Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06177
• Subject: XM_006512523.3
• Aligned Length: 1849
• Identities: 1647
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGAAGACTCCCAGGATTTAAATGAACAATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAATCTCA  74
            |||||||||.|||||||..|||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||||..||.||||
Sbjct    1  ATGGAAGACACCCAGGACCTAAATGAGCAATCTGTAAAGAAAACGTGCCCAGAAGCAGATGTTTCGGAACCTCA  74

Query   75  GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACTCCAGGT  147
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.||.||.
Sbjct   75  GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACACCTGGG  147

Query  148  AGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC  221
            ||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  AGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGGAGTGTCTCTTCTTGC  221

Query  222  AGTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG  295
            |||||||||||||||||||.||||||||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  AGTCAAAACAGAGCCCTTGCACAGCAGTGAGTCCACTACCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTG  295

Query  296  GGTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCTTCCAAG  369
            ||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  296  GGTCAGTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCCTCCAAG  369

Query  370  CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTATTCGGG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  370  CCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTACTCTGG  443

Query  444  GATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACGATTTGG  517
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||||.|.|
Sbjct  444  GATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACGATCTTG  517

Query  518  GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGCTGCCTC  591
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  518  GTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGCTGCCTG  591

Query  592  AGTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTCTAGTTT  665
            ||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  592  AGCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTCCAGCTT  665

Query  666  TGCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAACAGGATT  739
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||
Sbjct  666  TGCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGCAGGATT  739

Query  740  ATCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCGTATATG  813
            |.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  740  ACCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCATACATG  813

Query  814  ACATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCCAGGACT  887
            |||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct  814  ACATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCAAGGACT  887

Query  888  GACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGAGAACCT  961
            |||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  888  GACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACAGAACAT  961

Query  962  GTAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGTGACCTG  1035
            ||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  962  GTAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGTGACCTA  1035

Query 1036  GAGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTATGCACA  1109
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1036  GAGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTATGCACA  1109

Query 1110  GAAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATCTTGCTG  1183
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1110  GAAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATCTTGCAG  1183

Query 1184  ATACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGATGATAAT  1257
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1184  ATACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGACGACAAT  1257

Query 1258  GGGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCTTTGTTT  1331
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1258  GGTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCTTTGTTT  1331

Query 1332  GCCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAGAATTAT  1405
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1332  GCCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGGAATTAT  1405

Query 1406  ATAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTAAGGGCA  1479
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1406  ATAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTAAGGGCA  1479

Query 1480  GAGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAGGAGTAA  1553
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480  GAGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAGGAGTAA  1553

Query 1554  CTGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTTTAGGAG  1627
            |||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..||||||
Sbjct 1554  CTGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCCTAGGAG  1627

Query 1628  GTGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATAATGCAA  1701
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||...
Sbjct 1628  GTGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGCAAGGAAAGCTGTTTTGAGCGTATAGTGTCC  1701

Query 1702  AGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAAGCACAA  1775
            ||.|||||||..||..||...||||||||.|||||.|||||....||.||.||.||.||.||.||..|||||||
Sbjct 1702  AGATTTGGCACTAACATAACTTATGTTGTGATTGGAGATGGCCGGGATGAGGAGCACGCTGCTAACCAGCACAA  1775

Query 1776  CATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1848
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  CATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1848