Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06549
• Subject: NM_001145102.1
• Aligned Length: 1275
• Identities: 960
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  ATGTCGTCCATCCTGCCTTTCACTCCCCCGATCGTGAAGCGCCTGCTGGGCTGGAAGAAGGGCGAGCAGAACGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCAGGAGGAGAAATGGTGCGAGAAGGCGGTCAAGAGCCTGGTCAAGAAACTCAAGAAGACGGGGCAGCTGGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGCTGGAGAAGGCCATCACCACGCAGAACGTCAACACCAAGTGCATCACCATCCCCAGGTCCCTGGATGGCCGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTGCAGGTGTCCCATCGGAAGGGGCTCCCTCATGTCATCTACTGCCGCCTGTGGCGATGGCCAGACCTGCACAG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCACCACGAGCTGCGGGCCATGGAGCTGTGTGAGTTCGCCTTCAATATGAAGAAGGACGAGGTCTGCGTGAATC  370
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGGAGCTGTGTGAGTTCGCCTTCAATATGAAGAAGGACGAGGTCTGCGTGAATC  55

Query  371  CCTACCACTACCAGAGAGTAGAGACACCAGTTCTACCTCCTGTGTTGGTGCCACGCCACACAGAGATCCCGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  CCTACCACTACCAGAGAGTAGAGACACCAGTTCTACCTCCTGTGTTGGTGCCACGCCACACAGAGATCCCGGCC  129

Query  445  GAGTTCCCCCCACTGGACGACTACAGCCATTCCATCCCCGAAAACACTAACTTCCCCGCAGGCATCGAGCCCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  130  GAGTTCCCCCCACTGGACGACTACAGCCATTCCATCCCCGAAAACACTAACTTCCCCGCAGGCATCGAGCCCCA  203

Query  519  GAGCAATATTCCAGAGACCCCACCCCCTGGCTACCTGAGTGAAGATGGAGAAACCAGTGACCACCAGATGAACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  GAGCAATATTCCAGAGACCCCACCCCCTGGCTACCTGAGTGAAGATGGAGAAACCAGTGACCACCAGATGAACC  277

Query  593  ACAGCATGGACGCAGGTTCTCCAAACCTATCCCCGAATCCGATGTCCCCAGCACATAATAACTTGGACCTGCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  ACAGCATGGACGCAGGTTCTCCAAACCTATCCCCGAATCCGATGTCCCCAGCACATAATAACTTGGACCTGCAG  351

Query  667  CCAGTTACCTACTGCGAGCCGGCCTTCTGGTGCTCCATCTCCTACTACGAGCTGAACCAGCGCGTCGGGGAGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  CCAGTTACCTACTGCGAGCCGGCCTTCTGGTGCTCCATCTCCTACTACGAGCTGAACCAGCGCGTCGGGGAGAC  425

Query  741  ATTCCACGCCTCGCAGCCATCCATGACTGTGGATGGCTTCACCGACCCCTCCAATTCGGAGCGCTTCTGCCTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  ATTCCACGCCTCGCAGCCATCCATGACTGTGGATGGCTTCACCGACCCCTCCAATTCGGAGCGCTTCTGCCTAG  499

Query  815  GGCTGCTCTCCAATGTCAACAGGAATGCAGCAGTGGAGCTGACACGGAGACACATCGGAAGAGGCGTGCGGCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  GGCTGCTCTCCAATGTCAACAGGAATGCAGCAGTGGAGCTGACACGGAGACACATCGGAAGAGGCGTGCGGCTC  573

Query  889  TACTACATCGGAGGGGAGGTCTTCGCAGAGTGCCTCAGTGACAGCGCTATTTTTGTCCAGTCTCCCAACTGTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  TACTACATCGGAGGGGAGGTCTTCGCAGAGTGCCTCAGTGACAGCGCTATTTTTGTCCAGTCTCCCAACTGTAA  647

Query  963  CCAGCGCTATGGCTGGCACCCGGCCACCGTCTGCAAGATCCCACCAGGATGCAACCTGAAGATCTTCAACAACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  CCAGCGCTATGGCTGGCACCCGGCCACCGTCTGCAAGATCCCACCAGGATGCAACCTGAAGATCTTCAACAACC  721

Query 1037  AGGAGTTCGCTGCCCTCCTGGCCCAGTCGGTCAACCAGGGCTTTGAGGCTGTCTACCAGTTGACCCGAATGTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  AGGAGTTCGCTGCCCTCCTGGCCCAGTCGGTCAACCAGGGCTTTGAGGCTGTCTACCAGTTGACCCGAATGTGC  795

Query 1111  ACCATCCGCATGAGCTTCGTCAAAGGCTGGGGAGCGGAGTACAGGAGACAGACTGTGACCAGTACCCCCTGCTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  ACCATCCGCATGAGCTTCGTCAAAGGCTGGGGAGCGGAGTACAGGAGACAGACTGTGACCAGTACCCCCTGCTG  869

Query 1185  GATTGAGCTGCACCTGAATGGGCCTTTGCAGTGGCTTGACAAGGTCCTCACCCAGATGGGCTCCCCAAGCATCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  GATTGAGCTGCACCTGAATGGGCCTTTGCAGTGGCTTGACAAGGTCCTCACCCAGATGGGCTCCCCAAGCATCC  943

Query 1259  GCTGTTCCAGTGTGTCT  1275
            |||||||||||||||||
Sbjct  944  GCTGTTCCAGTGTGTCT  960