGATATTCACTCAAGCTACACATACACAGGGAGCATGACTTCGGCAACTTCACCTATTATTTTAAAATG  74

Query   36  GGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGAAAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTA  109
            |||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  GGATCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACACTCACAGTGGAAAGACTATTGGAGCCACTTGTGACACAGGTGACAA  148

Query  110  CACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAAAGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCT  183
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  CACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGTCCGTCTGGTAAAAAGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTGCTGGCA  222

Query  184  GCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAGGGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAA  257
            ||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  223  GCATCTGTAGAACAAGCTACTCAGAACTTCCTGGAAAAGGGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGCCAAGACCTCAA  296

Query  258  AGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACAAGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTG  331
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  297  AGAAGAGTTAGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGGAAGCAAGGTGAGACAATGCGGATTGCCTCCTCAGAGTTTG  370

Query  332  CAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGGTACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACA  405
            ||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||.|||||.||||.||.||.||||||
Sbjct  371  CAGATGACCCTTGCTCTTCTGTCAAGCGTGGCACCATGGTGCGTGCAGCACGGGCTCTGCTATCGGCTGTGACA  444

Query  406  CGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGACTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCT  479
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|
Sbjct  445  CGCTTGCTCATCCTGGCCGACATGGCAGATGTCATGAGGCTTTTATCGCATCTGAAAATTGTCGAGGAGGCCTT  518

Query  480  GGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGCAAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGA  553
            ||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAAGCAGTCAAAAATGCCACAAATGAACAAGACCTTGCAAACCGATTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGA  592

Query  554  AACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGAAGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCC  627
            ||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||
Sbjct  593  AACTGAACTATGTAGCAGCAAGACGGCAGCAGGAGCTCAAGGACCCTCACTGTAGGGATGAGATGGCTGCAGCC  666

Query  628  CGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACGGCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGC  701
            ||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  667  CGTGGAGCCCTGAAGAAGAATGCCACCATGCTGTACACAGCCTCCCAAGCCTTCCTCCGGCATCCAGATGTTGC  740

Query  702  CGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGTCCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTC  775
            .|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||||||||
Sbjct  741  TGCTACAAGAGCCAACCGAGATTATGTATTTAAACAAGTCCAAGAGGCCATAGCTGGCATCTCCAGTGCTGCTC  814

Query  776  AAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGGGCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTT  849
            |.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  815  AGGCCACCTCCCCCACCGATGAAGCCAAAGGCCACACAGGCATCGGCGAGCTGGCTGCAGCCCTGAATGAGTTT  888

Query  850  GACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAGGCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGA  923
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  GATAATAAGATCATCCTGGACCCCATGACATTCAGCGAGGCCAGGTTCCGACCATCCCTGGAGGAGAGACTGGA  962

Query  924  GAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTCCTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGG  997
            ||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||.||||
Sbjct  963  GAGCATCATCAGTGGGGCTGCTCTCATGGCAGATTCCTCCTGCACACGTGATGACCGCCGTGAGCGTATTGTGG  1036

Query  998  CGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGCTCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAA  1071
            |.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  CCGAGTGCAATGCAGTTCGACAGGCACTCCAGGACCTGCTAAGCGAGTACATGAATAACACTGGAAGGAAAGAG  1110

Query 1072  AAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACTAAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAA  1145
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGGAGACCCTCTCAACATTGCGATTGACAAGATGACCAAGAAAACAAGAGATCTGAGGAGACAGCTTCGGAA  1184

Query 1146  AGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAACCAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAA  1219
            |||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  AGCTGTGATGGATCACATCTCAGATTCTTTCTTGGAAACCAATGTCCCCTTGCTGGTTCTCATTGAGGCTGCGA  1258

Query 1220  AGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAGTTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTT  1293
            |||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259  AGAGCGGGAATGAGAAGGAGGTGAAGGAATACGCCCAAGTTTTCCGTGAACATGCCAACAAGCTGGTGGAGGTT  1332

Query 1294  GCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGGGTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGA  1367
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCAATTTGGCTTGTTCCATCTCCAACAATGAGGAAGGGGTGAAATTAGTCAGAATGGCAGCCACCCAGATTGA  1406

Query 1368  CAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACTGGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATA  1441
            |||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1407  CAGCCTGTGTCCCCAAGTCATTAATGCTGCCCTCACACTGGCTGCTCGGCCACAGAGTAAAGTTGCTCAGGACA  1480

