Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06818
• Subject: NM_001161440.3
• Aligned Length: 1115
• Identities: 936
• Gaps: 178

Alignment

Query    1  MAGAGGGLGVWGNLVLLGLCSWTGARAPAPNPGRNLTVETQTTSSISLSWEVPDGLDSQNSNYWVQCTGDGGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MAGAGGGLGVWGNLVLLGLCSWTGARAPAPNPGRNLTVETQTTSSISLSWEVPDGLDSQNSNYWVQCTGDGGTT  74

Query   75  ETRNTTATNVTVDGLGPGSLYTCSVWVEKDGVNSSVGTVTTATAPNPVRNLRVEAQTNSSIALTWEVPDGPDPQ  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct   75  ETRNTTATNVTVDGLGPGSLYTCSVWVEKDGVNSSVGTVTT---------------------------------  115

Query  149  NSTYGVEYTGDGGRAGTRSTAHTNITVDGLEPGCLYAFSMWVGKNGINSSRETRNATTAHNPVRNLRVEAQTTS  222
                                                                                      
Sbjct  116  --------------------------------------------------------------------------  115

Query  223  SISLSWEVPDGTDPQNSTYCVQCTGDGGRTETRNTTDTRVTVDGLGPGSLYTCSVWVEKDGVNSSVEIVTSATA  296
                                                                                   |||
Sbjct  116  -----------------------------------------------------------------------ATA  118

Query  297  PNPVRNLTVEAQTNSSIALTWEVPDGPDPQNSTYGVEYTGDGGRAGTRSTAYTNITVDRLEPGCLYVFSVWVGK  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  PNPVRNLTVEAQTNSSIALTWEVPDGPDPQNSTYGVEYTGDGGRAGTRSTAHTNITVDRLEPGCLYVFSVWVGK  192

Query  371  NGINSSRETRNATTAPNPVRNLHMETQTNSSIALCWEVPDGPYPQDYTYWVEYTGDGGGTETRNTTNTSVTAER  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193  NGINSSRETRNATTAPNPVRNLHMETQTNSSIALCWEVPDGPYPQDYTYWVEYTGDGGGTETRNTTNTSVTAER  266

Query  445  LEPGTLYTFSVWAEKNGARGSRQNVSISTVPNAVTSLSKQDWTNSTIALRWTAPQGPGQSSYSYWVSWVREGMT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  267  LEPGTLYTFSVWAEKNGARGSRQNVSISTVPNAVTSLSKQDWTNSTIALRWTAPQGPGQSSYSYWVSWVREGMT  340

Query  519  DPRTQSTSGTDITLKELEAGSLYHLTVWAERNEVRGYNSTLTAATAPNEVTDLQNETQTKNSVMLWWKAPGDPH  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  341  DPRTQSTSGTDITLKELEAGSLYHLTVWAERNEVRGYNSTLTAATAPNEVTDLQNETQTKNSVMLWWKAPGDPH  414

Query  593  SQLYVYWVQWASKGHPRRGQDPQANWVNQTSRTNETWYKVEALEPGTLYNFTVWAERNDVASSTQSLCASTYPD  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  SQLYVYWVQWASKGHPRRGQDPQANWVNQTSRTNETWYKVEALEPGTLYNFTVWAERNDVASSTQSLCASTYPD  488

Query  667  TVTITSCVSTSAGYGVNLIWSCPQGGYEAFELEVGGQRGSQDRSSCGEAVSVLGLGPARSYPATITTIWDGMKV  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  TVTITSCVSTSAGYGVNLIWSCPQGGYEAFELEVGGQRGSQDRSSCGEAVSVLGLGPARSYPATITTIWDGMKV  562

Query  741  VSHSVVCHTESAGVIAGAFVGILLFLILVGLLIFFLKRRNKKKQQKPELRDLVFSSPGDIPAEDFADHVRKNER  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  VSHSVVCHTESAGVIAGAFVGILLFLILVGLLIFFLKRRNKKKQQKPELRDLVFSSPGDIPAEDFADHVRKNER  636

Query  815  DSNCGFADEYQQLSLVGHSQSQMVASASENNAKNRYRNVLPYDWSRVPLKPIHEEPGSDYINASFMPGLWSPQE  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  DSNCGFADEYQQLSLVGHSQSQMVASASENNAKNRYRNVLPYDWSRVPLKPIHEEPGSDYINASFMPGLWSPQE  710

Query  889  FIATQGPLPQTVGDFWRLVWEQQSHTLVMLTNCMEAGRVKCEHYWPLDSQPCTHGHLRVTLVGEEVMENWTVRE  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  FIATQGPLPQTVGDFWRLVWEQQSHTLVMLTNCMEAGRVKCEHYWPLDSQPCTHGHLRVTLVGEEVMENWTVRE  784

Query  963  LLLLQVEEQKTLSVRQFHYQAWPDHGVPSSPDTLLAFWRMLRQWLDQTMEGGPPIVHCSAGVGRTGTLIALDVL  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  LLLLQVEEQKTLSVRQFHYQAWPDHGVPSSPDTLLAFWRMLRQWLDQTMEGGPPIVHCSAGVGRTGTLIALDVL  858

Query 1037  LRQLQSEGLLGPFSFVRKMRESRPLMVQTEAQYVFLHQCILRFLQQSAQAPAEKEVPYEDVENLIYENVAAIQA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  LRQLQSEGLLGPFSFVRKMRESRPLMVQTEAQYVFLHQCILRFLQQSAQAPAEKEVPYEDVENLIYENVAAIQA  932

Query 1111  HKLEV  1115
            |||||
Sbjct  933  HKLEV  937