Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06177
• Subject: XM_017313799.1
• Aligned Length: 1918
• Identities: 1677
• Gaps: 71

Alignment

Query    1  ATGGAAGACTCCCAGGATTTAAATGAACAATCAGTAAAGAAAACGTGCACAGAATCAGATGTTTCACAATCTCA  74
            |||||||||.|||||||..|||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||||..||.||||
Sbjct    1  ATGGAAGACACCCAGGACCTAAATGAGCAATCTGTAAAGAAAACGTGCCCAGAAGCAGATGTTTCGGAACCTCA  74

Query   75  GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAGGACCTAGCAAGTCCTCATACTCTT-GTTGGAGGTGGTGATACTCCAGGT  147
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.| ||| ||||||||..|||||||.||.||.
Sbjct   75  GAATTCCAGGTCTATGGAAATGCAAGACCTAGCAAGTCCCCATGC-CTTGGTTGGAGGCAGTGATACACCTGGG  147

Query  148  AGCTCCAAACTGGAAAAATCTAATCTCAGCAGCACATCAGTTACTACAAATGGGACAGGAG-------------  208
            ||||||||.|||||.||||||..||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||             
Sbjct  148  AGCTCCAAGCTGGATAAATCTGGTCTCAGCAGCACTTCAGTCACAACAAATGGGACAGGAGGGGACAACATGAC  221

Query  209  --------------------------------------------------------TGTCTCTTCTTGCAGTCA  226
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  222  TGTTTTAAACACAGCAGACTGGCTGCTGAGTTGCAACACCCCCTCTTCTGCAACAATGTCTCTTCTTGCAGTCA  295

Query  227  AAACAGAGCCCTTGAACAGCAGTGAAACCACAGCCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTGGGTCA  300
            ||||||||||||||.||||||||||..||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  AAACAGAGCCCTTGCACAGCAGTGAGTCCACTACCACGACTGGAGATGGAGCGCTTGACACTTTTACTGGGTCA  369

Query  301  GTAATTACAAGTAGTGGCTACAGCCCCAGATCAGCACATCAGTATTCCCCACAGCTGTATCCTTCCAAGCCCTA  374
            |||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  370  GTAATAACAAGCAGCGGCTACAGCCCCAGGTCGGCGCAGCAGTACTCTCCACAGCTGTACCCCTCCAAGCCCTA  443

Query  375  TCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCTGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTATTCGGGGATGC  448
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  444  TCCACACATTCTTTCTACACCAGCAGCTCAAACAATGTCGGCCTATGCAGGCCAGACTCAGTACTCTGGGATGC  517

Query  449  AGCAGCCAGCCGTCTACACAGCCTACTCACAGACAGGACAGCCCTACAGCTTGCCCACTTACGATTTGGGTGTG  522
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||..|.||||||.|.||||||
Sbjct  518  AGCAGCCGGCCGTCTACACAGCCTACTCGCAGACAGGACAGCCCTACAGCCTGCCTGCCTACGATCTTGGTGTG  591

Query  523  ATGTTGCCAGCCATCAAGACAGAGAGTGGACTTTCCCAAACTCAGTCCCCATTACAGAGTGGCTGCCTCAGTTA  596
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  592  ATGTTGCCAGCCATCAAGACGGAAAGTGGGCTTTCCCAAACTCAGTCCCCGTTACAGAGTGGCTGCCTGAGCTA  665

Query  597  CAGCCCAGGGTTCTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACACCTTATTCTTACCAAATGCCAGGTTCTAGTTTTGCAC  670
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  666  CAGCCCTGGGTTTTCTACCCCACAGCCAGGCCAGACGCCTTACTCTTACCAAATGCCAGGTTCCAGCTTTGCAC  739

Query  671  CATCATCTACTATTTATGCAAATAATTCAGTTTCCAATTCAACAAATTTCAGTGGTTCACAACAGGATTATCCA  744
            ||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||.|||
Sbjct  740  CATCGTCTACTATTTATGCAAATAATTCCGTTTCTAATTCAACAAACTTCAGCAGCTCACAGCAGGATTACCCA  813

Query  745  TCCTATACAGCCTTTGGCCAAAACCAGTATGCACAGTATTATTCAGCATCAACGTATGGAGCGTATATGACATC  818
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct  814  TCCTACACAGCCTTTGGCCAAAACCAATATGCTCAGTATTACTCAGCATCAACCTATGGGGCATACATGACATC  887