Query 1442  ACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCCGAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCA  1515
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1481  ACATGGATGTCTTCAAAGACCAGTGGGAAAAGCAAGTCCGTGTGCTCACTGAGGCAGTGGATGACATCACCTCT  1554

Query 1516  GTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTGGAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGA  1589
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1555  GTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAACCATATCTTGGAGGATGTGAACAAATGTGTGATTGCCCTGCAAGA  1628

Query 1590  GGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCATCAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCA  1663
            |||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||..|||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1629  GGGAGATGTGGACACACTGGATCGCACAGCTGGGGCCATACGGGGCCGGGCAGCCCGGGTCATTCACATCATCA  1702

Query 1664  ATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTGAGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAA  1737
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  ATGCAGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTCTATACAGAGAAAGTGCTGGAAGCCACAAAATTGCTTTCAGAA  1776

Query 1738  ACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCCATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTT  1811
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1777  ACAGTGATGCCACGCTTTGCTGAACAAGTTGAGGTGGCCATCGAAGCCCTGAGCGCCAATGTCCCTCAGCCATT  1850

Query 1812  TGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTATGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGA  1885
            .||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGAGGAGAACGAGTTCATCGATGCCTCGCGCCTGGTGTATGACGGTGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGA  1924

Query 1886  TGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACTTTGAGCAAGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACA  1959
            ||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||..|||||
Sbjct 1925  TGATCAGGACTCCAGAAGAGCTAGAAGATGATTCCGACTTTGAGCAAGAGGATTATGATGTGCGGAGTCGGACA  1998

Query 1960  AGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAGAGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGA  2033
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1999  AGTGTTCAGACAGAGGACGACCAGCTCATTGCTGGACAGAGTGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCACAGGA  2072

Query 2034  GGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCATCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCA  2107
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2073  GGAGAAAGCAAAAATAGCTGAACAGGTGGAGATTTTCCACCAAGAAAAAAGCAAGCTGGATGCTGAAGTGGCCA  2146

Query 2108  AATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCAAGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGAC  2181
            |.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2147  AGTGGGATGACAGCGGCAATGACATCATTGTGCTGGCCAAGCAGATGTGTATGATCATGATGGAGATGACAGAC  2220

Query 2182  TTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGATGTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGG  2255
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2221  TTCACAAGAGGCAAAGGCCCACTGAAAAATACATCTGATGTCATTAATGCTGCCAAGAAGATTGCAGAAGCAGG  2294

Query 2256  TTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCAGTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAG  2329
            .||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTCTCGAATGGACAAATTAGCGCGCGCTGTGGCTGATCAGTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAG  2368

Query 2330  CCTACCTTCAACGAATTGCCTTGTATTGCCATCAGCTTAATATCTGCAGCAAGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAAT  2403
            ||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2369  CCTACCTTCAGCGGATTGCTTTGTACTGCCATCAGCTTAACATCTGCAGCAAAGTGAAGGCCGAGGTTCAGAAC  2442

Query 2404  CTGGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGG------------------------------------------------  2429
            ||.|||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 2443  CTAGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGACAGGAGTTCAGAGCACTTTCACTACCTTTTATGAGGTAGATTGTGA  2516

Query 2430  --------------------------------------------------------------------------  2429
                                                                                      
Sbjct 2517  TGTCATAGATGGGGGCAGGGCTAGTCAACTTTCTACCCACCTCCCAACCTGTGCTGAGGGAGCTCCAATCGGGA  2590

Query 2430  -----------------------------GCTGGACAGTGCCACATCGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGAT  2474
                                         ||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2591  GTGGAAGCAGTGACTCCTCCATGCTGCCAGCTGGACAGTGCTACATCACTCATCCAGGCAGCCAAAAACCTGAT  2664

Query 2475  GAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTCAACCAAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAG  2548
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||                             
Sbjct 2665  GAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCGTCTTATGTAGCCTCAAC-----------------------------  2709

Query 2549  CTGTCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAGAGAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCT  2622
                                                                                      
Sbjct 2710  --------------------------------------------------------------------------  2709

Query 2623  GAAGAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAACACATTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATT  2696
                                                                                      
Sbjct 2710  --------------------------------------------------------------------------  2709

Query 2697  CAAAGCAATGGATTCCTTC  2715
                               
Sbjct 2710  -------------------  2709