Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06177
- Subject:
- XM_011243112.2
- Aligned Length:
- 1855
- Identities:
- 1615
- Gaps:
- 38
Alignment
Query 1 ATGGAAGACTCCCAGGATTTA-AATG--AACA--ATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAA 69
|| ||||| |.||| |||| |.|| .||.|.||| |||||..|| ||
Sbjct 1 AT-GAAGA--------AGTTACAATGTCATCATGTTCTGGAAA------------AGAATTGGA--------AA 45
Query 70 TCTCAGAATT-CCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACT 141
| |...|||| ..|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.
Sbjct 46 T-TATTAATTGGAAGGTCTATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACA 117
Query 142 CCAGGTAGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAGTGTCTCT 215
||.||.||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CCTGGGAGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGGAGTGTCTCT 191
Query 216 TCTTGCAGTCAAAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTT 289
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||..||||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 TCTTGCAGTCAAAACAGAGCCCTTGCACAGCAGTGAGTCCACTACCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTT 265
Query 290 TTACTGGGTCAGTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCT 363
||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 266 TTACTGGGTCAGTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCC 339
Query 364 TCCAAGCCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTA 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 TCCAAGCCCTATCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTA 413
Query 438 TTCGGGGATGCAGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACG 511
.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||
Sbjct 414 CTCTGGGATGCAGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACG 487
Query 512 ATTTGGGTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGC 585
||.|.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 488 ATCTTGGTGTGATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGC 561
Query 586 TGCCTCAGTTACAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTC 659
|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 562 TGCCTGAGCTACAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTC 635
Query 660 TAGTTTTGCACCATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAAC 733
.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|
Sbjct 636 CAGCTTTGCACCATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGC 709
Query 734 AGGATTATCCATCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCG 807
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 710 AGGATTACCCATCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCA 783
Query 808 TATATGACATCGAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCC 881
||.||||||||.||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.
Sbjct 784 TACATGACATCAAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCA 857
Query 882 AGGACTGACTAACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGA 955
|||||||||||.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 858 AGGACTGACTAGCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACA 931
Query 956 GAACCTGTAGGAGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGT 1029
||||.|||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 932 GAACATGTAGAAGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGT 1005
Query 1030 GACCTGGAGCGTGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTA 1103
|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1006 GACCTAGAGCGTGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTA 1079
Query 1104 TGCACAGAAGTATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATC 1177
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1080 TGCACAGAAGTATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATC 1153
Query 1178 TTGCTGATACTCATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGAT 1251
||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1154 TTGCAGATACACATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGAC 1227
Query 1252 GATAATGGGCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCT 1325
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1228 GACAATGGTCAGGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCT 1301
Query 1326 TTGTTTGCCAACAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAG 1399
||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1302 TTGTTTGCCAACAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGG 1375
Query 1400 AATTATATAACACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTA 1473
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1376 AATTATATAACACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTA 1449
Query 1474 AGGGCAGAGATTGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAG 1547
|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1450 AGGGCAGAGATCGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAG 1523
Query 1548 GAGTAACTGCATAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTT 1621
|||||||||..||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..
Sbjct 1524 GAGTAACTGTGTAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCC 1597
Query 1622 TAGGAGGTGCTTTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATA 1695
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1598 TAGGAGGTGCTTTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGCAAGGAAAGCTGTTTTGAGCGTATA 1671
Query 1696 ATGCAAAGGTTTGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAA 1769
.||...||.|||||||..||..||...||||||||.|||||.|||||....||.||.||.||.||.||.||..|
Sbjct 1672 GTGTCCAGATTTGGCACTAACATAACTTATGTTGTGATTGGAGATGGCCGGGATGAGGAGCACGCTGCTAACCA 1745
Query 1770 GCACAACATGCCCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGT 1843
|||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1746 GCACAACATGCCCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGT 1819
Query 1844 ATTTG 1848
|||||
Sbjct 1820 ATTTG 1824