Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06619
• Subject: NM_001190794.1
• Aligned Length: 1578
• Identities: 1440
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGTCCCTGGTGGAGGCCATCAGCCTCTGGAATGAAGGGGTGCTGGCAGCGGACAAGAAGGACTGGAAGGGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCTGGTGGAGGCCATCAGCCTCTGGAATGAAGGGGTGCTGGCAGCGGACAAGAAGGACTGGAAGGGAGC  74

Query   75  CCTGGATGCCTTCAGTGCCGTCCAGGACCCCCACTCCCGGATTTGCTTCAACATTGGCTGCATGTACACTATCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGATGCCTTCAGTGCCGTCCAGGACCCCCACTCCCGGATTTGCTTCAACATTGGCTGCATGTACACTATCC  148

Query  149  TGAAGAACATGACTGAAGCAGAGAAGGCCTTTACCAGAAGCATTAACCGAGACAAGCACTTGGCAGTGGCTTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAAGAACATGACTGAAGCAGAGAAGGCCTTTACCAGAAGCATTAACCGAGACAAGCACTTGGCAGTGGCTTAC  222

Query  223  TTCCAACGAGGGATGCTCTACTACCAGACAGAGAAATATGATTTGGCTATCAAAGACCTTAAAGAAGCCTTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCCAACGAGGGATGCTCTACTACCAGACAGAGAAATATGATTTGGCTATCAAAGACCTTAAAGAAGCCTTGAT  296

Query  297  TCAGCTTCGAGGGAACCAGCTGATAGACTATAAGATCCTGGGGCTCCAGTTCAAGCTGTTTGCCTGTGAGGTGT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  297  TCAGCTTCGAGGGAACCAGCTGATAGACTATAAGATCCTGGGGCTCCAGTTCAAGCTGTTTGCCTGTGA-----  365

Query  371  TATATAACATTGCTTTCATGTATGCCAAGAAGGAGGAATGGAAAAAAGCTGAAGAACAGTTAGCATTGGCCACG  444
                                                                                      
Sbjct  366  --------------------------------------------------------------------------  365

Query  445  AGCATGAAGTCTGAGCCCAGACATTCCAAAATCGACAAGGCGATGGAGTGTGTCTGGAAGCAGAAGCTATATGA  518
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  366  --------------------------------------------------------GAAGCAGAAGCTATATGA  383

Query  519  GCCAGTGGTGATCCCTGTGGGCAGGCTGTTTCGACCAAATGAGAGACAAGTGGCTCAGCTGGCCAAGAAGGATT  592
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  GCCAGTGGTGATCCCTGTGGGCAAGCTGTTTCGACCAAATGAGAGACAAGTGGCTCAGCTGGCCAAGAAGGATT  457

Query  593  ACCTAGGCAAGGCAACGGTCGTGGCATCTGTGGTGGATCAAGACAGTTTCTCTGGGTTTGCCCCTCTGCAACCA  666
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  ACCTAGGCAAGGCGACGGTCGTGGCATCTGTGGTGGATCAAGACAGTTTCTCTGGGTTTGCCCCTCTGCAACCA  531

Query  667  CAGGCAGCTGAGCCTCCACCCAGACCGAAAACCCCAGAGATCTTCAGGGCTCTGGAAGGGGAGGCTCACCGTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  CAGGCAGCTGAGCCTCCACCCAGACCGAAAACCCCAGAGATCTTCAGGGCTCTGGAAGGGGAGGCTCACCGTGT  605

Query  741  GCTATTTGGGTTTGTGCCTGAGACAAAAGAAGAGCTCCAGGTCATGCCAGGGAACATTGTCTTTGTCTTGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  GCTATTTGGGTTTGTGCCTGAGACAAAAGAAGAGCTCCAGGTCATGCCAGGGAACATTGTCTTTGTCTTGAAGA  679

Query  815  AGGGCAATGATAACTGGGCCACGGTCATGTTCAACGGGCAGAAGGGGCTTGTTCCCTGCAACTACCTTGAACCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  AGGGCAATGATAACTGGGCCACGGTCATGTTCAACGGGCAGAAGGGGCTTGTTCCCTGCAACTACCTTGAACCA  753

Query  889  GTTGAGCTGCGGATCCACCCTCAGCAGCAGCCCCAGGAGGAAAGCTCTCCGCAGTCCGACATCCCAGCTCCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  GTTGAGCTGCGGATCCACCCTCAGCAGCAGCCCCAGGAGGAAAGCTCTCCGCAGTCCGACATCCCAGCTCCTCC  827

Query  963  TAGTTCCAAAGCCCCTGGAAGACCCCAGCTGTCACCAGGCCAGAAACAAAAAGAAGAGCCTAAGGAAGTGAAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  TAGTTCCAAAGCCCCTGGAAGACCCCAGCTGTCACCAGGCCAGAAACAAAAAGAAGAGCCTAAGGAAGTGAAGC  901

Query 1037  TCAGTGTTCCCATGCCCTACACACTCAAGGTGCACTACAAGTACACGGTAGTCATGAAGACTCAGCCCGGGCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  TCAGTGTTCCCATGCCCTACACACTCAAGGTGCACTACAAGTACACGGTAGTCATGAAGACTCAGCCCGGGCTC  975

Query 1111  CCCTACAGCCAGGTCCGGGACATGGTGTCTAAGAAACTGGAGCTCCGGCTGGAACAAACTAAGCTGAGCTATCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  976  CCCTACAGCCAGGTCCGGGACATGGTGTCTAAGAAACTGGAGCTCCGGCTGGAACACACTAAGCTGAGCTATCG  1049

Query 1185  GCCTCGGGACAGCAATGAGCTGGTGCCCCTTTCAGAAGACAGCATGAAGGATGCCTGGGGCCAGGTGAAAAACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  GCCTCGGGACAGCAATGAGCTGGTGCCCCTTTCAGAAGACAGCATGAAGGATGCCTGGGGCCAGGTGAAAAACT  1123

Query 1259  ACTGCCTGACTCTGTGGTGTGAGAACACAGTGGGTGACCAAGGCTTTCCAGATGAACCCAAGGAAAGTGAAAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  ACTGCCTGACTCTGTGGTGTGAGAACACAGTGGGTGACCAAGGCTTTCCAGATGAACCCAAGGAAAGTGAAAAA  1197

Query 1333  GCTGATGCTAATAACCAGACAACAGAACCTCAGCTTAAGAAAGGCAGCCAAGTGGAGGCACTCTTCAGTTATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  GCTGATGCTAATAACCAGACAACAGAACCTCAGCTTAAGAAAGGCAGCCAAGTGGAGGCACTCTTCAGTTATGA  1271

Query 1407  GGCTACCCAACCAGAGGACCTGGAGTTTCAGGAAGGGGATATAATCCTGGTGTTATCAAAGGTGAATGAAGAAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272  GGCTACCCAACCAGAGGACCTGGAGTTTCAGGAAGGGGATATAATCCTGGTGTTATCAAAGGTGAATGAAGAAT  1345

Query 1481  GGCTGGAAGGGGAGTGCAAAGGGAAGGTGGGCATTTTCCCCAAAGTTTTTGTTGAAGACTGCGCAACTACAGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346  GGCTGGAAGGGGAGTGCAAAGGGAAGGTGGGCATTTTCCCCAAAGTTTTTGTTGAAGACTGCGCAACTACAGAT  1419

Query 1555  TTGGAAAGCACTCGGAGAGAAGTC  1578
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420  TTGGAAAGCACTCGGAGAGAAGTC  1443