Query  819  GAATAACACAGCCGATGGCACACCCTCTTCAACCTCTACTTATCAGTTGCAGGAATCTCTCCCAGGACTGACTA  892
            .||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  888  AAACAACACAGCTGACGGCACATCATCGTCAACATCAACTTATCAGCTGCAGGAATCTCTCCAAGGACTGACTA  961

Query  893  ACCAACCAGGAGAGTTCGATACCATGCAGAGTCCCTCCACACCCATCAAAGATCTTGATGAGAGAACCTGTAGG  966
            .|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  962  GCCAACCAGGAGAGTTTGATACAGTGCAGAGTCCCTCCACACCAATCAAAGATCTCGATGACAGAACATGTAGA  1035

Query  967  AGTTCTGGGTCAAAGTCCAGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCGCCTCCTGATAGTGACCTGGAGCG  1040
            |||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1036  AGTTCTGGGTCAAAGTCTCGAGGAAGAGGCCGGAAAAATAATCCCTCCCCACCTCCGGACAGTGACCTAGAGCG  1109

Query 1041  TGTGTTTGTCTGGGATTTGGATGAAACCATCATTGTTTTTCACTCACTGCTCACCGGGTCTTATGCACAGAAGT  1114
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1110  TGTGTTTGTCTGGGACTTGGATGAAACCATCATCGTCTTCCACTCTCTCCTCACGGGCTCTTATGCACAGAAGT  1183

Query 1115  ATGGCAAGGATCCCCCCATGGCTGTAACCCTTGGACTCCGCATGGAAGAAATGATTTTTAATCTTGCTGATACT  1188
            ||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1184  ATGGCAAGGATCCCCCAATGGCTGTGACTCTCGGGCTCCGGATGGAAGAAATGATCTTTAATCTTGCAGATACA  1257

Query 1189  CATTTGTTTTTTAATGATTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCTGATGATAATGGGCA  1262
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1258  CATTTGTTTTTTAATGACTTAGAGGAGTGTGATCAAGTTCATATAGATGATGTTTCCTCCGACGACAATGGTCA  1331

Query 1263  GGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCAAACCTTTGTTTGCCAA  1336
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1332  GGACTTAAGTACCTACAGTTTTGCAACTGATGGCTTCCATGCAGCTGCAAGTAGTGCGAACCTTTGTTTGCCAA  1405

Query 1337  CAGGTGTAAGAGGAGGGGTTGACTGGATGAGGAAGTTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAAGAATTATATAAC  1410
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1406  CAGGTGTGAGAGGAGGAGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCTTTTCGTTACAGAAGAGTAAAGGAATTATATAAC  1479

Query 1411  ACCTACAAGAACAACGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCCAAGAGGGATGCCTGGCTACAGTTAAGGGCAGAGAT  1484
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1480  ACCTACAAGAACAATGTTGGAGGACTCCTTGGCCCTGCTAAGAGGGATGCATGGCTGCAGTTAAGGGCAGAGAT  1553

Query 1485  TGAAGGTCTGACAGATTCCTGGCTAACAAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGCACTAGGAGTAACTGCA  1558
            .|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..
Sbjct 1554  CGAAGGCCTAACAGATTCCTGGCTAACGAATGCACTTAAGTCTTTATCAATTATTAGTACTAGGAGTAACTGTG  1627

Query 1559  TAAATGTCTTGGTAACGACAACTCAACTGATCCCAGCACTTGCGAAGGTTCTACTCTATAGTTTAGGAGGTGCT  1632
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||.||..|||||||||||
Sbjct 1628  TAAATGTCTTGGTAACGACAACCCAGCTGATTCCTGCTCTTGCAAAAGTCCTGCTCTACAGCCTAGGAGGTGCT  1701

Query 1633  TTCCCCATTGAGAATATTTACAGTGCAACTAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAACGAATAATGCAAAGGTT  1706
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1702  TTCCCCATTGAGAACATTTACAGCGCAACGAAAATAGGAAAAGAAAGTTGCTTTGAGCGAATAATGCAAAGGTT  1775

Query 1707  TGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAACAGGCAGCAAAAAAGCACAACATGC  1780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  TGGCAGAAAAGTAGTGTATGTTGTAATTGGGGATGGTGTAGAAGAAGAGCAGGCAGCAAAAAAGCACAACATGC  1849

Query 1781  CCTTCTGGAGGATATCCAGTCACTCAGACCTCCTGGCTCTCCACCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1848
            ||||.|||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  CCTTTTGGAGGATATCAAGCCACTCGGACCTCTTGGCTCTACATCAAGCACTGGAATTAGAGTATTTG  1917